Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08038
• Subject: XM_006515227.3
• Aligned Length: 1710
• Identities: 1418
• Gaps: 168

Alignment

Query    1  ------------------------------ATGGTGTGGGAAGTGAAGACAAATCAGATGCCTAATGCAGTACA  44
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACGGGTTTGTCGGAGCACCATAACATGGTGTGGGAAGTGAAGACAAATCAGATGCCTAATGCAGTACA  74

Query   45  GAAACTCCTGTTGGTGATGGACAAGAGAGCCTCAGGAATGAATGACTCATTGGAGTTGCTGCAGTGTAATGAGA  118
            ||||||||||.|||||||||||||||||||..||||.||||.||||||..||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAACTCCTGCTGGTGATGGACAAGAGAGCACCAGGGATGAGTGACTCGCTGGAGTTGCTGCAGTGTAATGAGA  148

Query  119  ATTTGCCATCTTCACCTGGATATAACTCCTGTGATGAACACATGGAGCTTGATGACCTTCCTGAACTTCAGGCA  192
            ||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  ATTTGCCATCCTCTCCAGGATACAACTCCTGTGATGAGCACATGGAGCTTGATGACCTTCCTGAACTTCAGGCT  222

Query  193  GTTCAAAGTGATCCTACCCAATCTGGCATGTACCAGCTGAGTTCAGATGTTTCACATCAAGAATACCCAAGATC  266
            |||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GTTCAAAGTGACCCTACCCAATCTGCCATATACCAGCTAAGTTCAGATGTATCTCATCAAGAATATCCAAGATC  296

Query  267  ATCTTGGAACCAAAATACCTCAGACATACCAGAAACTACTTACCGTGAAAATGAGGTGGACTGGCTAACAGAAT  340
            ||||||||.|||.|||||||||||.|||||.||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  ATCTTGGAGCCAGAATACCTCAGATATACCGGAAAATACTCACCGTGAAGATGAGGTGGACTGGCTAACAGAGT  370

Query  341  TGGCAAATATCGCGACCAGTCCACAAAGTCCACTGATGCAGTGCTCATTTTACAATAGATCATCTCCTGTACAC  414
            |.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  TAGCAAATATTGCCACTAGTCCACAAAGTCCCCTGATGCAGTGCTCATTTTATAACAGATCATCTCCTGTACAC  444

Query  415  ATCATAGCCACTAGCAAAAGTTTACATTCCTATGCACGCCCTCCACCAGTGTCCTCTTCTTCGAAGAGTGAACC  488
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||..||
Sbjct  445  ATCATAGCTACTAGCAAAAGTTTACATTCCTATGCACGCCCACCACCAGTGTCCTCTTCTTCAAAAAGTGGGCC  518

Query  489  AGCCTTCCCTCATCACCATTGGAAGGAGGAAACACCAGTAAGACATGAAAGGGCAAATAGTGAGTCAGAATCTG  562
            |||||||||||||.||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct  519  AGCCTTCCCTCATGACCACTGGAAGGAAGAAACACCAGTAAGACATGAAAGGGCAAACAGTGAGTCAGAGTCAG  592

Query  563  GCATTTTCTGCATGTCCTCCCTGTCAGATGATGATGATTTGGGATGGTGCAATTCCTGGCCTTCAACTGTCTGG  636
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||.||..|.|||
Sbjct  593  GCATTTTCTGTATGTCCTCCCTGTCAGATGATGATGATCTGGGCTGGTGCAATTCCTGGCCATCCACCATTTGG  666

Query  637  CACTGTTTTTTGAAAGGCACACGACTGTGCTTTCATAAGGGAAGCAATAAGGAATGGCAAGATGTTGAAGATTT  710
            |||||.|||.||||||||||.||.||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  667  CACTGCTTTCTGAAAGGCACGCGGCTGTGCTTCCATAAGGAAAGCAATAAGGAATGGCAAGATGTGGAAGACTT  740

Query  711  TGCTAGAGCTGAAGGCTGTGATAATGAGGAAGATCTTCAAATGGGCATTCACAAGGGCTATGGTTCTGATGGTC  784
            |||||||||.|...|||||||||||||||||||..|.||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  741  TGCTAGAGCCGCCAGCTGTGATAATGAGGAAGAGATCCAAATGGGCACTCACAAGGGCTATGGGTCTGATGGTC  814

