Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08049
• Subject: XM_017321109.1
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1339
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGCTTCAAATAAATCAGATGTTCTCAGTGCAGCTGAGTCTTGGTGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGCAGCAG  74
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCTTCAGATAAATCAGATGTTTTCGGTGCAGCTGAGTCTTGGCGAGCAGACATGGGAATCCGAAGGGAGCAG  74

Query   75  TATAAAGAAGGCTCAGCAGGCTGTTGCCAATAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTTCAGAAGC  148
            ||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct   75  TATAAAGAAGGCCCAACAAGCTGTTGCTAACAAAGCTTTGACTGAATCTACGCTTCCCAAACCAGTTCAGAAAC  148

Query  149  CACCCAAAAGTAATGTTAACAATAACCCAGGCAGTATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTTGCTATGAAA  222
            ||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  CACCTAAAAGTAATGTCAATAATAACCCAGGTAGTATAACTCCAACTGTGGAACTGAATGGGCTCGCTATGAAA  222

Query  223  AGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCATTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCTAATTACAACTTTCG  296
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  223  AGGGGAGAGCCTGCCATCTACAGGCCACTAGATCCAAAGCCATTCCCAAATTATAGAGCTAACTACAACTTCCG  296

Query  297  GGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAGTGCCTAAGATCTTTTATGTTCAGCTCACTGTAGGAAATAATG  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct  297  GGGCATGTACAATCAGAGGTATCATTGCCCAATGCCCAAGATCTTTTATGTTCAGTTAACTGTAGGAAATAATG  370

Query  371  AATTTTTTGGGGAAGGAAAGACTCGACAAGCTGCTAGACACAATGCTGCAATGAAAGCCCTCCAAGCACTGCAG  444
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct  371  AATTCTTTGGTGAAGGGAAGACTCGACAAGCTGCCAGACACAATGCTGCGATGAAAGCGCTTCAAGCCCTACAG  444

Query  445  AATGAACCTATTCCAGAAAGATCTCCTCAGAATGGTGAATCAGGAAAGGATATGGATGATGACAAAGATGCAAA  518
            |||||.||.||||||||||..|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  445  AATGAGCCAATTCCAGAAAAGTCTCCCCAGAATGGTGAATCAGGAAAAGAAATGGATGACGATAAAGATGCAAA  518

Query  519  TAAGTCTGAGATCAGCTTAGTGTTTGAAATTGCTCTGAAGCGAAATATGCCTGTCAGTTTTGAGGTTATTAAAG  592
            |||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAAATCTGAAATAAGCTTAGTGTTTGAGATTGCGCTGAAGAGAAATATGCCTGTCAGTTTTGAGGTTATTAAAG  592

Query  593  AAAGTGGACCACCACATATGAAAAGCTTTGTTACTCGAGTGTCAGTAGGAGAGTTCTCTGCAGAAGGAGAAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct  593  AAAGTGGACCACCACATATGAAGAGTTTTGTAACTCGGGTGTCAGTGGGAGAATTTTCTGCAGAAGGAGAGGGA  666

Query  667  AATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGCGCTGCGACCACCGTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTTCCACCTCTTCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  AATAGCAAAAAACTCTCCAAGAAGCGTGCCGCAACCACTGTCTTACAGGAGCTTAAAAAACTCCCACCTCTTCC  740

Query  741  TGTGGTGGAAAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAGGCCGGACCAGAATATGGCC  814
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  741  TGTGGTAGAGAAGCCAAAACTATTTTTTAAAAAACGCCCTAAAACAATAGTAAAGGCTGGACCCGACTATGGTC  814

Query  815  AAGGGATGAACCCTATTAGCCGCCTGGCGCAAATTCAACAGGCCAAAAAGGAAAAGGAGCCGGATTATGTTTTG  888
            ||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||.|||||||||||||||.|||||..|..|.
Sbjct  815  AAGGAATGAACCCCATTAGCCGCCTGGCTCAGATCCAGCAAGCCAGAAAGGAAAAGGAGCCTGATTACATCCTA  888

Query  889  CTTTCAGAAAGAGGAATGCCTCGACGTCGAGAATTTGTGATGCAGGTGAAGGTAGGCAATGAAGTTGCTACAGG  962
            ||.||||||.|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  889  CTCTCAGAACGAGGAATGCCTCGCCGTCGAGAGTTCGTAATGCAGGTCAAGGTAGGCAATGAAGTTGCGACTGG  962

Query  963  AACAGGACCTAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCAGAAGCAATGCTGTTACAACTTGGTTATAAAGCAT  1036
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct  963  AACAGGACCCAATAAAAAGATAGCCAAAAAAAATGCTGCTGAAGCAATGCTGTTACAGCTTGGCTATAAAGCGT  1036

Query 1037  CCACTAATCTTCAGGATCAACTTGAGAAGACAGGGGAAAACAAAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCT  1110
            ||||.|.|||||||||||..||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCACCAGTCTTCAGGATCCGCTCGACAAGACAGGTGAAAACAAAGGATGGAGTGGTCCAAAGCCTGGGTTTCCT  1110

Query 1111  GAACCAACAAATAATACTCCAAAAGGAATTCTTCATTTGTCTCCTGATGTTTATCAAGAGATGGAAGCCAGCCG  1184
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GAACCAACAAATAACACTCCAAAAGGAATTCTTCATCTTTCTCCTGATGTTTATCAAGAGATGGAAGCTAGCCG  1184

Query 1185  CCACAAAGTAATCTCTGGCACTACTCTAGGCTATTTGTCACCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCT  1258
            |||||.|||.|.|||||||||.||||||.||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCACAGAGTGACCTCTGGCACAACTCTAAGCTACTTATCTCCCAAAGATATGAACCAACCTTCAAGCTCTTTCT  1258

Query 1259  TCAGTATATCTCCCACATCGAATAGTTCAGCTACAATTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGGAACATCTTCTACA  1332
            |||||.|.||||||.||||.|.|||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 1259  TCAGTGTGTCTCCCTCATCAACTAGTTCAGCCACAGTTGCCAGGGAACTCCTTATGAATGGAACATCTCCTACT  1332

Query 1333  GCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTCCCCCTTGTTCTCCAGTACAACCTTCAAAACAACTGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTGAAGCCATAGGTTTAAAAGGAAGTTCTCCTACTTCCCCTTGTTCTTCAGTACAGCCTTCAAAACAACTGGA  1406

Query 1407  ATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAGGCAGCCTTAAGTGCCTTGAAACAATTTTCTGAACAAGGACTGGATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||                                              
Sbjct 1407  ATATTTAGCAAGGATTCAAGGCTTTCAG----------------------------------------------  1434

Query 1481  CAATCGATGGAGCAATGAATATCGAAAAAGGTTCTCTTGAAAAACAAGCCAAGCATCTGAGAGAGAAAGCGGAC  1554
                                                       ||||||||||||||||.|.||||||||.|||
Sbjct 1435  -------------------------------------------ACAAGCCAAGCATCTGCGGGAGAAAGCAGAC  1465

Query 1555  AATAACCAGGCACCCCCGGGCTCCATCGCTCAGGACTGCAAGAAATCAAACTCGGCCGTC  1614
            ||                                                          
Sbjct 1466  AA----------------------------------------------------------  1467