Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08019
- Subject:
- XM_006722278.4
- Aligned Length:
- 1506
- Identities:
- 1232
- Gaps:
- 273
Alignment
Query 1 ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGTGTGAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC 74
Query 75 CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAGGGAGAATTCCACAAGTTGGCTGATGCCAAGATATTTT 148
Query 149 TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TGAGCGACTGCCTGGCATGTGACAGCTGTATGACTGCAGAGGAAGGAGTCCAACTTTCCCAGCAAAATGCCAAG 222
Query 223 GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GACTTCTTCCGCGTTCTGAACCTTAACAAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTGTGTG 296
Query 297 TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGTGGTT 370
Query 371 TCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAGTCAA 444
|||||||||||||
Sbjct 371 TCCTCAAAAGTCT------------------------------------------------------------- 383
Query 445 AAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCTGTCC 518
Sbjct 384 -------------------------------------------------------------------------- 383
Query 519 TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 384 TGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGGTGCTGGGTCGCCCCATCACTGCCCACCTCTGCACCGCCAAGTCCCCCC 457
Query 593 AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 458 AGCAGGTCATGGGCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCGCCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCAC 531
Query 667 GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 532 GTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAGGCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTC 605
Query 741 CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGCACACCTGTGATCACAGCTACTC 814
|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 606 CCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATC----------------------------------------------- 632
Query 815 GGGAGGCTGCGGCAAGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTACAGCGAGACAAGATTGCACCACTGGAC 888
Sbjct 633 -------------------------------------------------------------------------- 632
Query 889 TCCAGCCTGGGCGGCGGAGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT 962
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 -----------------AGGTGAAATTGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGT 689
Query 963 CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 CGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGGAGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGG 763
Query 1037 CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 CACACATCTTCAGACATGCGGCCAAGGAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGA 837
Query 1111 AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 838 AACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCTTGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTT 911
Query 1185 TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 TCGAAACATCCAGAACATGATCCTGAAGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCT 985
Query 1259 GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 GTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGAGGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGG 1059
Query 1333 CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 CAGATGGAAGGCATTTACGCTGACATCCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCA 1133
Query 1407 GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCAAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG 1480
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 GGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCCCCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTG 1207
Query 1481 GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG 1506
||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 GCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG 1233