Query  785  TAAAGTTGTTATCACATGAAGAAAGTGTATCATTTGGCGAGTCTGTACTGAAGTTGACTTTTGATCCTGGTACA  858
            |||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  815  TAAAGTTGTTATCCCATGAAGAGAGTGTGTCATTCGGTGAGTCTGTACTGAAGTTGACATTTGATCCTGGTACA  888

Query  859  GTAGAAGATGGTTTACTTACCGTAGAGTGTAAGCTGGACCACCCTTTCTATGTTAAAAATAAAGGTTGGTCATC  932
            |||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  GTAGAAGATGGCTTGCTCACTGTAGAGTGCAAGCTGGACCACCCTTTCTATGTTAAAAATAAAGGTTGGTCGTC  962

Query  933  ATTTTATCCAAGCTTGACTGTGGTACAGCATGGCATTCCATGTTGTGAAGTTCATATTGGCGATGTATGTCTAC  1006
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  ATTTTATCCAAGCTTGACTGTGGTACAGCATGGCATTCCATGTTGTGAAATTCATATTGGTGACGTATGTCTAC  1036

Query 1007  CTCCTGGACACCCCGATGCCATTAATTTTGATGATTCAGGTGTTTTTGATACATTTAAAAGCTATGACTTCACA  1080
            |||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCCTGGACACCCTGATGCCATTAATTTCGATGATTCAGGTGTTTTTGATACATTTAAAAGCTATGACTTCACA  1110

Query 1081  CCTATGGATTCTTCTGCAGTTTATGTGTTAAGTAGTATGGCTCGCCAGCGTCGTGCATCTTTGTCTTGT---GG  1151
            ||||||||.||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||   ||
Sbjct 1111  CCTATGGACTCTTCTGCGGTCTATGTTTTGAGTAGTATGGCTCGTCAGCGCCGTGCATCTCTGTCTTGTGGAGG  1184

Query 1152  AGGACCTGG---TGGTCAAGACTTTGCAAGATCTGGATTCAGTAAAAACTGTGGCTCACCTGGATCATCACAGC  1222
            |||||||||   |||||||||.|||.|..||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGGACCTGGTACTGGTCAAGAGTTTTCGGGATCTGAATTCAGTAAAAGCTGTGGTTCACCTGGATCATCACAGC  1258

Query 1223  TCTCTTCCAATTCTTTGTATGCTAAAGCTGTCAAAAACCACAGCTCAGGGACTGTGAGTGCCACTTCTCCTAAT  1296
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTCTTCTAGTTCTTTGTATGCTAAAGCTGTCAAAAGCCACAGCTCAGGGACTGTGAGTGCCACTTCTCCTAAT  1332

Query 1297  AAGTGCAAAAGACCAATGAATGCCTTCATGCTTTTTGCCAAAAAATACAGAGTTGAATATACTCAGATGTATCC  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGTGCAAAAGACCAATGAATGCCTTCATGCTTTTTGCCAAAAAATACAGAGTTGAATATACTCAGATGTATCC  1406

Query 1371  AGGGAAAGATAACAGAGCCATAAGTGTGATCCTTGGTGACAGGTGGAAGAAAATGAAGAATGAAGAGAGAAGAA  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|
Sbjct 1407  AGGGAAAGATAACAGAGCCATAAGTGTGATCCTTGGTGACAGGTGGAAAAAAATGAAGAACGAAGAAAGGAGGA  1480

Query 1445  TGTACACATTATAAGCAAAGGCTTTGGCTGAAGAACAGAAACGTTTAAATCCTGACTGTTGGAAGAGGAAAAGA  1518
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1481  TGTACACATTAGAAGCAAAGGCTTTGGCTGAAGAACAAAAGCGTTTAAATCCTGACTGTTGGAAAAGGAAAAGA  1554

Query 1519  ACCAATTCAG-----GCTCACAACAACAT---------------------------------------------  1542
            |||||.||||     |.|...|..||||.                                             
Sbjct 1555  ACCAACTCAGTAAGTGTTAGTAGTAACAGAAGTCCTGATCTGATGCTCTGTGTGTTCTTGTGCCATGATGGCAG  1628

Query 1543  --------------------------------------------------------------------------  1542
                                                                                      
Sbjct 1629  GCAGAGTCTTAAAGATCCCTCACCATTATTATACTTCAAACCTAATACTGGAGTCTGCCTTTTCTATCAAGAAC  1702

Query 1543  --------  1542
                    
Sbjct 1703  CACTTGAG  1710