Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08070
- Subject:
- NM_001164545.1
- Aligned Length:
- 2496
- Identities:
- 1736
- Gaps:
- 759
Alignment
Query 1 ATGCCAGGCGGGGGTCCTCAGGGCGCCCCAGCCGCCGCCGGCGGCGGCGGCGTGAGCCACCGCGCAGGCAGCCG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCAGGCGGGGGTCCTCAGGGCGCCCCAGCCGCCGCCGGCGGCGGCGGCGTGAGCCACCGCGCAGGCAGCCG 74
Query 75 GGATTGCTTACCACCTGCAGCGTGCTTTCGGAGGCGGCGGCTGGCACGGAGGCCGGGCTACATGAGAAGCTCGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGATTGCTTACCACCTGCAGCGTGCTTTCGGAGGCGGCGGCTGGCACGGAGGCCGGGCTACATGAGAAGCTCGA 148
Query 149 CAGGGCCTGGGATCGGGTTCCTTTCCCCAGCAGTGGGCACACTGTTCCGGTTCCCAGGAGGGGTGTCTGGCGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CAGGGCCTGGGATCGGGTTCCTTTCCCCAGCAGTGGGCACACTGTTCCGGTTCCCAGGAGGGGTGTCTGGCGAG 222
Query 223 GAGTCCCACCACTCGGAGTCCAGGGCCAGACAGTGTGGCCTTGACTCGAGAGGCCTCTTGGTCCGGAGCCCTGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGTCCCACCACTCGGAGTCCAGGGCCAGACAGTGTGGCCTTGACTCGAGAGGCCTCTTGGTCCGGAGCCCTGT 296
Query 297 TTCCAAGAGTGCAGCAGCCCCTACTGTGACCTCTGTGAGAGGAACCTCGGCGCACTTTGGGATTCAGCTCAGAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCCAAGAGTGCAGCAGCCCCTACTGTGACCTCTGTGAGAGGAACCTCGGCGCACTTTGGGATTCAGCTCAGAG 370
Query 371 GTGGCACCAGATTGCCTGACAGGCTTAGCTGGCCGTGTGGCCCTGGGAGTGCTGGGTGGCAGCAAGAGTTTGCA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GTGGCACCAGATTGCCTGACAGGCTTAGCTGGCCGTGTGGCCCTGGGAGTGCTGGGTGGCAGCAAGAGTTTGCA 444
Query 445 GCCATGGATAGTTCTGAGACCCTGGACGCCAGCTGGGAGGCAGCCTGCAGCGATGGAGCAAGGCGTGTCCGGGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GCCATGGATAGTTCTGAGACCCTGGACGCCAGCTGGGAGGCAGCCTGCAGCGATGGAGCAAGGCGTGTCCGGGC 518
Query 519 AGCAGGCTCTCTGCCATCAGCAGAGTTGAGTAGCAACAGCTGCAGCCCTGGCTGTGGCCCTGAGGTCCCCCCAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AGCAGGCTCTCTGCCATCAGCAGAGTTGAGTAGCAACAGCTGCAGCCCTGGCTGTGGCCCTGAGGTCCCCCCAA 592
Query 593 CCCCTCCTGGCTCTCACAGTGCCTTTACCTCAAGCTTTAGCTTTATTCGGCTCTCGCTTGGCTCTGCCGGGGAA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCCCTCCTGGCTCTCACAGTGCCTTTACCTCAAGCTTTAGCTTTATTCGGCTCTCGCTTGGCTCTGCCGGGGAA 666
Query 667 CGTGGAGAAGCAGAAGGCTGCCCACCATCCAGAGAGGCTGAGTCCCATTGCCAGAGCCCCCAGGAGATGGGAGC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CGTGGAGAAGCAGAAGGCTGCCCACCATCCAGAGAGGCTGAGTCCCATTGCCAGAGCCCCCAGGAGATGGGAGC 740
Query 741 CAAAGCTGCCAGCTTGGACGGGCCTCACGAGGACCCGCGATGTCTCTCTCAGCCCTTCAGTCTCTTGGCTACAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAAAGCTGCCAGCTTGGACGGGCCTCACGAGGACCCGCGATGTCTCTCTCGGCCCTTCAGTCTCTTGGCTACAC 814
Query 815 GGGTCTCTGCAGACTTGGCCCAGGCCGCAAGGAACAGCTCCAGGCCAGAGCGTGACATGCATTCTTTACCAGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGTCTCTGCAGACTTGGCCCAGGCCGCAAGGAACAGCTCCAGGCCAGAGCGTGACATGCATTCTTTACCAGAC 888
Query 889 ATGGACCCTGGCTCCTCCAGTTCTCTGGATCCCTCACTGGCTGGCTGTGGTGGTGATGGGAGCAGCGGCTCAGG 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATGGACCCTGGCTCCTCCAGTTCTCTGGATCCCTCACTGGCTGGCTGTGGTGGTGATGGGAGCAGCGGCTCAGG 962
Query 963 GGATGCCCACTCTTGGGACACCCTGCTCAGGAAATGGGAGCCAGTGCTGCGGGACTGCCTGCTGAGAAACCGGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGATGCCCACTCTTGGGACACCCTGCTCAGGAAATGGGAGCCAGTGCTGCGGGACTGCCTGCTGAGAAACCGGA 1036
Query 1037 GGCAGATGGAGGTAATATCCTTAAGATTAAAACTTCAGAAACTTCAGGAAGATGCAGTTGAGAATGATGATTAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GGCAGATGGAGGTAATATCCTTAAGATTAAAACTTCAGAAACTTCAGGAAGATGCAGTTGAGAATGATGATTAT 1110
