Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08049
• Subject: XM_006495528.3
• Aligned Length: 1710
• Identities: 1466
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAAACCCCAAAGAGAAAACTCCAGTGTGTCTGGTAAATGAGTTAGCCCGTTTCCATAGCATCCAACCCCA  74

Query    1  ----ATGCTTC--AAATAAATC----------------AGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCTTGGTGAGCAGA  52
                |.|||||  ||..|||.|                |||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GTATAAGCTTCTGAATGAAAGCGGGCCTGCTCATTCGAAGATGTTTTCGGTGCAGCTGAGTCTTGGCGAGCAGA  148

Query   53  CATGGGAATCCGAAGGCAGCAGTATAAAGAAGGCTCAGCAGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACG  126
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CATGGGAATCCGAAGGGAGCAGTATAAAGAAGGCCCAACAAGCTGTTGCTAACAAAGCTTTGACTGAATCTACG  222

Query  127  CTTCCCAAACCAGTTCAGAAGCCACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGCAGTATAACTCCAACTGTGGA  200
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCCAAACCAGTTCAGAAACCACCTAAAAGTAATGTCAATAATAACCCAGGTAGTATAACTCCAACTGTGGA  296

Query  201  ACTGAATGGGCTTGCTATGAAAAGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATT  274
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGAATGGGCTCGCTATGAAAAGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCACTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATT  370

Query  275  ATAGAGCTAATTACAACTTTCGGGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTT  348
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ATAGAGCTAACTACAACTTCCGGGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAATGCCCAAGATCTTTTATGTT  444

Query  349  CAGCTCACTGTAGGAAATAATGAATTTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAAT  422
            |||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CAGTTAACTGTAGGAAATAATGAATTCTTTGGTGAAGGGAAGACTCGACAAGCTGCCAGACACAATGCTGCGAT  518

Query  423  GAAAGCCCTCCAAGCACTGCAGAATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATA  496
            ||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAAAGCGCTTCAAGCCCTACAGAATGAGCCAATTCCAGAAAAGTCTCCCCAGAATGGTGAATCAGGAAAAGAAA  592

Query  497  TGGATGATGACAAAGATGCAAATAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAATATGCCT  570
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  593  TGGATGACGATAAAGATGCAAATAAATCTGAAATAAGCTTAGTGTTTGAGATTGCGCTGAAGAGAAATATGCCT  666

Query  571  GTCAGTTTTGAGGTTATTAAAGAAAGTGGACCACCACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGA  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GTCAGTTTTGAGGTTATTAAAGAAAGTGGACCACCACATATGAAGAGTTTTGTAACTCGGGTGTCAGTGGGAGA  740

Query  645  GTTCTCTGCAGAAGGAGAAGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACCGTCTTACAGGAGC  718
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTCTGCAGAAGGAGAGGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGTGCCGCAACCACTGTCTTACAGGAGC  814

Query  719  TTAAAAAACTTCCACCTCTTCCTGTGGTGGAAAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTA  792
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAAAAACTCCCACCTCTTCCTGTGGTAGAGAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTA  888

Query  793  AAGGCCGGACCAGAATATGGCCAAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAAATTCAACAGGCCAAAAAGGA  866
            |||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||.||||||
Sbjct  889  AAGGCTGGACCCGACTATGGTCAAGGAATGAACCCCATTAGCCGCCTGGCTCAGATCCAGCAAGCCAGAAAGGA  962

Query  867  AAAGGAGCCGGATTATGTTTTGCTTTCAGAAAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTGAAGG  940
            |||||||||.|||||..|..|.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  963  AAAGGAGCCTGATTACATCCTACTCTCAGAACGAGGAATGCCTCGCCGTCGAGAGTTCGTAATGCAGGTCAAGG  1036

Query  941  TAGGCAATGAAGTTGCTACAGGAACAGGACCTAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTG  1014
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TAGGCAATGAAGTTGCGACTGGAACAGGACCCAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCTGAAGCAATGCTG  1110

Query 1015  TTACAACTTGGTTATAAAGCATCCACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGACAGGGGAAAACAAAGGATGGAG  1088
            |||||.|||||.||||||||.|||||.|.|||||||||||..||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTACAGCTTGGCTATAAAGCGTCCACCAGTCTTCAGGATCCGCTCGACAAGACAGGTGAAAACAAAGGATGGAG  1184

Query 1089  TGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAATACTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTT  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAACACTCCAAAAGGAATTCTTCATCTTTCTCCTGATGTTT  1258

Query 1163  ATCAAGAGATGGAAGCCAGCCGCCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATTTGTCACCCAAAGATATG  1236
            ||||||||||||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  ATCAAGAGATGGAAGCTAGCCGCCACAGAGTGACCTCTGGCACAACTCTAAGCTACTTATCTCCCAAAGATATG  1332

Query 1237  AACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTATATCTCCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCT  1310
            |||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||.|.|||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTGTGTCTCCCTCATCAACTAGTTCAGCCACAGTTGCCAGGGAACTCCT  1406

Query 1311  TATGAATGGAACATCTTCTACAGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTCCCCCTTGTTCTCCAG  1384
            ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1407  TATGAATGGAACATCTCCTACTGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTTCCCCTTGTTCTTCAG  1480

Query 1385  TACAACCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGCAGCCTTAAGTGCCTTGAAACAA  1458
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1481  TACAGCCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGCAGCCTTAAGTGCCTTGAAACAG  1554

Query 1459  TTTTCTGAACAAGGACTGGATCCAATCGATGGAGCAATGAATATCGAAAAAGGTTCTCTTGAAAAACAAGCCAA  1532
            ||||||||||||||||||||..||||.|||||.|||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TTTTCTGAACAAGGACTGGAATCAATTGATGGGGCAGTGAATGTTGAAAAGGGTTCTCTTGAAAAACAAGCCAA  1628

Query 1533  GCATCTGAGAGAGAAAGCGGACAATAACCAGGCACCCCCGGGCTCCATCGCTCAGGACTGCAAGAAATCAAACT  1606
            |||||||.|.||||||||.||||||||||||||....||||.|||||||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1629  GCATCTGCGGGAGAAAGCAGACAATAACCAGGCGAAGCCGGCCTCCATCTCTCAGGACTGCAAGAAATCAAAGT  1702

Query 1607  CGGCCGTC  1614
            |||||.||
Sbjct 1703  CGGCCATC  1710