Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08009
- Subject:
- XM_011521447.3
- Aligned Length:
- 1209
- Identities:
- 896
- Gaps:
- 312
Alignment
Query 1 ATGGAGCCGGTAGGCTGCTGCGGCGAGTGCCGCGGCTCCTCCGTAGACCCGCGGAGCACCTTCGTGTTGAGTAA 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCTGGCGGAGGTGGTGGAGCGTGTGCTCACCTTCCTGCCCGCCAAGGCGTTGCTGCGGGTGGCCTGCGTGTGCC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GCTTATGGAGGGAGTGTGTGCGCAGAGTATTGCGGACCCATCGGAGCGTAACCTGGATCTCCGCAGGCCTGGCG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGGCCGGCCACCTGGAGGGGCATTGCTTGGTTCGCGTGGTAGCAGAGGAGCTTGAGAATGTTCGCATCTTACC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 ACATACAGTTCTTTACATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGAGCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------ATGGCTGATTCAGAAACTTTCATTAGTCTGGAAGAGTGTCGTGGCCATAAGAGAGCAA 58
Query 371 GGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGGGATT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 59 GGAAAAGAACTAGTATGGAAACAGCACTTGCCCTTGAGAAGCTATTCCCCAAACAATGCCAAGTCCTTGGGATT 132
Query 445 GTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAGAATC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 133 GTGACCCCAGGAATTGTAGTGACTCCAATGGGATCAGGTAGCAATCGACCTCAGGAAATAGAAATTGGAGAATC 206
Query 519 TGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGATCCAAAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 207 TGGTTTTGCTTTATTATTCCCTCAAATTGAAGGAATAAAAATACAACCCTTTCATTTTATTAAGGATCCAAAGA 280
Query 593 ATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCCTTGTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 281 ATTTAACATTAGAAAGACATCAACTCACTGAAGTAGGTCTTTTAGATAACCCTGAACTTCGTGTGGTCCTTGTC 354
Query 667 TTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGATATGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 355 TTTGGTTATAATTGCTGTAAGGTGGGAGCCAGTAATTATCTGCAGCAAGTAGTCAGCACTTTCAGTGATATGAA 428
Query 741 TATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATATTGATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 429 TATCATCTTGGCTGGAGGCCAGGTGGACAACCTGTCATCACTGACTTCTGAAAAGAACCCTCTGGATATTGATG 502
Query 815 CCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGGACGTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 503 CCTCGGGTGTGGTTGGACTGTCATTTAGTGGACACCGAATCCAGAGTGCCACTGTGCTCCTCAACGAGGACGTC 576
Query 889 AGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACCATTGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 577 AGTGATGAGAAGACTGCTGAGGCTGCGATGCAGCGCCTCAAAGCGGCCAACATTCCAGAGCATAACACCATTGG 650
Query 963 CTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGCATTTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 651 CTTCATGTTTGCATGCGTTGGCAGGGGCTTTCAGTATTACAGAGCCAAGGGGAATGTTGAGGCTGATGCATTTA 724
Query 1037 GAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAGTCACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 725 GAAAGTTTTTTCCTAGTGTTCCCTTATTCGGCTTCTTTGGAAATGGAGAAATTGGATGTGATCGGATAGTCACT 798
Query 1111 GGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATAATGGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 799 GGGAACTTTATATTGAGGAAATGTAATGAGGTAAAAGATGATGATCTGTTTCATAGCTATACAACAATAATGGC 872
Query 1185 ACTCATACATCTGGGGTCATTTAAA 1209
||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 873 ACTCATACATCTGGGGTCATCTAAA 897