Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_07957
Subject:
XM_006522284.1
Aligned Length:
3389
Identities:
2259
Gaps:
793

Alignment

Query    1  ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT  74
                                 |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT  53

Query   75  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   54  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA  127

Query  149  TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA  222
            ||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  128  TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG  201

Query  223  TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  202  TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA  275

Query  297  TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC  370
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct  276  TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC  349

Query  371  CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC  444
            |.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  350  CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC  423

Query  445  CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct  424  CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA  497

Query  519  AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  592
            ||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  571

Query  593  AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT  666
            |||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  572  AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT  645

Query  667  AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA  737
            |||   ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.||||||||      |||||.|||||
Sbjct  646  AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA  713

Query  738  ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA  811
            .|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct  714  GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA  787

Query  812  AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT  885
            |..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  788  AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC  861

Query  886  GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC  959
            .|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  862  ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC  935

Query  960  CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCACAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGAA  1033
            .||||||||||||||||||||.|||||                                               
Sbjct  936  AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAA-----------------------------------------------  962

Query 1034  GCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGATGTTTCAGAAACAACACTGGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT  1107
                                                          |.||||                      
Sbjct  963  ----------------------------------------------ATTGGC----------------------  968

Query 1108  GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG  1181
                                                                                      
Sbjct  969  --------------------------------------------------------------------------  968

Query 1182  CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC  1255
                                                                                      
Sbjct  969  --------------------------------------------------------------------------  968

Query 1256  CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTGTTCCTCAA  1329
                                            ||||||                                    
Sbjct  969  --------------------------------AGGGCA------------------------------------  974

Query 1330  AAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTTC  1403
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1404  TACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATTA  1477
                                          ||||                                        
Sbjct  975  ------------------------------GCCA----------------------------------------  978

Query 1478  CACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCTG  1551
                                                               ||||                   
Sbjct  979  ---------------------------------------------------GTAA-------------------  982

Query 1552  AAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCCT  1623
                                                       |.||.||||.|||||| |||| |.||  |||
Sbjct  983  -------------------------------------------CAGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CCT  1011

Query 1624  CCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGTT  1695
            ||.|||| |||||    ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|...
Sbjct 1012  CCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATACG  1080

Query 1696  ACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTCC  1769
            |||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.|||.|||.|||||||||||..|..|||.|
Sbjct 1081  ACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTACATCTGTTCCAAAAGATGAACGACTTTC  1154

Query 1770  TCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCT-------------------------------------  1806
            .|.|||||||.|.||.||||||.||||.||.|||.||                                     
Sbjct 1155  CCTTAAACCAGATCCAGAGGTCACTCACAGTGAAACTGTTCTGCCTCCTGTCACCTTTAGAGTTGAGCCACCAA  1228

Query 1807  -----------GCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCATGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGAG  1869
                       ||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..|||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1229  AGACAACAATAGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTGTGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGAG  1302

Query 1870  GAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCTTTCACAACTAAGATTCCACGAACAAC  1943
            ||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  GAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTCTTCACGACTAAGATTCCACGAACAAC  1376

Query 1944  TGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTACTGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAGC  2014
            ||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||   ||.|||||||||||||||.|.|||.||.||
Sbjct 1377  TGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCCTGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGGC  1450

Query 2015  CACACATCAGACCTG--------------------------------------------GGG------------  2032
            ||||...|||.||||                                            |||            
Sbjct 1451  CACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAACCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAAA  1524

Query 2033  -------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCTGATAGAAATGTATCAGTGGACTCTAC  2087
                               .||||||||||||.|.||||.||.||.|||..|||||||..||||||||   |.|
Sbjct 1525  AACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCTGGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TTC  1595

Query 2088  CCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACCCTTGCCACCCAGAC---------CTA  2140
            .||..||||.|.|||.|            |||||||.||.||.||||||.|.||||..||.|         |||
Sbjct 1596  ACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACCCATACCACATAGGCATTCGTCCACTA  1669

Query 2141  CACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCACTGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATCA  2206
            .|| |       ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.|||||..
Sbjct 1670  GAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCACCGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATTG  1741

Query 2207  TTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGGCCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAAT  2279
            ||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .||||..|||||..||...|.||||..
Sbjct 1742  TTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-CCCTATCGGAACAGCCACAGCGAGACC  1814

Query 2280  AGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACTGGAAAATATAACTGACTTTAGCTCAA  2353
            ||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|.|..|.||.|||||||||.||.||||
Sbjct 1815  AGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTTTGGTACTACAACTGACTTCAGTTCAA  1888

Query 2354  G-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGACCTCATGTGCGATACATCCAAAAGCC  2426
            | ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||||.||||||
Sbjct 1889  GTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGTCCCCATGTGCGATATATCCCAAAGCC  1961

Query 2427  TGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAAAGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCCA  2500
            |||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 1962  TGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTACAGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCCA  2035

Query 2501  CCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGGAAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTTG  2574
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2036  CCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCGAAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTTG  2109

Query 2575  GACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGG  2648
            |||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2110  GACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATATCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGG  2183

Query 2649  GAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGAAAATCTGAAACCAAACACGAGTTATG  2722
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.||.||.||||
Sbjct 2184  GAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGAAAACCTGAAACCAGATACAAGCTATG  2257

Query 2723  AATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCAACACAGTGGCATTCAGTACTGAATCA  2796
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||||||.||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2258  AATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCAACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATCA  2331

Query 2797  GCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAGA  2870
            ||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 2332  GCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATCTGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAGA  2405

Query 2871  CTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTATAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTGT  2944
            ||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2406  CTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTATAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTAT  2479

Query 2945  GCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAAAATTTTATAACATAGGTGATCAGAGG  3018
            |.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 2480  GTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCAAGTTTTACAACATAGGAGATCAGAGG  2553

Query 3019  GGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGACGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTGA  3092
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct 2554  GGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGTCGCACAGGACAGCAACTCACCTCTGA  2627

Query 3093  CCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTC  3166
            .||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2628  ACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACCTGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTC  2701

Query 3167  ACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTCCTGGAAAATGG  3225
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2702  ATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATACCTGGAAAATGG  2760