Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08049
• Subject: NM_014393.2
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1435
• Gaps: 177

Alignment

Query    1  ATGCTTCAAATAAATCAGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCTTGGTGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGCAGCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCAAATAAATCAGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCTTGGTGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGCAGCAG  74

Query   75  TATAAAGAAGGCTCAGCAGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTTCAGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATAAAGAAGGCTCAGCAGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTTCAGAAGC  148

Query  149  CACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGCAGTATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTTGCTATGAAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGCAGTATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTTGCTATGAAA  222

Query  223  AGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCTAATTACAACTTTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCTAATTACAACTTTCG  296

Query  297  GGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTTCAGCTCACTGTAGGAAATAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTTCAGCTCACTGTAGGAAATAATG  370

Query  371  AATTTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAATGAAAGCCCTCCAAGCACTGCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATTTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAATGAAAGCCCTCCAAGCACTGCAG  444

Query  445  AATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATATGGATGATGACAAAGATGCAAA  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATGTGGATGATGACAAAGATGCAAA  518

Query  519  TAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAATATGCCTGTCAGTTTTGAGGTTATTAAAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAATATGCCTGTCAGTTTTGAGGTTATTAAAG  592

Query  593  AAAGTGGACCACCACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGAGTTCTCTGCAGAAGGAGAAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAAGTGGACCACCACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGAGTTCTCTGCAGAAGGAGAAGGA  666

Query  667  AATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACCGTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTTCCACCTCTTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACCGTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTTCCACCTCTTCC  740

Query  741  TGTGGTGGAAAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAGGCCGGACCAGAATATGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGTGGAAAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAGGCCGGACCAGAATATGGCC  814

Query  815  AAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAAATTCAACAGGCCAAAAAGGAAAAGGAGCCGGATTATGTTTTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAAATTCAACAGGCCAAAAAGGAAAAGGAGCCGGATTATGTTTTG  888

Query  889  CTTTCAGAAAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTGAAGGTAGGCAATGAAGTTGCTACAGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTTTCAGAAAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTGAAGGTAGGCAATGAAGTTGCTACAGG  962

Query  963  AACAGGACCTAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTGTTACAACTTGGTTATAAAGCAT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACAGGACCTAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTGTTACAACTTGGTTATAAAGCAT  1036

Query 1037  CCACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGACAGGGGAAAACAAAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGACAGGGGAAAACAAAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCT  1110

Query 1111  GAACCAACAAATAATACTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTTATCAAGAGATGGAAGCCAGCCG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACCAACAAATAATACTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTTATCAAGAGATGGAAGCCAGCCG  1184

Query 1185  CCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATTTGTCACCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATTTGTCACCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCT  1258

Query 1259  TCAGTATATCTCCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGGAACATCTTCTACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCAGTATATCTCCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGGAACATCTTCTACA  1332

Query 1333  GCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTCCCCCTTGTTCTCCAGTACAACCTTCAAAACAACTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTCCCCCTTGTTCTCCAGTACAACCTTCAAAACAACTGGA  1406

Query 1407  ATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGCAGCCTTAAGTGCCTTGAAACAATTTTCTGAACAAGGACTGGATC  1480
            |||||||||||||||||||||||||||||.|                                           
Sbjct 1407  ATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGTA-------------------------------------------  1437

Query 1481  CAATCGATGGAGCAATGAATATCGAAAAAGGTTCTCTTGAAAAACAAGCCAAGCATCTGAGAGAGAAAGCGGAC  1554
                                                                                      
Sbjct 1438  --------------------------------------------------------------------------  1437

Query 1555  AATAACCAGGCACCCCCGGGCTCCATCGCTCAGGACTGCAAGAAATCAAACTCGGCCGTC  1614
                                                                        
Sbjct 1438  ------------------------------------------------------------  1437