Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08091
• Subject: NM_001038643.1
• Aligned Length: 2076
• Identities: 1882
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGGGGAAGAAGCCGGGCGGTTCGTCGGGCGGCGGCCGGAGCGGCGAGCTGCAGGGGGACGAGGCGCAGAG  74
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGGGAAAGAAGCCGGGCGGCTCGTCGGGCGGCGGCCGGAGCGGCGAGCTGCAGGGGGACGAGGCGCAGAG  74

Query   75  GAACAAGAAAAAGAAAAAGAAGGTGTCCTGCTTTTCCAACATCAAGATCTTCCTTGTGTCCGAGTGCGCCCTGA  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|||
Sbjct   75  GAACAAGAAGAAGAAAAAGAAGGTGTCCTGCTTCTCCAACATCAAGATCTTCCTGGTGTCTGAGTGCGCCTTGA  148

Query  149  TGCTGGCGCAGGGCACGGTGGGCGCCTACCTGGTGAGCGTCCTGACCACCCTGGAGCGTAGGTTCAACCTGCAG  222
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct  149  TGCTGGCGCAGGGTACGGTGGGCGCCTACCTGGTGAGCGTGTTGACCACCCTGGAACGCAGGTTCAACCTCCAG  222

Query  223  AGCGCTGACGTGGGTGTGATCGCTAGCAGCTTCGAGATCGGGAACCTGGCGCTCATCCTCTTCGTGAGCTACTT  296
            |||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  223  AGCGCCGATGTGGGTGTGATCGCCAGCAGCTTTGAGATCGGCAACCTGGCGCTGATTCTCTTCGTAAGTTACTT  296

Query  297  CGGGGCACGCGGGCACCGGCCGCGCCTGATCGGCTGCGGCGGCATCGTCATGGCGCTGGGCGCGCTGCTGTCGG  370
            |||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  297  CGGAGCACGTGGGCACCGACCGCGCCTCATCGGCTGTGGTGGAATTGTCATGGCACTGGGCGCCCTGCTTTCGG  370

Query  371  CGCTGCCCGAGTTCCTGACCCACCAGTACAAGTACGAGGCGGGCGAGATCCGCTGGGGCGCCGAGGGCCGCGAC  444
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||.
Sbjct  371  CACTGCCTGAGTTCCTCACCCACCAGTACAAGTACGAGGCTGGCGAGATCCGATGGGGAGCAGAAGGCCGCGAT  444

Query  445  GTCTGCGCAGCCAACGGCTCGGGCGGCGACGAGGGGCCCGACCCCGACCTCATCTGCCTCAACCGGACGGCTAC  518
            |||||.||..||||.||.||..||.|.||.||||||||||||||.|||||.|||||||..||||||||.||.||
Sbjct  445  GTCTGTGCCACCAATGGGTCCAGCAGTGATGAGGGGCCCGACCCGGACCTAATCTGCCGTAACCGGACAGCCAC  518

Query  519  CAACATGATGTACTTGCTGCTCATTGGGGCCCAGGTGCTCCTGGGCATCGGTGCTACCCCTGTGCAGCCCCTGG  592
            .||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  519  GAACATGATGTACTTGCTGCTTATTGGGGCTCAGGTGCTCCTGGGCATCGGTGCTACCCCCGTGCAGCCCCTGG  592

Query  593  GCGTCTCCTACATCGACGACCACGTGCGGAGGAAGGACTCCTCGCTCTATATAGGAATCCTGTTCACGATGCTG  666
            |.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct  593  GGGTCTCCTATATTGACGACCACGTGCGGAGAAAGGACTCCTCGCTCTACATAGGAATCCTGTTCACGATGTTG  666

Query  667  GTATTTGGACCAGCCTGCGGGTTTATCCTGGGCTCTTTCTGTACCAAAATCTACGTGGATGCAGTCTTCATTGA  740
            |||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GTATTTGGACCAGCCTGTGGATTTATTCTGGGCTCTTTCTGTACCAAGATCTATGTGGATGCGGTCTTCATTGA  740

Query  741  CACAAGTAACCTGGACATCACTCCGGACGACCCCCGCTGGATCGGAGCCTGGTGGGGTGGCTTTCTGCTCTGCG  814
            ||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  741  CACAAGTAACCTGGACATCACTCCAGATGACCCGCGTTGGATCGGAGCCTGGTGGGGCGGCTTTCTGCTCTGCG  814

Query  815  GTGCCTTACTCTTCTTCTCTTCCCTCTTGATGTTTGGGTTTCCACAGTCCCTGCCCCCGCACTCAGACCCCGCC  888
            |||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  815  GTGCCTTGCTCTTCTTCTCGTCCCTCCTGATGTTTGGGTTCCCACAATCCCTGCCCCCACACTCAGACCCCGGC  888

Query  889  ATGGAAAGCGAGCAGGCCATGCTCTCCGAAAGAGAATACGAGAGACCCAAGCCCAGCAACGGGGTCCTGAGGCA  962
            |||||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  889  ATGGAGAGTGAGCAGGCCATGCTCCCAGAAAGAGAATATGAGAGGCCCAAGCCCAGCAATGGGGTCCTGAGACA  962

Query  963  CCCCCTGGAGCCAGACAGCAGTGCCTCCTGTTTCCAGCAGCTGAGAGTGATCCCGAAGGTCACCAAGCACCTGC  1036
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCCTCTGGAGCCAGACAGCAGTGCCTCCTGTTTCCAGCAACTGAGAGTGATCCCCAAGGTCACCAAGCACCTGC  1036

