Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_07957
• Subject: XM_006522285.1
• Aligned Length: 3341
• Identities: 2214
• Gaps: 805

Alignment

Query    1  ATGCGAGGTGGCAAATGCAACATGCTCTCCAGTTTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTACACTAGCCCT  74
                                 |||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.||
Sbjct    1  ---------------------ATGCTCTCCAGCCTGGGGTGTCTACTTCTCTGTGGAAGTATTGCACTTGCTCT  53

Query   75  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCAAACCTCAAAGTCCACATCAATACCACAAGTGACTCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|.|||||.||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   54  GGGAAATGCACAGAAATTGCCAAAAGGTAAAAAGCCAAGCTTGAAAGTGCACATCAATACCACCAGCGACTCCA  127

Query  149  TCCTCTTGAAGTTCTTGCGTCCAAGTCCAAATGTAAAGCTTGAAGGTCTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTA  222
            ||||||||||||||.|||||||||.|.||||.||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  128  TCCTCTTGAAGTTCCTGCGTCCAAATGCAAACGTAAAGCTGGAAGGTTTTCTCCTGGGATATGGCAGCAATGTG  201

Query  223  TCACCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCGCTGAAGGGAAATTCACAGAAGCTATAGTTGATGCAGAGCCGAAATA  296
            ||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||
Sbjct  202  TCTCCAAACCAGTACTTCCCTCTTCCCACAGAAGGGAAATTCACAGAGGCTGTAGTTGATGCAGAGCCGAAGTA  275

Query  297  TCTGATAGTTGTGCGACCTGCTCCACCTCCAAGTCAAAAGAAGTCATGTTCAGGTAAAACTCGTTCTCGCAAAC  370
            |||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.||||..|||||||||
Sbjct  276  TCTGATAGTCGTACGACCTGCTCCTCCTCCCAGCCAGAAGAAGTCATGTTCAGGGAAATCTCGCCCTCGCAAAC  349

Query  371  CTCTGCAGCTGGTGGTTGGCACTCTGACACCGAGCTCAGTCTTCCTGTCCTGGGGTTTCCTCATCAACCCACAC  444
            |.||.|||||||||||.||.||..||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  350  CCCTCCAGCTGGTGGTGGGTACGTTGACACCGAGTTCTGTCTTCCTGTCCTGGGGATTCCTCATCAACCCACAC  423

Query  445  CATGACTGGACATTGCCAAGTCACTGTCCCAATGACAGATTTTATACAATTCGCTATCGAGAAAAGGATAAAGA  518
            ||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||||||
Sbjct  424  CATGACTGGACATTGCCAAGCCACTGTCCCAGTGACAGATTTTATACAATTCGATATAGAGAAAAAGATAAAGA  497

Query  519  AAAGAAGTGGATTTTTCAAATCTGTCCAGCCACTGAAACAATTGTGGAAAACCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  592
            ||||||.||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  498  AAAGAAATGGATTTTTCAACTCTGCCCAGCTACTGAAACAATTGTGGAAAATCTAAAGCCCAACACAGTTTATG  571

Query  593  AATTTGGAGTGAAAGACAATGTGGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCACAAGACTGTTGTTGGAAGT  666
            |||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  572  AATTTGGTGTGAAAGACAATATAGAAGGTGGAATTTGGAGTAAGATTTTCAATCATAAGACTATTGTTGGAAGT  645

Query  667  AAA---AAAGTAAATGGGAAAATCCAAAGTACCTATGACCAAGACCACACAGTGCCAGCATATGTCCCAAGGAA  737
            |||   ||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.||||.||||||||      |||||.|||||
Sbjct  646  AAAAACAAAGTAAACGGGAAAATCCAAAGCACTTATGACCAGGTCCACTCAGTGCCA------GTCCCGAGGAA  713

Query  738  ACTAATCCCAATAACAATCATCAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAAGGATTCAGCTAAATCCCCAGAAA  811
            .|||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||||.|.|||||||||||.|
Sbjct  714  GCTAATCCCACTAACGATCATTAAGCAAGTGATTCAGAATGTTACTCACAGGGCTTCAACCAAATCCCCAGACA  787

