Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08160
- Subject:
- NM_001353893.1
- Aligned Length:
- 2070
- Identities:
- 1817
- Gaps:
- 252
Alignment
Query 1 ATGGTGGAGGCCATAGTGGAGTTTGACTACCAGGCCCAGCACGATGATGAGCTGACGATCAGCGTGGGTGAAAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CATCACCAACATCAGGAAGGAGGATGGAGGCTGGTGGGAGGGACAGATCAACGGCAGGAGAGGTTTGTTCCCTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 ACAACTTTGTAAGAGAAATAAAGAAAGAGATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----------------------------ATGAAGAAAGACCCTCTCACCAACAAAGCTCCAGAAAAGCCCCTG 45
Query 223 CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 46 CACGAAGTGCCCAGTGGAAACTCTTTGCTGTCTTCTGAAACGATTTTAAGAACCAATAAGAGAGGCGAGCGACG 119
Query 297 GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 120 GAGGCGCCGGTGCCAGGTGGCATTCAGCTACCTGCCCCAGAATGACGATGAACTTGAGCTGAAAGTTGGCGACA 193
Query 371 TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 194 TCATAGAGGTGGTAGGAGAGGTAGAGGAAGGATGGTGGGAAGGTGTTCTCAACGGGAAGACTGGAATGTTTCCT 267
Query 445 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 268 TCCAACTTCATCAAGGAGCTGTCAGGGGAGTCGGATGAGCTTGGCATTTCCCAGGATGAGCAGCTATCCAAGTC 341
Query 519 A------------------------------------------------------------------------- 519
|
Sbjct 342 AAGAAAGACTACCTTTGAAGGGACAATTCTGTACCGAGCTGCACCGGGAAAGACGGAGGGCCACAGACGCTATT 415
Query 520 --AGTTTAAGGGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAAC 591
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 416 ACAGTTTAAGGGAAACCACAGGCTCCGAGAGTGATGGGGGTGACTCAAGCAGCACCAAGTCTGAAGGTGCCAAC 489
Query 592 GGGACAGTGGCAACTGCAGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAA 665
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 490 GGGACAGTGGCAACTGCAGCAATCCAGCCCAAGAAAGTTAAGGGAGTGGGCTTTGGAGACATTTTCAAAGACAA 563
Query 666 GCCAATCAAACTAAGACCAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGA 739
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 564 GCCAATCAAACTAAGACCAAGGTCAATTGAAGTAGAAAATGACTTTCTGCCGGTAGAAAAGACTATTGGGAAGA 637
Query 740 AGTTACCTGCAACTACAGCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTAC 813
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 638 AGTTACCTGCAACTACAGCAACTCCAGACTCATCAAAAACAGAAATGGACAGCAGGACAAAGAGCAAGGATTAC 711
Query 814 TGCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCT 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 712 TGCAAAGTAATATTTCCATATGAGGCACAGAATGATGATGAATTGACAATCAAAGAAGGAGATATAGTCACTCT 785
Query 888 CATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATA 961
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 786 CATCAATAAGGACTGCATCGACGTAGGCTGGTGGGAAGGAGAGCTGAACGGCAGACGAGGCGTGTTCCCCGATA 859
Query 962 ACTTCGTGAAGTTACTTCCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCT 1035
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 860 ACTTCGTGAAGTTACTTCCACCGGACTTTGAAAAGGAAGGGAATAGACCCAAGAAGCCACCGCCTCCATCCGCT 933
Query 1036 CCTGTCATCAAACAAGGGGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGA 1109
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 934 CCTGTCATCAAACAAGGGGCAGGCACCACTGAGAGAAAACATGAAATTAAAAAGATACCTCCTGAAAGACCAGA 1007
Query 1110 AATGCTTCCAAACAGAACAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCG 1183
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1008 AATGCTTCCAAACAGAACAGAAGAAAAAGAAAGACCAGAGAGAGAGCCAAAACTGGATTTACAGAAGCCCTCCG 1081
Query 1184 TTCCTGCCATACCGCCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCG 1257
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1082 TTCCTGCCATACCGCCAAAAAAGCCTCGGCCACCTAAGACCAATTCTCTCAGCAGACCTGGCGCACTGCCCCCG 1155
Query 1258 AGAAGGCCGGAGAGACCGGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAG 1331
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1156 AGAAGGCCGGAGAGACCGGTGGGTCCGCTGACACACACCAGGGGTGACAGTCCAAAGATTGACTTGGCCGGCAG 1229
Query 1332 TTCGCTATCTGGCATCCTGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCG 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1230 TTCGCTATCTGGCATCCTGGACAAAGATCTCTCGGACCGCAGCAATGACATTGACTTAGAAGGTTTTGACTCCG 1303
Query 1406 TGGTATCATCTACTGAGAAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCC 1479
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1304 TGGTATCATCTACTGAGAAACTCAGTCATCCGACCACAAGCAGACCAAAAGCTACAGGGAGGCGGCCTCCGTCC 1377
Query 1480 CAGTCCCTCACATCTTCATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGA 1553
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1378 CAGTCCCTCACATCTTCATCCCTTTCAAGCCCTGATATCTTCGACTCCCCAAGTCCCGAAGAGGATAAGGAGGA 1451
Query 1554 ACACATTTCACTTGCGCACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGT 1627
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1452 ACACATTTCACTTGCGCACAGAGGAGTGGACGCGTCAAAGAAAACTTCCAAGACTGTTACCATATCCCAAGTGT 1525
Query 1628 CTGACAACAAAGCATCCCTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCC 1701
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1526 CTGACAACAAAGCATCCCTGCCGCCCAAGCCGGGGACCATGGCAGCAGGTGGCGGTGGGCCAGCCCCTCTGTCC 1599
Query 1702 TCAGCGGTGCCCTCCCCCCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGG 1775
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1600 TCAGCGGCGCCCTCCCCCCTGTCATCCTCTTTGGGAACAGCTGGACACAGAGCCAACTCCCCGTCTCTGTTCGG 1673
Query 1776 CACGGAAGGAAAACCAAAGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCC 1849
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1674 CACGGAAGGAAAACCAAAGATGGAGCCTGCGGCCAGCAGCCAGGCGGCCGTGGAGGAGCTAAGGACACAGGTCC 1747
Query 1850 GCGAGCTGAGGAGCATCATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTG 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1748 GCGAGCTGAGGAGCATCATCGAGACCATGAAGGACCAGCAGAAACGAGAGATTAAACAGTTATTGTCTGAGTTG 1821
Query 1924 GATGAAGAGAAGAAAATCCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA 1995
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1822 GATGAAGAGAAGAAAATCCGGCTTCGGTTGCAGATGGAAGTGAACGACATAAAGAAAGCTCTACAATCAAAA 1893