Query 1111 GATAAAGCTGAGACGTTACAACAAAGATTAGAAGACCTGGAACAAGAGAAAATCAGCCTGCACTTTCAACTTCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATAAAGCTGAGACGTTACAACAAAGATTAGAAGACCTGGAACAAGAGAAAATCAGCCTGCACTTTCAACTTCC 1184
Query 1185 TTCAAGGCAGCCAGCTCTTAGCAGTTTCCTGGGTCACCTGGCAGCACAAGTCCAGGCTGCCTTGCGCCGTGGGG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTCAAGGCAGCCAGCTCTTAGCAGTTTCCTGGGTCACCTGGCAGCACAAGTCCAGGCTGCCTTGCGCCGTGGGG 1258
Query 1259 CCACTCAGCAGGCCAGCGGAGATGACACCCACACCCCACTGAGAATGGAGCCGAGGCTGTTGGAACCCACTGCT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCACTCAGCAGGCCAGCGGAGATGACACCCACACCCCACTGAGAATGGAGCCGAGGCTGTTGGAACCCACTGCT 1332
Query 1333 CAGGACAGCTTGCACGTGTCCATCACGAGACGAGACTGGCTTCTTCAGGAAAAGCAGCAGCTACAGAAAGAAAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CAGGACAGCTTGCACGTGTCCATCACGAGACGAGACTGGCTTCTTCAGGAAAAGCAGCAGCTACAGAAAGAAAT 1406
Query 1407 CGAAGCTCTCCAAGCAAGGATGTTTGTGCTGGAAGCCAAAGATCAACAGCTGAGAAGGGAAATAGAGGAGCAAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CGAAGCTCTCCAAGCAAGGATGTTTGTGCTGGAAGCCAAAGATCAACAGCTGAGAAGGGAAATAGAGGAGCAAG 1480
Query 1481 AGCAGCAACTCCAGTGGCAGGGCTGCGACCTGACCCCACTGGTGGGCCAGCTGTCCCTGGGTCAGCTGCAGGAG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AGCAGCAACTCCAGTGGCAGGGCTGCGACCTGACCCCACTGGTGGGCCAGCTGTCCCTGGGTCAGCTGCAGGAG 1554
Query 1555 GTCAGCAAGGCCTTGCAGGACACCCTGGCCTCAGCCGGTCAGATTCCCTTCCATGCAGAGCCACCGGAAACCAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTCAGCAAGGCCTTGCAGGACACCCTGGCCTCAGCCGGTCAGATTCCCTTCCATGCAGAGCCACCGGAAACCAT 1628
Query 1629 AAGGAGCCTCCAGGAAAGAATAAAATCCCTCAACTTGTCACTTAAAGAAATCACTACTAAGGTGTGTATGAGTG 1702
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 AAGGAGCCTCCAGGAAAGAATAAAATCCCTCAACTTGTCACTTAAAGAAATCACTACTA--------------- 1687
Query 1703 AGAAATTCTGCAGCACCCTGAGGAAGAAAGTTAACGATATTGAAACCCAACTACCAGCCTTGCTTGAAGCCAAA 1776
Sbjct 1688 -------------------------------------------------------------------------- 1687
Query 1777 ATGCATGCCATATCAGGAAACCATTTCTGGACGGCTAAAGACCTCACCGAGGAGATTAGATCATTAACATCAGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1688 --------------AGGAAACCATTTCTGGACGGCTAAAGACCTCACCGAGGAGATTAGATCAT---------- 1737
Query 1851 GAGAGAAGGGCTGGAGGGACTCCTCAGCAAGCTGTTGGTGTTGAGTTCCAGGAATGTCAAAAAGCTGGGAAGTG 1924
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 1925 TTAAAGAAGATTACAACAGACTGAGAAGAGAAGTGGAGCACCAGGAGACTGCCTATGAAACAAGTGTGAAGGAA 1998
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 1999 AATACTATGAAGTACATGGAAACACTTAAGAATAAACTGTGCAGCTGCAAGTGTCCACTGCTTGGGAAAGTGTG 2072
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2073 GGAAGCTGACTTGGAAGCTTGTCGATTGCTTATCCAGAGCCTACAGCTCCAGGAAGCCAGGGGAAGCCTGTCTG 2146
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2147 TAGAAGATGAGAGGCAGATGGATGACTTAGAGGGAGCTGCTCCTCCTATTCCCCCCAGGCTCCACTCCGAGGAT 2220
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2221 AAAAGGAAGACCCCTTTGAAGGAATCTTACATCCTTTCTGCAGAACTTGGAGAAAAGTGTGAAGACATAGGCAA 2294
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2295 GAAGCTATTGTACTTGGAAGATCAACTTCACACAGCAATCCACAGTCATGATGAAGATCTCATTCAGTCTCTCA 2368
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2369 GGAGGGAGCTCCAGATGGTGAAGGAAACTCTGCAGGCCATGATCCTGCAGCTCCAGCCAGCAAAGGAGGCGGGA 2442
Sbjct 1738 -------------------------------------------------------------------------- 1737
Query 2443 GAAAGAGAAGCTGCAGCTTCCTGCATGACAGCTGGTGTCCACGAAGCACAAGCC 2496
Sbjct 1738 ------------------------------------------------------ 1737