Query  812  AAGCTCCACTGGGAGGAGTGATACTAGTCCACCTTATTATTCCAGGTCTTAATGAAACTACTGTAAAACTTCCT  885
            |..||||..|.||.|||...|||.||||.||.||.||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.
Sbjct  788  AGACTCCTTTTGGGGGAACAATATTAGTTCATCTGATTATTCCGGGTCTTAATGAATCCACTGTAAAACTTCCC  861

Query  886  GCATCCCTAATGTTTGAGATTTCAGATGCACTCAAGACACAATTAGCTAAGAATGAAACCTTGGCATTACCTGC  959
            .|||||.|||||.||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  862  ACATCCATAATGCTTGAGATTTCCGATGCTCTCAAGGCACAATTAGCTAAGAATGAAACATTGGCTTTACCAGC  935

Query  960  CGAATCTAAAACACCAGAGGTTGAAAAAATCTCAGCACGACCCACAACAGTGACTCCTGAAACAGTTCCAAGAA  1033
            .||||||||||||||||||||.|||||                                               
Sbjct  936  AGAATCTAAAACACCAGAGGTCGAAAA-----------------------------------------------  962

Query 1034  GCACTAAACCCACTACGTCTAGTGCATTAGATGTTTCAGAAACAACACTGGCTTCAAGTGAAAAGCCATGGATT  1107
                                                          |.||||                      
Sbjct  963  ----------------------------------------------ATTGGC----------------------  968

Query 1108  GTGCCTACAGCTAAAATATCTGAAGATTCCAAAGTTCTGCAGCCTCAAACTGCAACTTATGATGTTTTCTCAAG  1181
                                                                                      
Sbjct  969  --------------------------------------------------------------------------  968

Query 1182  CCCTACAACATCAGATGAGCCTGAGATATCAGATTCCTACACAGCAACAAGTGATCGTATTCTGGATTCTATCC  1255
                                                                                      
Sbjct  969  --------------------------------------------------------------------------  968

Query 1256  CACCTAAAACTTCTAGAACTCTTGAACAGCCAAGGGCAACACTGGCTCCAAGTGAAACACCATTTGTTCCTCAA  1329
                                            ||||||                                    
Sbjct  969  --------------------------------AGGGCA------------------------------------  974

Query 1330  AAACTGGAAATCTTTACCAGTCCAGAAATGCAGCCTACGACACCTGCTCCCCAGCAAACTACATCTATCCCTTC  1403
                                                                                      
Sbjct  975  --------------------------------------------------------------------------  974

Query 1404  TACACCTAAACGACGCCCCCGGCCCAAACCGCCAAGAACCAAACCTGAAAGAACCACAAGTGCCGGAACAATTA  1477
                                          ||||                                        
Sbjct  975  ------------------------------GCCA----------------------------------------  978

Query 1478  CACCTAAAATTTCTAAAAGCCCTGAACCTACATGGACAACACCGGCTCCCGGTAAAACACAATTTATTTCTCTG  1551
                                                               ||||                   
Sbjct  979  ---------------------------------------------------GTAA-------------------  982

Query 1552  AAACCTAAAATCCCTCTCAGCCCAGAAGTGACACACACCAAACCTGCTCCCAAGCAGAC-ACCA-CGTGCTCCT  1623
                                                       |.||.||||.|||||| |||| |.||  |||
Sbjct  983  -------------------------------------------CAGCACCCAGGCAGACAACCAGCATG--CCT  1011

Query 1624  CCTAAGC-CAAAAACATCACCACGCCCAAGAATCCCA-CAAACACAACCAGTTCCTAAGGTGCCCCAGCGTGTT  1695
            ||.|||| |||||    ||||||.|.||||.||.||| |||| |.|.|||||||||||||..||||.||.|...
Sbjct 1012  CCCAAGCTCAAAA----CACCACACTCAAGGATGCCAGCAAA-AGAGCCAGTTCCTAAGGAACCCCTGCATACG  1080

Query 1696  ACTGCAAAACCAAAAACGTCACCAAGTCCAGAAGTGTCATACACCACACCTGCTCCAAAAGATGTGCTCCTTCC  1769
            |||.||||.|||||||.|.||||||||||.||||||.||.||||.||                           
Sbjct 1081  ACTTCAAAGCCAAAAATGCCACCAAGTCCTGAAGTGGCAGACACTAC---------------------------  1127

