Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08049
• Subject: XM_011238388.2
• Aligned Length: 1734
• Identities: 1375
• Gaps: 213

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCAAACCCCAAAGAGAAAACTCCAGTGTGTCTGGTAAATGAGTTAGCCCGTTTCCATAGCATCCAACCCCA  74

Query    1  ----ATGCTTC--AAATAAATC----------------AGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCTTGGTGAGCAGA  52
                |.|||||  ||..|||.|                |||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  GTATAAGCTTCTGAATGAAAGCGGGCCTGCTCATTCGAAGATGTTTTCGGTGCAGCTGAGTCTTGGCGAGCAGA  148

Query   53  CATGGGAATCCGAAGGCAGCAGTATAAAGAAGGCTCAGCAGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACG  126
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CATGGGAATCCGAAGGGAGCAGTATAAAGAAGGCCCAACAAGCTGTTGCTAACAAAGCTTTGACTGAATCTACG  222

Query  127  CTTCCCAAACCAGTTCAGAAGCCACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGCAGTATAACTCCAACTGTGGA  200
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTCCCAAACCAGTTCAGAAACCACCTAAAAGTAATGTCAATAATAACCCAGGTAGTATAACTCCAACTGTGGA  296

Query  201  ACTGAATGGGCTTGCTATGAAAAGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATT  274
            ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACTGAATGGGCTCGCTATGAAAAGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCACTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATT  370

Query  275  ATAGAGCTAATTACAACTTTCGGGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTT  348
            ||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct  371  ATAGAGCTAACTACAACTTCCGGGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAATGCCCAAGATCTTTTATGTT  444

Query  349  CAGCTCACTGTAGGAAATAATGAATTTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAAT  422
            |||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  445  CAGTTAACTGTAGGAAATAATGAATTCTTTGGTGAAGGGAAGACTCGACAAGCTGCCAGACACAATGCTGCGAT  518

Query  423  GAAAGCCCTCCAAGCACTGCAGAATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATA  496
            ||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  519  GAAAGCGCTTCAAGCCCTACAGAATGAGCCAATTCCAGAAAAGTCTCCCCAGAATGGTGAATCAGGAAAAGAAA  592

Query  497  TGGATGATGACAAAGATGCAAATAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAATATGCCT  570
            |||||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  593  TGGATGACGATAAAGATGCAAATAAATCTGAAATAAGCTTAGTGTTTGAGATTGCGCTGAAGAGAAATATGCCT  666

Query  571  GTCAGTTTTGAGGTTATTAAAGAAAGTGGACCACCACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGA  644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  GTCAGTTTTGAGGTTATTAAAGAAAGTGGACCACCACATATGAAGAGTTTTGTAACTCGGGTGTCAGTGGGAGA  740

Query  645  GTTCTCTGCAGAAGGAGAAGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACCGTCTTACAGGAGC  718
            .||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  ATTTTCTGCAGAAGGAGAGGGAAATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGTGCCGCAACCACTGTCTTACAGGAGC  814

Query  719  TTAAAAAACTTCCACCTCTTCCTGTGGTGGAAAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTA  792
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAAAAACTCCCACCTCTTCCTGTGGTAGAGAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTA  888

Query  793  AAGGCCGGACCAGAATATGGCCAAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAAATTCAACAGGCCAAAAAGGA  866
            |||||.|||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||.||||||
Sbjct  889  AAGGCTGGACCCGACTATGGTCAAGGAATGAACCCCATTAGCCGCCTGGCTCAGATCCAGCAAGCCAGAAAGGA  962

Query  867  AAAGGAGCCGGATTATGTTTTGCTTTCAGAAAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTGAAGG  940
            |||||||||.|||||..|..|.||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  963  AAAGGAGCCTGATTACATCCTACTCTCAGAACGAGGAATGCCTCGCCGTCGAGAGTTCGTAATGCAGGTCAAGG  1036

Query  941  TAGGCAATGAAGTTGCTACAGGAACAGGACCTAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTG  1014
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TAGGCAATGAAGTTGCGACTGGAACAGGACCCAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCTGAAGCAATGCTG  1110

Query 1015  TTACAACTTGGTTATAAAGCATCCACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGACAGGGGAAAACAAAGGATGGAG  1088
            |||||.|||||.||||||||.|||||.|.|||||||||||..||.||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTACAGCTTGGCTATAAAGCGTCCACCAGTCTTCAGGATCCGCTCGACAAGACAGGTGAAAACAAAGGATGGAG  1184

Query 1089  TGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAATACTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTT  1162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCTGAACCAACAAATAACACTCCAAAAGGAATTCTTCATCTTTCTCCTGATGTTT  1258

Query 1163  ATCAAGAGATGGAAGCCAGCCGCCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATTTGTCACCCAAAGATATG  1236
            ||||||||||||||||.||||||||||.|||.|.|||||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||
Sbjct 1259  ATCAAGAGATGGAAGCTAGCCGCCACAGAGTGACCTCTGGCACAACTCTAAGCTACTTATCTCCCAAAGATATG  1332

Query 1237  AACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTATATCTCCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCT  1310
            |||||||||||||||||||||||||||.|.||||||.||||.|.|||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 1333  AACCAACCTTCAAGCTCTTTCTTCAGTGTGTCTCCCTCATCAACTAGTTCAGCCACAGTTGCCAGGGAACTCCT  1406

Query 1311  TATGAATGGAACATCTTCTACAGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTCCCCCTTGTTCTCCAG  1384
            ||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1407  TATGAATGGAACATCTCCTACTGCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTTCCCCTTGTTCTTCAG  1480

Query 1385  TACAACCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGG----CAGCCTTAAGTGCCTTGAA  1454
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||               
Sbjct 1481  TACAGCCTTCAAAACAACTGGAATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGTCAACAGC---------------  1539

Query 1455  ACAATTTTCTGAACAAGGACTGGATCCAATCGATGGAGCAATGAATATCGAAAAAGGT-------TCTCTTGAA  1521
                   |.||.||.||  |||..||||.|             |.||| ||||||.||       .|||||   
Sbjct 1540  -------TGTGCACCAG--CTGCTTCCACT-------------ATTAT-GAAAAATGTGCTTATGCCTCTT---  1587

Query 1522  AAACAAGCCAAGCATCTGAGAGAGAAAGCGGACAATAACCAGGCACC-CCCGGGCTCCATCGCTCA---GGA--  1589
                 .||  ||||.||            .|.||.|         || |||.|||||.|   |.||   |||  
Sbjct 1588  -----TGC--AGCAGCT------------CGTCATT---------CCTCCCTGGCTCTA---CACAGTTGGATC  1630

Query 1590  -------CTGCAAGAAATCAAACTCGGCCGTC  1614
                   .|||                     
Sbjct 1631  TTTTGTGGTGC---------------------  1641