Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08095
• Subject: NM_001317984.1
• Aligned Length: 1857
• Identities: 1852
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTTCTGTCATGGCTAACAGTTCTAGGGGCTGGAATGGTCGTCCTGCACTTCGTGCAGAAACTCCTGTTCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCTTCTGTCATGGCTAACAGTTCTAGGGGCTGGAATGGTCGTCCTGCACTTCTTGCAGAAACTCCTGTTCCC  74

Query   75  TTACTTTTGGGATGACTTCTGGTTCGTGTTGAAGGTGGTGCTCATTATAATTCGGCTGAAGAAGTACGAAAAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  TTACTTTTGGGATGACTTCTGGTTCGTGTTGAAGGTGGTGCTCATTATAATTCGGCTGAAGAAGTATGAAAAGA  148

Query  149  GAGGGGAGCTGGTGACTGTGCTGGATAAATTCTTGAGTCATGCCAAAAGACAACCTCGGAAACCTTTCATCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGGGGAGCTGGTGACTGTGCTGGATAAATTCTTGAGTCATGCCAAAAGACAACCTCGGAAACCTTTCATCATC  222

Query  223  TATGAGGGAGACATCTACACCTATCAGGATGTAGACAAAAGGAGCAGCAGAGTGGCCCATGTCTTCCTGAACCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TATGAGGGAGACATCTACACCTATCAGGATGTAGACAAAAGGAGCAGCAGAGTGGCCCATGTCTTCCTGAACCA  296

Query  297  TTCCTCTCTGAAAAAGGGGGACACGGTGGCTCTGCTGATGAGCAATGAGCCGGACTTCGTTCACGTGTGGTTCG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCCTCTCTGAAAAAGGGGGACACGGTGGCTCTGCTGATGAGCAATGAGCCGGACTTCGTTCACGTGTGGTTCG  370

Query  371  GCCTCGCCAAGCTGGGCTGCGTGGTGGCCTTTCTCAACACCAACATTCGCTCCAACTCCCTCCTGAATTGCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTCGCCAAGCTGGGCTGCGTGGTGGCCTTTCTCAACACCAACATTCGCTCCAACTCCCTCCTGAATTGCATC  444

Query  445  CGCGCCTGTGGGCCCAGAGCCCTAGTGGTGGGCGCAGATTTGCTTGGGACGGTAGAAGAAATCCTTCCAAGCCT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCGCCTGTGGGCCCAGAGCCCTAGTGGTGGGCGCAGATTTGCTTGGAACGGTAGAAGAAATCCTTCCAAGCCT  518

Query  519  CTCAGAAAATATCAGTGTTTGGGGGATGAAAGATTCTGTTCCACAAGGTGTAATTTCACTCAAAGAAAAACTGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTCAGAAAATATCAGTGTTTGGGGGATGAAAGATTCTGTTCCACAAGGTGTAATTTCACTCAAAGAAAAACTGA  592

Query  593  GCACCTCACCTGATGAGCCCGTGCCACGCAGCCACCATGTTGTCTCACTCATCAAGTCTACTTGTCTTTACATT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCACCTCACCTGATGAGCCCGTGCCACGCAGCCACCATGTTGTCTCACTCCTCAAGTCTACTTGTCTTTACATT  666

Query  667  TTTACCTCTGGAACAACAGGTCTACCAAAAGCAGCTGTGATTAGTCAGCTGCAGGTTTTAAGGGGTTCTGCTGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTACCTCTGGAACAACAGGTCTACCAAAAGCAGCTGTGATTAGTCAGCTGCAGGTTTTAAGGGGTTCTGCTGT  740

Query  741  CCTGTGGGCTTTTGGTTGTACTGCTCATGACATTGTTTATATAACCCTTCCTCTGTATCATAGTTCAGCAGCTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCTGTGGGCTTTTGGTTGTACTGCTCATGACATTGTTTATATAACCCTTCCTCTGTATCATAGTTCAGCAGCTA  814

Query  815  TCCTGGGAATTTCTGGATGTGTTGAGTTGGGTGCCACTTGTGTGTTAAAGAAGAAATTTTCAGCAAGCCAGTTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCCTGGGAATTTCTGGATGTGTTGAGTTGGGTGCCACTTGTGTGTTAAAGAAGAAATTTTCAGCAAGCCAGTTT  888