Query 1770  TCATAAACCATACCCTGAGGTCTCTCAGAGCGAACCTGCTCCTCTAGAGACACGAGGCATCCCTTTTATACCCA  1843
                                             |.||||.|||.||||||||||.|||||.|||.|.|||||..
Sbjct 1128  ---------------------------------ATCTGCACCTTTAGAGACACGGGGCATTCCTCTCATACCTG  1168

Query 1844  TGATTTCCCCAAGTCCTAGTCAAGAGGAACTACAGACCACTCTGGAAGAAACAGACCAATCCACCCAAGAACCT  1917
            |||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|..||||||||||||||||.||.||||||||.|..
Sbjct 1169  TGATTTCACCAAGACCTAGTCAAGAGGAACTACAAACCGCCATGGAAGAAACAGACCAGTCTACCCAAGAGCTC  1242

Query 1918  TTCACAACTAAGATTCCACGAACAACTGAACTAGCAAAGACAACTCAGGCGCCACACAGATTTTATA---CTAC  1988
            |||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||..|||   ||.|
Sbjct 1243  TTCACGACTAAGATTCCACGAACAACTGAATTGGCAAAGACAACTCAGGCACCACACAGATTGCATACAGCTCC  1316

Query 1989  TGTGAGGCCCAGAACATCTGACAAGCCACACATCAGACCTG---------------------------------  2029
            ||||||||||||||.|.|||.||.||||||...|||.||||                                 
Sbjct 1317  TGTGAGGCCCAGAATACCTGGCAGGCCACATGGCAGGCCTGCTCTGAACAAAACAACTACAAGGCCTGATAAAA  1390

Query 2030  -----------GGG-------------------------------TCAAGCAAGCACCCAGGCCATCAGGTGCT  2061
                       |||                               .||||||||||||.|.||||.||.||.||
Sbjct 1391  CCAAACCCAGAGGGACGTCCCATAAAAACGGAGTAGGAACAGGAACCAAGCAAGCACCTAAGCCACCAAGTCCT  1464

Query 2062  GATAGAAATGTATCAGTGGACTCTACCCACCCCACTAAAAAGC------------CAGGGACTCGCCGCCCACC  2123
            |..|||||||..||||||||   |.|.||..||||.|.|||.|            |||||||.||.||.|||||
Sbjct 1465  GGGAGAAATGCGTCAGTGGA---TTCACATGCCACAAGAAAACCAGGCTCAGTCTCAGGGACGCGTCGTCCACC  1535

Query 2124  CTTGCCACCCAGAC---------CTACACAC-------CCACGA-AGAAAACCTTTACCACCAAATAATGTCAC  2180
            |.|.||||..||.|         |||.|| |       ||| || ||||..||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1536  CATACCACATAGGCATTCGTCCACTAGAC-CTGTGTCTCCA-GAGAGAAGGCCTTTACCCCCGAATAATGTCAC  1607

Query 2181  TGGAAAGCCAGGAAGTGCAGGAATCATTTCATCAGGCCCAATAACTACACCACCCCTGAGGTCAACAC-CCAGG  2253
            .||.|||||||||.||||.|||||..||||.||..|||...||||..|.||||||||||.|.|||||| ||| .
Sbjct 1608  CGGGAAGCCAGGACGTGCGGGAATTGTTTCCTCCAGCCGGGTAACGTCCCCACCCCTGAAGGCAACACTCCA-C  1680

Query 2254  CCTACTGGAACTCCCTTGGAGAGAATAGAGACAGATATAAAGCAACCAACAGTTCCTGCCTCTGGAGAAGAACT  2327
            ||||..|||||..||...|.||||..||.|.||||...||||.|||||||.|.||||||.||.|.||||||..|
Sbjct 1681  CCTATCGGAACAGCCACAGCGAGACCAGGGGCAGAACAAAAGGAACCAACTGCTCCTGCTTCAGAAGAAGAGTT  1754

Query 2328  GGAAAATATAACTGACTTTAGCTCAAG-CCCAACAAGAGAAACTGATCCTCTTGGGAAGCCAAGATTCAAAGGA  2400
            .|..|.||.|||||||||.||.||||| ||||.||| ||||||||||||.|||||||||||.||.||||.|||.
Sbjct 1755  TGGTACTACAACTGACTTCAGTTCAAGTCCCACCAA-AGAAACTGATCCCCTTGGGAAGCCCAGGTTCATAGGT  1827

