Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08019
• Subject: NM_026272.3
• Aligned Length: 1527
• Identities: 1144
• Gaps: 162

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGT----  70
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||||||||||    
Sbjct    1  ATGAAGTGTGAGCACTGCACACGAAAGGAATGTAGTAAAAAATCAAAAACTGATGACCAGGAGAATGTGTCCAG  74

Query   71  ----------CAGC----CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGG  130
                      ||||    |||||...|.||.||||||.||||.|.||.||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct   75  TGATGGGGCCCAGCCAAGCGATGGGGCCAGCCCAGCCAAGGAGAGTGAAGAGAAGGGAGAGTTCCATAAATTGG  148

Query  131  CTGATGCCAAGATATTTTTGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTT  204
            |||||||.||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||||.||||||..||||||||.|||||.|||
Sbjct  149  CTGATGCAAAAATATTTCTGAGTGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTGTGACTGTGGAGGAAGGTGTCCAGCTT  222

Query  205  TCCCAGCAAAATGCCAAGGACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGT  278
            ||.|||||.|.|||||||||||||.|.|..||.|||||.|||||.||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  223  TCTCAGCAGAGTGCCAAGGACTTCCTTCATGTCCTGAATCTTAATAAGAGATGTGATACCTCAAAGCACAGAGT  296

Query  279  GCTGGTAGTGTCTGTGTGTCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCAT  352
            .|||||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  297  TCTGGTTGTGTCTGTGTGTCCTCAGTCTCTACCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTCACTGATGCAT  370

Query  353  CCAGAAGACTCTGTGGTTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTT  426
            |.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||.
Sbjct  371  CTAGAAGGCTGTGTGGCTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTCGACACCACAATCGCTGCAGATTTC  444

Query  427  AGTATCCTGGAGAGTCAAAAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCAT  500
            ||.||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||.|||.|||||||||||..|.||....||||||||
Sbjct  445  AGCATTCTGGAGAGTCAGAAGGAGTTTGTACGCCGGTATCACCAACACAGTGAGGAACAGCGTGAACTGCCCAT  518

Query  501  GCTGACCTCTGCCTGTCCTGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCC--ACCT  572
            |.|||||||||||||||||||.||||||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||  .|||  |.||
Sbjct  519  GTTGACCTCTGCCTGTCCTGGTTGGGTCAGATATGCTGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCA--TCCCATATCT  590

Query  573  CTGCACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGT  646
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct  591  CTGTACCGCCAAGTCCCCCCAGCAGGTCATGGGCTCCTTGGTGAAGGATTACTTTGCCAGGCAGCAGAATCTGT  664

Query  647  CTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTT  720
            ||||||||||.||.|||||.||..|.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||..||..|.|||
Sbjct  665  CTCCAGAGAAAATCTTCCATGTTGTCGTGGCTCCTTGCTATGATAAGAAGCTGGAAGCTCTTCGAGAGGGACTT  738

Query  721  CCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCAC  794
            .||.||.||||..||||..|.||||||.|||||||.|||.|.|||||                           
Sbjct  739  TCCACTACTTTAAATGGTGCTCGGGGCACTGACTGTGTGCTGACATC---------------------------  785

Query  795  ACCTGTGATCACAGCTACTCGGGAGGCTGCGGCAAGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGCGAG  868
                                                                                      
Sbjct  786  --------------------------------------------------------------------------  785

Query  869  ACAAGATTGCACCACTGGACTCCAGCCTGGGCGGCGGAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTC  942
                                                 |||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct  786  -------------------------------------AGGTGAAATTGCTCAGATAATGGAGCAAAGTGACCTC  822

Query  943  TCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGC  1016
            ||.||||.|||...|||.||.||.|||.|||||||||||.|||||||||....|||...||||||||||||||.
Sbjct  823  TCTGTGAAAGACATTGCTGTGGATACTTTGTTTGGAGACATGAAGGAGGTGGCAGTCCAGCGTCATGATGGAGT  896

Query 1017  CAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGG  1090
            .||.|||||.|||||.|||||.|||.|.||||||||.||.||||||||||||||...||||.|.|||||||||.
Sbjct  897  GAGTTCAGATGGGCATCTGGCTCACGTTTTCAGACACGCAGCCAAGGAGCTGTTTGGCGAGCACGTGGAGGAGA  970

Query 1091  TCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGC  1164
            ||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||..|..|.|||
Sbjct  971  TCACCTACCGTGCACTCAGGAACAAAGACTTCCATGAGGTTACCCTTGAGAAGAACGGGGAGGTCCTACTGCGC  1044

Query 1165  TTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCA  1238
            |||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||.|||||||||||..||||||.|||
Sbjct 1045  TTTGCTGCAGCGTACGGCTTTCGCAACATTCAGAACATGATCCAGAAGCTCAAGAAGGGCAAACTCCCATACCA  1118

Query 1239  CTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATG  1312
            ||||||||||||.|||||.|||.|..||||.|||||||||||||||||||||||.|||||....|||||.||..
Sbjct 1119  CTTTGTGGAGGTGCTCGCGTGTCCCAGAGGTTGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCACAGACAGAGGACGGCCACA  1192

Query 1313  CGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCA  1386
            |.|||...||.|||||||.|||.||||||||.||.|||.|.|.||||||||||||||..||.|||..||||.||
Sbjct 1193  CAGATCGTGCACTGCTGCAGCAAATGGAAGGGATCTACTCCGGCATCCCTGTGCGGCCCCCAGAGAGCAGTACA  1266

Query 1387  CACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGA-TCAACTCCCCCAAGGCCCAAGAGGTGCTGCATACCA  1459
            ||.|||||||||.||||||||||||||||||||||.| |.|| ||.|||||.|.|||.|||||||||||.||||
Sbjct 1267  CATGTGCAGGAGTTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGTACTGAA-TCTCCCAAAGTCCAGGAGGTGCTGCACACCA  1339

Query 1460  CGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1506
            ..|||||||||..|||||...|||||.||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1340  GCTACCAGAGCTTGGAGCCCTGCACAGACGGCCTGGATATCAAGTGG  1386