Query  889  TGGAGTGACTGCAAGAAGTATGATGTGACTGTGTTTCAGTATATTGGAGAACTTTGTCGCTACCTTTGCAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGGAGTGACTGCAAGAAGTATGATGTGACTGTGTTTCAGTATATTGGAGAACTTTGTCGCTACCTTTGCAAACA  962

Query  963  ATCTAAGAGAGAAGGAGAAAAGGATCATAAGGTGCGTTTGGCAATTGGAAATGGCATACGGAGTGATGTATGGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCTAAGAGAGAAGGAGAAAAGGATCATAAGGTGCGTTTGGCAATTGGAAATGGCATACGGAGTGATGTATGGA  1036

Query 1037  GAGAATTTTTAGACAGATTTGGAAATATAAAGGTGTGTGAACTTTATGCAGCTACCGAATCAAGCATATCTTTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GAGAATTTTTAGACAGATTTGGAAATATAAAGGTGTGTGAACTTTATGCAGCTACCGAATCAAGCATATCTTTC  1110

Query 1111  ATGAACTACACTGGGAGAATTGGAGCAATTGGGAGAACAAATTTGTTTTACAAACTTCTTTCCACTTTTGACTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGAACTACACTGGGAGAATTGGAGCAATTGGGAGAACAAATTTGTTTTACAAACTTCTTTCCACTTTTGACTT  1184

Query 1185  AATAAAGTATGACTTTCAGAAAGATGAACCCATGAGAAATGAGCAGGGTTGGTGTATTCATGTGAAAAAAGGAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AATAAAGTATGACTTTCAGAAAGATGAACCCATGAGAAATGAGCAGGGTTGGTGTATTCATGTGAAAAAAGGAG  1258

Query 1259  AACCTGGACTTCTCATTTCTCGAGTGAATGCAAAAAATCCCTTCTTTGGCTATGCTGGGCCTTATAAGCACACA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  AACCTGGACTTCTCATTTCTCGAGTGAATGCAAAAAATCCCTTCTTTGGCTATGCTGGGCCTTATAAGCACACA  1332

Query 1333  AAAGACAAATTGCTTTGTGATGTTTTTAAGAAGGGAGATGTTTACCTTAATACTGGAGACTTAATAGTCCAGGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGACAAATTGCTTTGTGATGTTTTTAAGAAGGGAGATGTTTACCTTAATACTGGAGACTTAATAGTCCAGGA  1406

Query 1407  TCAGGACAATTTCCTTTATTTTTGGGACCGTACTGGAGACACTTTCAGATGGAAAGGAGAAAATGTCGCAACCA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAGGACAATTTCCTTTATTTTTGGGACCGTACTGGAGACACTTTCAGATGGAAAGGAGAAAATGTCGCAACCA  1480

Query 1481  CTGAGGTTGCTGATGTTATTGGAATGTTGGATTTCATACAGGAAGCAAACGTCTATGGTGTGGCTATATCAGGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGAGGTTGCTGATGTTATTGGAATGTTGGATTTCATACAGGAAGCAAACGTCTATGGTGTGGCTATATCAGGT  1554

Query 1555  TATGAAGGAAGAGCAGGAATGGCTTCTATTATTTTAAAACCAAATACATCTTTAGATTTGGAAAAAGTTTATGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TATGAAGGAAGAGCAGGAATGGCTTCTATTATTTTAAAACCAAATACATCTTTAGATTTGGAAAAAGTTTATGA  1628

Query 1629  ACAAGTTGTAACATTTCTACCAGCTTATGCTTGTCCACGATTTTTAAGAATTCAGGAAAAAATGGAAGCAACAG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACAAGTTGTAACATTTCTACCAGCTTATGCTTGTCCACGATTTTTAAGAATTCAGGAAAAAATGGAAGCAACAG  1702

Query 1703  GAACATTCAAACTATTGAAGCATCAGTTGGTGGAAGATGGATTTAATCCACTGAAAATTTCTGAACCACTTTAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GAACATTCAAACTATTGAAGCATCAGTTGGTGGAAGATGGATTTAATCCACTGAAAATTTCTGAACCACTTTAC  1776

Query 1777  TTCATGGATAACTTGAAAAAGTCTTATGTTCTACTGACCAGGGAACTTTATGATCAAATAATGTTAGGGGAAAT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TTCATGGATAACTTGAAAAAGTCTTATGTTCTACTGACCAGGGAACTTTATGATCAAATAATGTTAGGGGAAAT  1850

Query 1851  AAAACTT  1857
            |||||||
Sbjct 1851  AAAACTT  1857