Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08115
• Subject: XR_001751895.1
• Aligned Length: 3869
• Identities: 3486
• Gaps: 382

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGCGGGCGGGGAAGA  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  AGAAGCTGCACTGGGGCCGGGACTCGGAGGCGCGCTGCGTGAGCCGGCCGCAGAGCCATGGCGGGCGGGGAAGA  74

Query   18  CCGCGGGGACGGAGAGCCGGTATCAGTGGTGACCGTGAGGGTGCAGTACCTGGAAGACACCGACCCCTTCGCAT  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGCGGGGACGGAGAGCCGGTATCAGTGGTGACCGTGAGGGTGCAGTACCTGGAAGACACCGACCCCTTCGCAT  148

Query   92  GTGCCAACTTTCCGGAGCCGCGCCGGGCCCCCACCTGCAGCCTGGACGGGGCGCTGCCCTTGGGCGCGCAGATA  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGCCAACTTTCCGGAGCCGCGCCGGGCCCCCACCTGCAGCCTGGACGGGGCGCTGCCCTTGGGCGCGCAGATA  222

Query  166  CCCGCGGTGCACCGCCTGCTGGGAGCGCCGCTCAAGTTGGAGGATTGTGCTCTGCAAGTGTCTCCCTCCGGATA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCGCGGTGCACCGCCTGCTGGGAGCGCCGCTCAAGTTGGAGGATTGTGCTCTGCAAGTGTCTCCCTCCGGATA  296

Query  240  CTACCTGGACACCGAGCTGTCCCTGGAAGAGCAGCGGGAGATGCTGGAGGGCTTCTATGAAGAGATCAGCAAAG  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTACCTGGACACCGAGCTGTCCCTGGAAGAGCAGCGGGAGATGCTGGAGGGCTTCTATGAAGAGATCAGCAAAG  370

Query  314  GGCGGAAGCCCACGCTGATCCTTCGGACCCAGCTCTCTGTGAGGGTCAACGCTATCTTGGAAAAGCTGTATAGC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGCGGAAGCCCACGCTGATCCTTCGGACCCAGCTCTCTGTGAGGGTCAACGCTATCTTGGAAAAGCTGTATAGC  444

Query  388  TCCAGTGGTCCTGAGCTCCGCCGCTCCCTCTTCTCACTGAAGCAGATCTTCCAGGAGGACAAAGACCTGGTGCC  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCCAGTGGTCCTGAGCTCCGCCGCTCCCTCTTCTCACTGAAGCAGATCTTCCAGGAGGACAAAGACCTGGTGCC  518

Query  462  TGAATTTGTGCATTCAGAGGGGCTGAGCTGCCTGATCCGTGTGGGTGCTGCTGCCGACCACAACTACCAGAGCT  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAATTTGTGCATTCAGAGGGGCTGAGCTGCCTGATCCGTGTGGGTGCTGCTGCCGACCACAACTACCAGAGCT  592

Query  536  ACATCCTTAGAGCGCTCGGCCAGCTGATGCTCTTTGTGGATGGAATGCTGGGGGTGGTGGCCCACAGTGACACT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACATCCTTAGAGCGCTCGGCCAGCTGATGCTCTTTGTGGATGGAATGCTGGGGGTGGTGGCCCACAGTGACACT  666

Query  610  ATTCAGTGGCTGTACACATTGTGTGCCAGCCTGTCCCGCTTGGTGGTGAAGACAGCCCTGAAGCTGCTGTTGGT  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTCAGTGGCTGTACACATTGTGTGCCAGCCTGTCCCGCTTGGTGGTGAAGACAGCCCTGAAGCTGCTGTTGGT  740

Query  684  GTTTGTAGAATACTCCGAAAACAACGCACCGCTGTTCATCCGTGCAGTGAACTCTGTGGCCAGCACCACCGGTG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTTGTAGAATACTCCGAAAACAACGCACCGCTGTTCATCCGTGCAGTGAACTCTGTGGCCAGCACCACCGGTG  814

Query  758  CTCCTCCCTGGGCCAATCTGGTGTCCATCCTGGAGGAGAAGAATGGCGCTGACCCTGAGTTGTTGGTGTACACG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCCTCCCTGGGCCAATCTGGTGTCCATCCTGGAGGAGAAGAATGGCGCTGACCCTGAGTTGTTGGTGTACACG  888

Query  832  GTCACCCTCATCAACAAGACGCTGGCGGCGCTCCCGGACCAGGACTCCTTCTACGATGTGACGGATGCACTGGA  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTCACCCTCATCAACAAGACGCTGGCGGCGCTCCCGGACCAGGACTCCTTCTACGATGTGACGGATGCACTGGA  962