Query 2401  CCTCATGTGCGATACATCCAAAAGCCTGACAACAGTCCCTGCTCCATTACTGACTCTGTCAAACGGTTCCCCAA  2474
            ||.|||||||||||.||||.|||||||||.||||..|||||.|||||.||||||||.||||.|||||||||.|.
Sbjct 1828  CCCCATGTGCGATATATCCCAAAGCCTGAAAACAAGCCCTGTTCCATCACTGACTCAGTCAGACGGTTCCCTAC  1901

Query 2475  AGAGGAGGCCACAGAGGGGAATGCCACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACCGTGG  2548
            ||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1902  AGAGGAAGCCACGGAGGGGAATGCCACCAGCCCACCACAGAACCCACCCACCAACCTCACTGTGGTCACTGTCG  1975

Query 2549  AAGGGTGCCCCTCATTTGTCATCTTGGACTGGGAAAAGCCACTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTTATA  2622
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1976  AAGGCTGCCCCTCATTTGTCATCTTGGACTGGGAAAAACCTCTAAATGACACTGTCACTGAATATGAAGTCATA  2049

Query 2623  TCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGGGAAGAACAAGTCCATTCAAATGACAAATCAGACATTTTCCACAGTAGA  2696
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2050  TCCAGAGAAAATGGGTCATTCAGTGGGAAGAACAAGTCCATTCAAATTACCAATCAAACGTTCTCTACAGTAGA  2123

Query 2697  AAATCTGAAACCAAACACGAGTTATGAATTCCAGGTGAAACCCAAAAACCCGCTTGGTGAAGGCCCGGTCAGCA  2770
            |||.|||||||||.|.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|.|||||
Sbjct 2124  AAACCTGAAACCAGATACAAGCTATGAATTCCAGGTGAAACCCAAAAATCCACTTGGTGAGGGCCCCGCCAGCA  2197

Query 2771  ACACAGTGGCATTCAGTACTGAATCAGCGGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAGTTTCTGCAGGAAGAGATGCCATC  2844
            ||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 2198  ACACGGTAGCGTTCAGTACTGAATCAGCTGACCCAAGAGTGAGTGAGCCAATTTCTGCAGGAAGAGATGCCATC  2271

Query 2845  TGGACTGAAAGACCCTTTAATTCAGACTCTTACTCAGAGTGTAAGGGCAAACAATATGTCAAAAGGACATGGTA  2918
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 2272  TGGACTGAAAGACCTTTTAACTCAGACTCTTACTCAGAATGCAAAGGCAAACAGTATGTTAAAAGGACGTGGTA  2345

Query 2919  TAAAAAATTTGTAGGAGTGCAGCTGTGCAACTCTCTCAGATACAAGATTTACTTGAGCGACTCCCTCACAGGAA  2992
            ||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2346  TAAAAAATTTGTCGGAGTGCAGCTATGTAACTCTCTCAGATACAAGATTTATTTGAGCGATTCCCTCACAGGCA  2419

Query 2993  AATTTTATAACATAGGTGATCAGAGGGGCCATGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGA  3066
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2420  AGTTTTACAACATAGGAGATCAGAGGGGCCACGGAGAAGATCACTGCCAGTTTGTGGATTCATTTTTAGATGGT  2493

Query 3067  CGCACTGGGCAGCAACTCACTTCTGACCAGTTACCAATCAAAGAAGGTTATTTCAGAGCAGTTCGCCAGGAACC  3140
            |||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|.|||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2494  CGCACAGGACAGCAACTCACCTCTGAACAGTTACCCACCAAAGAAGGCTATTTCAGAGCTGTTCGTCAGGAACC  2567

Query 3141  TGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTCACACCCAAATCAATTATGTTCAGTGGTATGAATGTGGGACTACAATTC  3214
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 2568  TGTCCAATTTGGAGAAATAGGTGGTCATACCCAAATCAATTATGTCCAGTGGTATGAATGTGGGACCACAATAC  2641

Query 3215  CTGGAAAATGG  3225
            |||||||||||
Sbjct 2642  CTGGAAAATGG  2652