Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08009
• Subject: NM_028049.2
• Aligned Length: 1214
• Identities: 1070
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGAGCCGGTAGGCTGCTGCGGCGAGTGCCGCGGCTCCTCCGT----AGACCCGCGGAGCACCTTCGTGTTGA  70
            ||||||||||.||||.||.|.||||      |||.||||||| |    |||.|||||.|||||||.||||.|||
Sbjct    1  ATGGAGCCGGCAGGCGGCGGTGGCG------GCGTCTCCTCC-TCCACAGATCCGCGAAGCACCTACGTGCTGA  67

Query   71  GTAACCTGGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGCTCACCTTCCTGCCCGCCAAGGCGTTGCTGCGGGTGGCCTGCGTG  144
            |||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.|||.|.||.
Sbjct   68  GTAACCTTGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGTTTACCTTCCTGCCGGCCAAAGCGCTGCTTCGGGTAGCCGGAGTA  141

Query  145  TGCCGCTTATGGAGGGAGTGTGTGCGCAGAGTATTGCGGACCCATCGGAGCGTAACCTGGATCTCCGCAGGCCT  218
            ||||||.|.||||||||||||||.||||||||..|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||..|
Sbjct  142  TGCCGCCTGTGGAGGGAGTGTGTACGCAGAGTGCTGCGGACCCATCGCAGCGTGACCTGGATCTCCGCGGGTGT  215

Query  219  GGCGGAGGCCGGCCACCTGGAGGGGCATTGCTTGGTTCGCGTGGTAGCAGAGGAGCTTGAGAATGTTCGCATCT  292
            |||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||.||||
Sbjct  216  GGCTGAAGCGGGCCACCTGGAGGGACATTGCTTGGTGCGCGTGGTAGCTGAGGCGCTTGAGAATGTTCGAATCT  289

Query  293  TACCACATACAGTTCTTTACATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGA  366
            |||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  290  TACCACAGACAGTTCTCTACATGGCAGATTCTGAAACTTTCATCAGCCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAAAGA  363

Query  367  GCAAGGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGG  440
            ||.|||||.|||||||.||||||.||||||..||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct  364  GCGAGGAAGAGAACTACTATGGAGACAGCATGTGCCCTGGAGAAGCTTTTCCCCAAGCAGTGCCAAGTCCTTGG  437

Query  441  GATTGTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAG  514
            ||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  438  GATTGTGACCCCGGGAATTGTGGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAG  511

Query  515  AATCTGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGA-TCC  587
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||| |||
Sbjct  512  AATCTGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATTCAACCCTTTCATTTTATTAAGGACTCC  585

Query  588  AAAGAATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCC  661
             ||||||||||||.|.||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  586  -AAGAATTTAACACTCGAAAGACACCAGCTTACTGAAGTAGGTCTTCTGGACAACCCTGAACTTCGTGTGGTCC  658

Query  662  TTGTCTTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGAT  735
            ||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|..|||||||||||||||||.|||
Sbjct  659  TTGTCTTTGGCTATAACTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTACCTGCATCGGGTAGTCAGCACTTTCAGCGAT  732

Query  736  ATGAATATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATAT  809
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||.||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  733  ATGAATATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAATTTGTCTTCACTTACTTGTGAGAAGAACCCTCTGGATAT  806

Query  810  TGATGCCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGG  883
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||..||||
Sbjct  807  TGATGCCACAGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGGCACCGAATCCAGAGTGCCACAGTTCTCCTCACTGAGG  880

Query  884  ACGTCAGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACC  957
            |.||.|.|||||..|||||.|..||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct  881  ATGTAAATGATGCCAAGACCGTCGAGGCTGCTATGCAGCGCCTCAAAGCAGCCAACATCCCTGAACAGAACACC  954

Query  958  ATTGGCTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGC  1031
            |||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  955  ATTGGCTTCATGTTTGCATGCGTTGGCCGAGGCTTTCAGTACTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAAGCTGATGC  1028

Query 1032  ATTTAGAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAG  1105
            ||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1029  ATTTAGAAAGTTCTTTCCCAGTGTCCCCTTATTTGGCTTCTTTGGAAATGGGGAGATTGGCTGCGACCGGATAG  1102

Query 1106  TCACTGGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATA  1179
            |||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||.
Sbjct 1103  TCACTGGGAACTTTATACTGAGGAGATGTAATGAGGTAAAGGAAGAGGACCTGTTCCATAGCTACACAACCATC  1176

Query 1180  ATGGCACTCATACATCTGGGGTCATTTAAA  1209
            |||||.|||.|.||.|||||..|.|.||||
Sbjct 1177  ATGGCTCTCGTTCACCTGGGAACCTCTAAA  1206