Query  906  GCAGCAGGGCATGGAAGCGCTGGTCCAGCGCCACCTGGGCACTGCGGGCACTGACGTCGACCTGCGCACGCAGC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCAGCAGGGCATGGAAGCGCTGGTCCAGCGCCACCTGGGCACTGCGGGCACTGACGTCGACCTGCGCACGCAGC  1036

Query  980  TTGTGCTCTACGAGAACGCCCTGAAATTGGAGGATGGAGACATCGAAGAAGCCCCAGGCGCTGGTGGGCGGCGG  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TTGTGCTCTACGAGAACGCCCTGAAATTGGAGGATGGAGACATCGAAGAAGCCCCAGGCGCTGGTGGGCGGCGG  1110

Query 1054  GAACGACGAAAGCCTTCTTCTGAGGAGGGCAAGAGGAGCCGCCGTTCTCTGGAAGGCGGGGGCTGCCCCGCGCG  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAACGACGAAAGCCTTCTTCTGAGGAGGGCAAGAGGAGCCGCCGTTCTCTGGAAGGCGGGGGCTGCCCCGCGCG  1184

Query 1128  TGCCCCGGAACCTGGCCCCACAGGCCCCGCCTCACCGGTAGGCCCCACCTCTTCCACCGGCCCCGCCCTGCTGA  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCCCGGAACCTGGCCCCACAGGCCCCGCCTCACCGGTAGGCCCCACCTCTTCCACCGGCCCCGCCCTGCTGA  1258

Query 1202  CAGGCCCCGCCTCCAGCCCTGTGGGCCCTCCCTCCGGTCTCCAAGCTTCAGTGAACCTTTTTCCTACCATCTCT  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CAGGCCCCGCCTCCAGCCCTGTGGGCCCTCCCTCCGGTCTCCAAGCTTCAGTGAACCTTTTTCCTACCATCTCT  1332

Query 1276  GTGGCACCCTCAGCTGACACCTCCAGCGAGAGGAGCATCTACA-------------------------------  1318
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct 1333  GTGGCACCCTCAGCTGACACCTCCAGCGAGAGGAGCATCTACAAACTTCACCAAACTGCTTCCGTTTGGGCCCC  1406

Query 1319  -----------------------------------------------AAGCCCGGTTCCTGGAGAATGTGGCGG  1345
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAGAGCCCACCCGTCCCCCAGTCCCCTCCTGGGCAGGCCAGGCTGGAAGCCCGGTTCCTGGAGAATGTGGCGG  1480

Query 1346  CAGCAGAAACAGAGAAGCAGGTTGCGCTGGCCCAGGGCCGGGCAGAGACACTTGCCGGGGCCATGCCCAATGAG  1419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGCAGAAACAGAGAAGCAGGTTGCGCTGGCCCAGGGCCGGGCAGAGACACTTGCCGGGGCCATGCCCAATGAG  1554

Query 1420  GCGGGTGGACACCCAGATGCCCGGCAACTCTGGGACTCCCCAGAGACAGCCCCTGCAGCCAGAACACCCCAGAG  1493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCGGGTGGACACCCAGATGCCCGGCAACTCTGGGACTCCCCAGAGACAGCCCCTGCAGCCAGAACACCCCAGAG  1628

Query 1494  CCCTGCCCCCTGTGTCCTGCTCCGGGCCCAGCGAAGCCTTGCACCAGAGCCCAAGGAGCCACTGATACCAGCAA  1567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCTGCCCCCTGTGTCCTGCTCCGGGCCCAGCGAAGCCTTGCACCAGAGCCCAAGGAGCCACTGATACCAGCAA  1702

Query 1568  GCCCCAAGGCTGAGCCCATCTGGGAGCTCCCTACCCGTGCACCCAGGCTCTCTATTGGGGACCTGGACTTTTCA  1641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCCCAAGGCTGAGCCCATCTGGGAGCTCCCTACCCGTGCACCCAGGCTCTCTATTGGGGACCTGGACTTTTCA  1776

Query 1642  GATCTAGGGGAGGATGAAGACCAGGACATGCTGAATGTAGAGTCTGTGGAGGCTGGGAAAGACATCCCAGCTCC  1715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATCTAGGGGAGGATGAAGACCAGGACATGCTGAATGTAGAGTCTGTGGAGGCTGGGAAAGACATCCCAGCTCC  1850

Query 1716  CTCACCCCCACTGCCCCTGCTCTCGGGAGTACCCCCCCCTCCCCCACTTCCACCTCCCCCACCCATCAAAGGCC  1789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTCACCCCCACTGCCCCTGCTCTCGGGAGTACCCCCCCCTCCCCCACTTCCACCTCCCCCACCCATCAAAGGCC  1924

