Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08019
• Subject: NM_012336.4
• Aligned Length: 1506
• Identities: 1367
• Gaps: 138

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74

Query   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT  148

Query  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG  222

Query  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG  296

Query  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT  370

Query  371  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA  444

Query  445  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC  518

Query  519  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC  592

Query  593  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC  666

Query  667  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC  740

Query  741  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACACCTGTGATCACAGCTACTC  814
            |||||||||||||||||||||||||||                                               
Sbjct  741  CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATC-----------------------------------------------  767

Query  815  GGGAGGCTGCGGCAAGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGCGAGACAAGATTGCACCACTGGAC  888
                                                                                      
Sbjct  768  --------------------------------------------------------------------------  767

Query  889  TCCAGCCTGGGCGGCGGAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT  962
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  -----------------AGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT  824

Query  963  CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  825  CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG  898

Query 1037  CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  899  CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA  972

Query 1111  AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT  1046

Query 1185  TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT  1120

Query 1259  GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1121  GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG  1194

Query 1333  CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195  CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA  1268

Query 1407  GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCAAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1269  GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG  1342

Query 1481  GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1506
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1343  GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1368