Query 1037  TCTCAAACCCTGTGTTCACCTGCATCATCCTGGCCGCCTGCATGGAGATTGCAGTGGTGGCTGGCTTCGCTGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTCAAACCCTGTGTTCACCTGCATCGTCCTGGCTGCTTGCATGGAGATTGCTGTGGTGGCTGGCTTCGCTGCC  1110

Query 1111  TTTTTGGGGAAGTACCTGGAGCAGCAGTTTAACCTCACCACCTCTTCTGCCAACCAGCTGCTTGGGATGACTGC  1184
            ||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1111  TTCCTCGGCAAGTACCTGGAACAGCAGTTTAACCTCACCACTTCCTCTGCCAACCAGCTGCTCGGGATGACGGC  1184

Query 1185  GATCCCGTGTGCTTGTCTGGGTATCTTCCTGGGAGGTCTTTTGGTGAAGAAGCTCAGCCTGTCTGCCCTGGGGG  1258
            ||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GATCCCCTGTGCCTGCCTGGGCATCTTTCTGGGTGGCCTTTTGGTGAAGAAGCTGAGCCTGTCTGCCCTGGGGG  1258

Query 1259  CCATTCGGATGGCCATGCTCGTCAACCTGGTGTCCACTGCTTGCTACGTCTCCTTCCTCTTCCTGGGCTGCGAC  1332
            |||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  CCATTCGAATGGCCATGCTGGTCAACCTGGTGTCCACAGCCTGCTACGTCTCCTTCCTCTTCCTGGGCTGTGAC  1332

Query 1333  ACTGGCCCTGTGGCTGGGGTTACTGTTCCCTATGGAAACAGCACAGCACCTGGCTCAGCCCTGGACCCCTACTC  1406
            ||.|||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||||.|.||||||.||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1333  ACAGGCCCTGTGGCTGGGGTCACTGTTCGCTACGGAAACAACTCAGCACGTGGCTCGGCCCTTGACCCTTACTC  1406

Query 1407  GCCCTGCAATAATAACTGTGAATGCCAAACCGATTCCTTCACTCCAGTGTGTGGGGCAGATGGCATCACCTACC  1480
            .||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCGTGCAACAACAACTGTGAATGCCAGACGGACTCCTTCACGCCAGTGTGCGGGGCCGATGGCATCACCTACC  1480

Query 1481  TGTCTGCCTGCTTTGCTGGCTGCAACAGCACGAATCTCACGGGCTGTGCGTGCCTCACCACCGTCCCTGCTGAG  1554
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1481  TGTCAGCCTGCTTCGCCGGATGCAACAGCACGAACCTCACAGGCTGTGCGTGCCTCACCACTGTCCCCCCTGAG  1554

Query 1555  AACGCAACCGTGGTTCCTGGAAAATGCCCCAGTCCTGGGTGCCAAGAGGCCTTCCTCACTTTCCTCTGTGTGAT  1628
            ||.||.|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  AATGCCAGCGTGGTTCCAGGAAAATGTCCCAGTCCTGGGTGCCAAGAGGCCTTCCTCACCTTCCTCTGTGTGAT  1628

Query 1629  GTGTATCTGCAGCCTGATCGGTGCCATGGCACAGACACCCTCAGTCATCATCCTCATCAGGACAGTCAGCCCTG  1702
            ||||.|.||||||.|||||||.||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGTGTGTGCAGCTTGATCGGGGCCATGGCCCAAACCCCTTCTGTCATCATCCTCATCAGGACAGTCAGCCCTG  1702

Query 1703  AACTCAAGTCTTACGCTTTGGGAGTTCTTTTTCTCCTCCTTCGTTTGTTGGGCTTCATCCCTCCACCCCTCATC  1776
            |||||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1703  AACTCAAGTCTTATGCGCTGGGAGTTCTTTTTCTGCTCCTTCGTTTGTTGGGTTTCATCCCCCCACCTCTCATC  1776

Query 1777  TTCGGGGCTGGCATCGACTCCACCTGCCTGTTCTGGAGCACGTTCTGTGGGGAGCAAGGCGCCTGCGTCCTCTA  1850
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1777  TTCGGGGCCGGCATTGACTCCACCTGTCTGTTCTGGAGCACCTTCTGCGGGGAACAAGGCGCCTGTGTCCTCTA  1850

Query 1851  CGACAATGTGGTCTACCGATACCTGTATGTCAGCATCGCCATCGCGCTCAAATCCTTCGCCTTCATCCTGTACA  1924
            ||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1851  CGACAATGTGGTCTACAGATACCTGTACGTCAGCATCGCCATTGCGCTCAAGTCCTTTGCCTTCATCCTCTACA  1924

Query 1925  CCACCACGTGGCAGTGCCTGAGGAAAAACTATAAACGCTACATCAAAAACCACGAGGGCGGGCTGAGCACCAGC  1998
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCACCACGTGGCAGTGCCTGCGGAAAAACTATAAACGCTACATCAAAAACCACGAGGGCGGGCTGAGCACCAGC  1998

Query 1999  ACAGAGTACCAAGACATTGAGACTGAGAAAACCTGCCCCGAATCACATTCACCTTCAGAAGACTCCTTTGTGAG  2072
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1999  ACAGAGTATCAAGACATTGAGACAGAGAAAACCTGCCCTGAGTCACAGTCACCTTCAGAAGACTCCTTTGTGCG  2072

Query 2073  AAGC  2076
            ||||
Sbjct 2073  AAGC  2076