Query 1790  CCTTCCCACCACCTCCACCTCTACCTCTGGCTGCCCCTCTTCCCCATTCAGTGCCTGACAGCTCAGCCCTCCCC  1863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCTTCCCACCACCTCCACCTCTACCTCTGGCTGCCCCTCTTCCCCATTCAGTGCCTGACAGCTCAGCCCTCCCC  1998

Query 1864  ACTAAGAGGAAGACAGTAAAACTTTTCTGGCGTGAGCTGAAGCTGGCTGGGGGCCATGGAGTCTCTGCAAGCCG  1937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ACTAAGAGGAAGACAGTAAAACTTTTCTGGCGTGAGCTGAAGCTGGCTGGGGGCCATGGAGTCTCTGCAAGCCG  2072

Query 1938  CTTTGGGCCCTGCGCCACCCTCTGGGCTTCACTGGACCCTGTCTCAGTGGACACGGCCCGACTGGAACACCTCT  2011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CTTTGGGCCCTGCGCCACCCTCTGGGCTTCACTGGACCCTGTCTCAGTGGACACGGCCCGACTGGAACACCTCT  2146

Query 2012  TTGAGTCTCGTGCCAAAGAGGTGCTGCCCTCCAAGAAAGCTGGAGAGGGCCGCCGGACAATGACCACAGTGCTG  2085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TTGAGTCTCGTGCCAAAGAGGTGCTGCCCTCCAAGAAAGCTGGAGAGGGCCGCCGGACAATGACCACAGTGCTG  2220

Query 2086  GACCCCAAGCGCAGCAACGCCATCAACATCGGCCTAACCACACTGCCACCTGTGCATGTCATTAAGGCTGCTCT  2159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GACCCCAAGCGCAGCAACGCCATCAACATCGGCCTAACCACACTGCCACCTGTGCATGTCATTAAGGCTGCTCT  2294

Query 2160  GCTCAACTTTGATGAGTTTGCTGTCAGCAAGGATGGCATTGAGAAGCTACTGACCATGATGCCCACGGAGGAAG  2233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCTCAACTTTGATGAGTTTGCTGTCAGCAAGGATGGCATTGAGAAGCTACTGACCATGATGCCCACGGAGGAAG  2368

Query 2234  AGCGGCAGAAGATTGAGGAAGCCCAGCTGGCCAACCCTGACATACCCCTGGGCCCAGCCGAGAACTTCCTGATG  2307
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGCGGCAGAAGATTGAGGAAGCCCAGCTGGCCAACCCTGACATACCCCTGGGCCCAGCCGAGAACTTCCTGATG  2442

Query 2308  ACTCTTGCCTCCATTGGCGGCCTCGCTGCTCGTCTACAACTCTGGGCCTTCAAGCTGGACTATGACAGCATGGA  2381
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  ACTCTTGCCTCCATTGGCGGCCTCGCTGCTCGTCTACAACTCTGGGCCTTCAAGCTGGACTATGACAGCATGGA  2516

Query 2382  GCGGGAAATTGCTGAGCCACTGTTTGACCTGAAAGTGGGTATGGAACAGCTGGTACAGAATGCCACCTTCCGCT  2455
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GCGGGAAATTGCTGAGCCACTGTTTGACCTGAAAGTGGGTATGGAACAGCTGGTACAGAATGCCACCTTCCGCT  2590

Query 2456  GCATCCTGGCTACCCTCCTAGCTGTGGGCAACTTCCTCAATGGCTCCCAGAGCAGCGGCTTTGAGCTGAGCTAC  2529
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCATCCTGGCTACCCTCCTAGCGGTGGGCAACTTCCTCAATGGCTCC-----CAGCGGCTTTGAGCTGAGCTAC  2659

Query 2530  CTGGAGAAGGTGTCAGAGGTGAAGGACACGGTGCGTCGACAGTCACTGCTACACCATCTCTGCTCCCTAGTGCT  2603
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660  CTGGAGAAGGTGTCAGAGGTGAAGGACACGGTGCGTCGACAGTCACTGCTACACCATCTCTGCTCCCTAGTGCT  2733

Query 2604  CCAGACCCGGCCTGAGTCCTCTGACCTCTATTCAGAAATCCCTGCCCTGACCCGCTGTGCCAAGGTGGACTTTG  2677
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734  CCAGACCCGGCCTGAGTCCTCTGACCTCTATTCAGAAATCCCTGCCCTGACCCGCTGTGCCAAGGTGGACTTTG  2807

Query 2678  AACAGCTGACTGAGAACCTGGGGCAGCTGGAGCGCCGGAGCCGGGCAGCCGAGGAGAGCCTGCGGAGCTTGGCC  2751
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808  AACAGCTGACTGAGAACCTGGGGCAGCTGGAGCGCCGGAGCCGGGCAGCCGAGGAGAGCCTGCGGAGCTTGGCC  2881

