Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07977
- Subject:
- XM_017010714.2
- Aligned Length:
- 1839
- Identities:
- 1733
- Gaps:
- 105
Alignment
Query 1 ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTGCTGCTGGCCGCTGCTCCTGCTGTGGGGGCTGCTCCCCGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAACCTA 74
Query 75 TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCCGCACCGGACCCTCCTGGACTCGGAGGGCAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGATCGCCT 148
Query 149 TCCGCCTCCAGGTGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTCGGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATGGCGTCCGCCGAC 222
||||
Sbjct 149 TCCG---------------------------------------------------------------------- 152
Query 223 ATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGGCCCTACCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 153 -----------------------------------CCTCCAGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAA 191
Query 297 AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 192 AAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCA 265
Query 371 GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266 GAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCAC 339
Query 445 CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 340 CATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAA 413
Query 519 TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 414 TCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAA 487
Query 593 ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 488 ACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTT 561
Query 667 GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562 GAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAA 635
Query 741 CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 636 CGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTG 709
Query 815 TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 710 TGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCA 783
Query 889 TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 784 TTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTC 857
Query 963 TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 858 TGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGA 931
Query 1037 GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 932 GCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAA 1005
Query 1111 GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1006 GAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAG 1079
Query 1185 AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1080 AGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCA 1153
Query 1259 ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1154 ATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGC 1227
Query 1333 TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1228 TACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCT 1301
Query 1407 TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1302 TCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTG 1375
Query 1481 GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1376 GGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTT 1449
Query 1555 TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACGAGCTGGTCCTCAG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1450 TCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAG 1523
Query 1629 CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1524 CCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTC 1597
Query 1703 CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1598 CAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGAT 1671
Query 1777 TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG 1839
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672 TTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG 1734