Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08060
• Subject: XM_017023139.2
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1673
• Gaps: 237

Alignment

Query    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGCGGGCTCGGAGCGCGGGGCGGCGGCAACCCCCGGGGGTTTGCCCGCGCCCTGCGCCTCGAAGGTGGA  74

Query   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCTGCGGCTCAGCTGCCGGCACCTGCTGGACCGCGACCCGCTCACCAAGTCCGACCCCAGCGTGGCGTTGCTGC  148

Query  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGG------------TGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCAT  210
            |||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGCAGGCGCAGGGCCAGTGGGTGCAGGTGCACTTGCAGGTGGGCAGAACCGAGGTGGTCCGGAGCAGCCTGCAT  222

Query  211  CCCGTGTTCTCCAAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGA  284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGTGTTCTCCAAGGTCTTCACGGTGGACTACTACTTCGAGGAGGTGCAGAGGCTGCGCTTTGAGGTGTACGA  296

Query  285  CACGCATGGGCCCAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGG------  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  297  CACGCATGGGCCCAGCGGCTTCAGCTGTCAGGAGGACGATTTCCTGGGGGGCATGGAGTGCACCCTGGGGCAGC  370

Query  353  --------------------------------------------------------------------------  352
                                                                                      
Sbjct  371  CAGCCCAAAAGTGGCTTCTGCAAGTCGTGATGAGAGTGTCTGTTGATGTGCTGGGCCCTGCTGGACACTGCGCT  444

Query  353  --------------------------------------------------------------------------  352
                                                                                      
Sbjct  445  AAGCACTTCCTGTGCTGCACGGAATCCTCACACCTTGCCAGGACGGGTCCTTCTTTTTTATTGAGGTATGATGA  518

Query  353  -----------------------------------------------------------------------GGC  355
                                                                                   |||
Sbjct  519  CCTCTGCCTCCCCTGGGCGACTGCTGGCGCCGTGAGGTGGTGGACGTGCAGGGGTGGCCACACGCAGGGATGGC  592

Query  356  AGATTGTGGCCCAGAAGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATC  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGATTGTGGCCCAGAAGAAGGTGACCCGCCCGCTGCTGCTCAAGTTTGGCAGGAACGCTGGCAAGTCCACCATC  666

Query  430  ACGGTGATCGCCGAGGACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGA  503
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACGGTGATCGCCGAGGACATCTCGGGGAACAACGGCTACGTGGAGCTCTCCTTCCGGGCCAGGAAGCTGGACGA  740

Query  504  CAAGGACCTCTTCAGCAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGG  577
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGGACCTCTTCAGCAAGTCCGACCCCTTCCTGGAGCTCTACAGGGTCAACGACGACCAGGGCTTGCAGCTGG  814

Query  578  TGTACAGGACGGAGGTGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTC  651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGTACAGGACGGAGGTGGTGAAGAACAACCTGAACCCGGTGTGGGAGGCCTTCAAAGTCTCTCTGAGTTCCCTC  888

Query  652  TGCAGCTGCGAGGAGACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCAT  725
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAGCTGCGAGGAGACAAGGCCTCTAAAGTGCCTGGTCTGGGATTACGACTCTCGAGGAAAGCACGACTTCAT  962

Query  726  CGGAGAATTCTCTACCACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGA  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGGAGAATTCTCTACCACCTTCGAGGAGATGCAGAAGGCCTTTGAGGAGGGGCAGGCCCAGTGGGACTGTGTGA  1036

Query  800  ACCCCAAATACAAGCAGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCAC  873
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCCCAAATACAAGCAGAAGAGACGCAGTTATAAGAACTCAGGAGTGGTCGTCCTGGCTGACCTCAAGTTCCAC  1110

Query  874  AGGGTGTACTCCTTCCTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGC  947
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGGTGTACTCCTTCCTGGACTATATCATGGGCGGCTGCCAGATCCACTTCACCGTGGCCATTGACTTCACCGC  1184

Query  948  CTCCAATGGAGACCCGCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGG  1021
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CTCCAATGGAGACCCGCGGAACAGCTGCTCCCTGCACTACATCAACCCCTACCAGCCGAACGAGTACCTGAAGG  1258

Query 1022  CACTGGTGTCCGTGGGCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCC  1095
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CACTGGTGTCCGTGGGCGAGATCTGCCAGGACTATGACAGTGACAAGAGGTTTTCCGCTTTGGGGTTTGGAGCC  1332

Query 1096  CGGATCCCTCCCAAGTATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGG  1169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CGGATCCCTCCCAAGTATGAGGTGTCCCATGACTTTGCCATCAATTTCAACCCTGAGGACGATGAGTGTGAAGG  1406

Query 1170  CATCCAGGGCGTGGTGGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGC  1243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CATCCAGGGCGTGGTGGAGGCCTACCAGAACTGCCTGCCCAGGGTCCAGCTCTACGGCCCCACCAACGTGGCGC  1480

Query 1244  CCATCATCTCCAAGGTGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTG  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CCATCATCTCCAAGGTGGCACGCGTGGCGGCGGCCGAGGAGAGCACCGGGAAAGCCTCTCAATACTACATCCTG  1554

Query 1318  CTGATCCTGACGGACGGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCC  1391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGATCCTGACGGACGGCGTGGTGACCGACATGGCCGACACACGGGAGGCCATTGTGCGTGCCTCACGCCTGCC  1628

Query 1392  CATGTCCATCATCATCGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCG  1465
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATGTCCATCATCATCGTGGGCGTGGGCAACGCCGACTTCACCGACATGCAGGTCCTGGACGGCGACGACGGCG  1702

Query 1466  TCCTGCGCTCCCCACGGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGAAC  1539
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCCTGCGCTCCCCACGGGGTGAGCCCGCGCTCCGGGACATCGTACAGTTCGTGCCCTTCCGGGAGCTCAAGAAC  1776

Query 1540  GCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTGGAGTACTACAGCCACAG  1613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GCATCCCCTGCGGCGCTGGCCAAGTGCGTGCTGGCCGAGGTCCCGAAGCAGGTGGTGGAGTACTACAGCCACAG  1850

Query 1614  AGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGCGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCACACCG  1674
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AGGCCTGCCCCCGAGAAGCCTGGGTGTCCCTGCCGGAGAGGCCAGCCCAGGCTGCACACCG  1911