Query 2752  AAGCATGAGCTGGCCCCAGCCCTGCGTGCCCGCCTCACCCACTTCCTGGACCAGTGTGCCCGCCGTGTTGCCAT  2825
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882  AAGCATGAGCTGGCCCCAGCCCTGCGTGCCCGCCTCACCCACTTCCTGGACCAGTGTGCCCGCCGTGTTGCCAT  2955

Query 2826  GCTAAGGATAGTGCACCGCCGTGTCTGCAATAGGTTCCATGCCTTCCTGCTCTACCTGGGCTACACCCCGCAGG  2899
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956  GCTAAGGATAGTGCACCGCCGTGTCTGCAATAGGTTCCATGCCTTCCTGCTCTACCTGGGCTACACCCCGCAGG  3029

Query 2900  CGGCCCGTGAAGTGCGCATCATGCAGTTCTGCCACACGCTGCGGGAATTTGCGCTTGAGTATCGGACTTGCCGG  2973
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3030  CGGCCCGTGAAGTGCGCATCATGCAGTTCTGCCACACGCTGCGGGAATTTGCGCTTGAGTATCGGACTTGCCGG  3103

Query 2974  GAACGAGTGCTACAGCAGCAGCAGAAGCAGGCCACATACCGTGAGCGCAACAAGACCCGGGGACGCATGATCAC  3047
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3104  GAACGAGTGCTACAGCAGCAGCAGAAGCAGGCCACATACCGTGAGCGCAACAAGACCCGGGGACGCATGATCAC  3177

Query 3048  CGAGACAGAGAAGTTCTCAGGTGTGGCTGGGGAAGCCCCCAGCAACCCCTCTGTCCCAGTAGCAGTGAGCAGCG  3121
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3178  CGAGACAGAGAAGTTCTCAGGTGTGGCTGGGGAAGCCCCCAGCAACCCCTCTGTCCCAGTAGCAGTGAGCAGCG  3251

Query 3122  GGCCAGGCCGGGGAGATGCTGACAGTCATGCTAGTATGAAGAGTCTGCTGACCAGCAGGCCTGAGGACACCACA  3195
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3252  GGCCAGGCCGGGGAGATGCTGACAGTCATGCTAGTATGAAGAGTCTGCTGACCAGCAGGCCTGAGGACACCACA  3325

Query 3196  CACAATCGCCGCAGCAGAGGCATGGTCCAGAGCAGCTCCCCAATCATGCCCACAGTGGGGCCCTCCACTGCATC  3269
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3326  CACAATCGCCGCAGCAGAGGCATGGTCCAGAGCAGCTCCCCAATCATGCCCACAGTGGGGCCCTCCACTGCATC  3399

Query 3270  CCCAGAAGAACCCCCAGGCTCCAGTTTACCCAGTGATACATCAGATGAGATCATGGACCTTCTGGTGCAGTCAG  3343
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3400  CCCAGAAGAACCCCCAGGCTCCAGTTTACCCAGTGATACATCAGATGAGATCATGGACCTTCTGGTGCAGTCAG  3473

Query 3344  TGACCAAGAGCAGTCCTCGTGCCTTAGCTGCTAGGGAACGCAAGCGTTCCCGCGGCAACCGCAAGTCTTTGAGA  3417
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3474  TGACCAAGAGCAGTCCTCGTGCCTTAGCTGCTAGGGAACGCAAGCGTTCCCGCGGCAACCGCAAGTCTTTGAGA  3547

Query 3418  AGGACGTTGAAGAGTGGGCTCGGAGATGACCTGGTGCAGGCACTGGGACTAAGCAAGGGTCCTGGCCTGGAGGT  3491
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3548  AGGACGTTGAAGAGTGGGCTCGGAGATGACCTGGTGCAGGCACTGGGACTAAGCAAGGGTCCTGGCCTGGAGGT  3621

Query 3492  G-------------------------------------------------------------------------  3492
            |                                                                         
Sbjct 3622  GTGAAGGTGCTGTATCCCGGAAATCTATCTGGACCCTGGACTGCAGTGCAGGAGATGACAGAGTGAGGAGGGCC  3695

Query 3493  --------------------------------------------------------------------------  3492
                                                                                      
Sbjct 3696  CAGAGCAGAATTCTGGCCCCAGAACTCTGTGCCCAGGAGCCATGCCTTGAGCAGTATTAGCCGTGTGTGTATGC  3769

Query 3493  --------------------------------------------------------------------------  3492
                                                                                      
Sbjct 3770  ATGTGAGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGCATGCATATGCATGTGCATGTGTGTGAGCTCCTTGAACGCACGGA  3843

Query 3493  ---------------------  3492
                                 
Sbjct 3844  GCAAAATAAAATTTTCTTAGC  3864