Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_07990
- Subject:
- NM_001033520.1
- Aligned Length:
- 1320
- Identities:
- 1134
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 ATGAACCTGGCGAGCCAGAGCGGGGAGGCCGGCGCCGGCCAGCTGCTCTTCGCCAACTTCAACCAGGACAACAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GTCCCTAGCTGTTGGTAGTAAGTCCGGTTATAAATTTTTC-----------TCCCTTTCTTCTGTGGATAAGCT 137
.|.||| ||||||
Sbjct 1 ----------------------------------ATGTTCACGCATGTACTTCCCTT----------------- 23
Query 138 GGAACAGATCTATGAATGCA-CCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTG 210
|.|||.|.|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 ----------TGTGATTTCAGCCGATACGGAAGATGTGTGCATTGTAGAGAGATTGTTCTCCAGCAGCCTAGTG 87
Query 211 GCCATCGTGAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTA 284
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 88 GCCATCGTCAGCCTTAAAGCACCAAGGAAGCTAAAGGTTTGCCACTTTAAGAAGGGAACTGAGATCTGCAACTA 161
Query 285 CAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGT 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 162 CAGCTACTCCAACACGATTCTGGCTGTGAAGCTCAACAGGCAGAGGCTGATAGTATGCCTGGAGGAGTCCCTGT 235
Query 359 ACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGT 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 236 ACATCCACAACATTCGGGACATGAAGGTGCTGCATACGATCAGGGAGACGCCTCCAAACCCTGCAGGCCTGTGT 309
Query 433 GCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTT 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 310 GCGCTGTCAATCAACAACGACAACTGCTACTTGGCGTACCCAGGGAGCGCGACCATCGGAGAGGTGCAGGTCTT 383
Query 507 CGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACG 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 CGATACCATTAATTTGAGAGCTGCAAACATGATTCCGGCTCACGACAGTCCTTTAGCGGCACTGGCCTTTGACG 457
Query 581 CAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAA 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 CAAGTGGAACTAAACTTGCCACGGCTTCGGAGAAGGGGACCGTGATTAGGGTATTTTCCATTCCAGAAGGACAA 531
Query 655 AAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCAT 728
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 AAACTCTTTGAGTTTCGGAGAGGAGTAAAGAGGTGCGTGAGCATCTGCTCCCTGGCCTTCAGCATGGACGGCAT 605
Query 729 GTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAG 802
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 GTTCCTCTCCGCCTCCAGCAACACTGAGACCGTGCACATCTTCAAACTCGAGACTGTGAAAGAAAAACCCCCAG 679
Query 803 AGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTG 876
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 680 AGGAGCCCACCACCTGGACCGGGTACTTCGGGAAAGTGCTCATGGCCTCCACCAGCTACCTGCCTTCCCAAGTG 753
Query 877 ACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTC 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 754 ACAGAAATGTTCAACCAGGGCAGAGCCTTCGCCACGGTCCGCCTGCCATTCTGCGGCCACAAAAACATCTGCTC 827
Query 951 GCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGG 1024
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 828 GCTAGCCACAATTCAGAAGATCCCGCGGTTGTTGGTGGGTGCCGCCGACGGGTACCTGTACATGTACAACCTGG 901
Query 1025 ACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAG 1098
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 902 ACCCCCAGGAGGGCGGCGAGTGTGCCCTGATGAAGCAGCACCGGCTGGACGGCAGTCTGGAAACGACCAATGAG 975
Query 1099 ATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAAGGTACTTA 1172
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 976 ATCTTGGACTCTGCCTCTCACGACTGCCCCTTAGTCACTCAGACATACGGCGCAGCTGCAGGAAAA-------- 1041
Query 1173 CGTGCCTTCATCCCCAACGAGACTTGCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACG 1246
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1042 -------------------------GCCTACACAGACGACCTGGGTGCTGTGGGTGGCGCCTGCCTGGAGGACG 1090
Query 1247 AGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC 1308
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1091 AGGCCAGCGCCCTGCGCCTGGATGAGGACAGCGAGCACCCGCCCATGATTCTTCGGACTGAC 1152