Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08004
• Subject: XM_011513832.2
• Aligned Length: 2073
• Identities: 1906
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGGCGCCCTTTCCTGAAGAAGTGGACGTCTTCACCGCCCCACACTGGCGGATGAAGCAGCTGGTGGGGCTCTA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTGCGACAAGCTTTCTAAAACCAATTTTTCCAACAACAACGATTTCCGTGCTCTTCTGCAGTCTTTGTATGCTA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CTTTCACGGAGTTCAAAATGCATGAGCAGATTGAAAATGAATACATTATTGGTTTGCTTCAACAACGCAGCCAG  222
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------ATGCATGAGCAGATTGAAAATGAATACATTATTGGTTTGCTTCAACAACGCAGCCAG  57

Query  223  ACCATTTATAATGTACATTCTGACAATAAACTCTCCGAGATGCTTAGCCTCTTTGAAAAGGGACTGAAGAATGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   58  ACCATTTATAATGTACATTCTGACAATAAACTCTCCGAGATGCTTAGCCTCTTTGAAAAGGGACTGAAGAATGT  131

Query  297  TAAGAATGAATATGAGCAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  TAAGAATGAATATGAACAGTTAAATTATGCAAAACAACTGAAAGAGAGATTGGAGGCTTTTACAAGAGATTTTC  205

Query  371  TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  TTCCTCACATGAAAGAGGAAGAGGAGGTTTTTCAGCCCATGTTAATGGAATATTTTACCTATGAAGAGCTTAAG  279

Query  445  GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  280  GATATTAAAAAGAAAGTGATTGCACAACACTGCTCTCAGAAGGATACTGCAGAACTCCTTAGAGGTCTTAGCCT  353

Query  519  ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354  ATGGAATCATGCTGAAGAGCGACAGAAGTTTTTTAAATATTCCGTGGATGAAAAGTCAGATAAAGAAGCAGAAG  427

Query  593  TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  TGTCAGAACACTCCACAGGTATAACCCATCTTCCTCCTGAGGTAATGCTGTCAATTTTCAGCTATCTTAATCCT  501

Query  667  CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGAGATCGCTTTGGAAACA  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  502  CAAGAGTTATGTCGATGCAGTCAAGTAAGCATGAAATGGTCTCAGCTGACAAAAACGGGATCGCTTTGGAAACA  575

Query  741  TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  TCTTTACCCTGTTCATTGGGCCAGAGGTGACTGGTATAGTGGTCCCGCAACTGAACTTGATACTGAACCTGATG  649

Query  815  ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  650  ATGAATGGGTGAAAAATAGGAAAGATGAAAGTCGTGCTTTTCATGAGTGGGATGAAGATGCTGACATTGATGAA  723

Query  889  TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  724  TCTGAAGAGTCTGCGGAGGAATCAATTGCTATCAGCATTGCACAAATGGAAAAACGTTTACTCCATGGCTTAAT  797

Query  963  TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  798  TCATAACGTTCTACCATATGTTGGTACTTCTGTAAAAACCTTAGTATTAGCATACAGCTCTGCAGTTTCCAGCA  871

Query 1037  AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  AAATGGTTAGGCAGATTTTAGAGCTTTGTCCTAACCTGGAGCATCTGGATCTTACCCAGACTGACATTTCAGAT  945

Query 1111  TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  946  TCTGCATTTGACAGTTGGTCTTGGCTTGGTTGCTGCCAGAGTCTTCGGCATCTTGATCTGTCTGGTTGTGAGAA  1019

Query 1185  AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020  AATCACAGATGTGGCCCTAGAGAAGATTTCCAGAGCTCTTGGAATTCTGACATCTCATCAAAGTGGCTTTTTGA  1093

Query 1259  AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  AAACATCTACAAGCAAAATTACTTCAACTGCGTGGAAAAATAAAGACATTACCATGCAGTCCACCAAGCAGTAT  1167

Query 1333  GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  GCCTGTTTGCACGATTTAACTAACAAGGGCATTGGAGAAGAAATAGATAATGAACACCCCTGGACTAAGCCTGT  1241

Query 1407  TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242  TTCTTCTGAGAATTTCACTTCTCCTTATGTGTGGATGTTAGATGCTGAAGATTTGGCTGATATTGAAGATACTG  1315

Query 1481  TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316  TGGAATGGAGACATAGAAATGTTGAAAGTCTTTGTGTAATGGAAACAGCATCCAACTTTAGTTGTTCCACCTCT  1389

Query 1555  GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  GGTTGTTTTAGTAAGGACATTGTTGGACTAAGGACTAGTGTCTGTTGGCAGCAGCATTGTGCTTCTCCAGCCTT  1463

Query 1629  TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464  TGCGTATTGTGGTCACTCATTTTGTTGTACAGGAACAGCTTTAAGAACTATGTCATCACTCCCAGAATCTTCTG  1537

Query 1703  CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538  CAATGTGTAGAAAAGCAGCAAGGACTAGATTGCCTAGGGGAAAAGACTTAATTTACTTTGGGAGTGAAAAATCT  1611

Query 1777  GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  GATCAAGAGACTGGACGTGTACTTCTGTTTCTCAGTTTATCTGGATGTTATCAGATCACAGACCATGGTCTCAG  1685

Query 1851  GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686  GGTTTTGACTCTGGGAGGAGGGCTGCCTTATTTGGAGCACCTTAATCTCTCTGGTTGTCTTACTATAACTGGTG  1759

Query 1925  CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760  CAGGCCTGCAGGATTTGGTTTCAGCATGTCCTTCTCTGAATGATGAATACTTTTACTACTGTGACAACATTAAC  1833

Query 1999  GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834  GGTCCTCATGCTGATACCGCCAGTGGATGCCAGAATTTGCAGTGTGGTTTTCGAGCCTGCTGCCGCTCTGGCGA  1907

Query 2073  A  2073
            |
Sbjct 1908  A  1908