Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08182
- Subject:
- XM_011241366.1
- Aligned Length:
- 900
- Identities:
- 736
- Gaps:
- 87
Alignment
Query 1 ---------------------------------------------------------ATGAGTGCGGACGTGAA 17
|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGGGGTGCACGTGCTCCAGAAATCTTGAGGCCAGAGCCCCGCACCTCGGCGCAGCCATGAGTGCGGAGGTGAA 74
Query 18 GGTGACAGGGCAGAACCAGGAGCAATTTCTGCTCCTAGCCAAGTCGGCCAAGGGGGCAGCGCTGGCCACACTCA 91
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 GGTGACAGGGCAGAACCAAGAGCAGTTTCTGCTCCTTGCCAAGTCGGCTAAGGGGGCGGCACTGGCCACACTCA 148
Query 92 TCCATCAGGTGCTGGAGGCCCCTGGTGTCTACGTGTTTGGAGAACTGCTGGACATGCCCAATGTTAGAGAGCTG 165
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 149 TCCACCAGGTGCTGGAGGCCCCTGGTGTCTACGTGTTTGGGGAACTGCTGGATATGCCTAATGTTAGAGAGCTG 222
Query 166 GCTGAGAGTGACTTTGCCTCTACCTTCCGGCTGCTCACAGTGTTTGCTTATGGGACATACGCTGACTACTTAGC 239
||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GCAGAAAGCGACTTTGCCTCCACCTTCCGGCTGCTCACAGTGTTTGCCTATGGGACCTATGCGGACTACTTAGC 296
Query 240 TGAAGCCCGGAATCTTCCTCCACTAACAGAGGCTCAGAAGAATAAGCTTCGACACCTCTCAGTTGTCACCCTGG 313
|||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 297 TGAAGCCAGGAATCTCCCCCCACTGACTGACGCACAGAAGAATAAGCTTCGACATCTGTCAGTTGTCACTCTGG 370
Query 314 CTGCTAAAGTAAAGTGTATCCCATATGCAGTGTTGCTGGAGGCTCTTGCCCTGCGTAATGTGCGGCAGCTGGAA 387
||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 371 CTGCCAAAGTCAAGTGTATCCCATATGCAGTGTTGCTGGAGGCCCTTGCCCTTCGAAACGTGCGCCAGCTGGAA 444
Query 388 GACCTTGTGATTGAGGCTGTGTATGCTGACGTGCTTCGTGGCTCCCTGGACCAGCGCAACCAGCGGCTCGAGGT 461
|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 445 GACCTTGTGATCGAGGCTGTGTATGCTGATGTCCTTCGTGGCTCTCTGGACCAGCGCAATCAGCGGCTAGAGGT 518
Query 462 TGACTACAGCATCGGGCGGGACATCCAGCGCCAGGACCTCAGTGCCATTGCCCGAACCCTGCAGGAATGGTGTG 535
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||..||||||||.||.|||||.|
Sbjct 519 TGATTACAGCATCGGGCGGGACATCCAGCGCCAGGACCTCAGTGCCATCGCCCAGACCCTGCAAGAGTGGTGCG 592
Query 536 TGGGCTGTGAGGTCGTGCTGTCAGGCATTGAGGAGCAGGTGAGCCGTGCCAACCAACACAAGGAGCAGCAGCTG 609
|||||||||||||.|||.||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGGGCTGTGAGGTTGTGTTGTCGGGCATCGAAGAGCAGGTCAGCCGTGCCAACCAGCACAAGGAGCAGCAGCTG 666
Query 610 GGCCTGAAGCAGCAGATTGAGAGTGAGGTTGCCAACCTTAAAAAAACCATTAAAGTTACGACGGCAGCAGCAGC 683
|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 667 GGCCTGAAGCAGCAGATCGAAAGTGAGGTTGCCAACCTTAAGAAAACCATTAAAGTTACGACAGCAGCTGCTGC 740
Query 684 CGCAGCCACATCTCAGGACCCTGAGCAACACCTGACTGAGCTGAGGGAACCAGCTCCTGGCACCAACCAGCGCC 757
.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAGCCACCTCCCAGGATCCTGAGCAACACCTGACAGAGCTGAGAGAACCAGCTTCTGGCACCAACCAGCGCC 814
Query 758 AGCCCAGCAAGAAAGCCTCAAAGGGCAAGGGGCTCCGAGGGAGCGCCAAGATTTGGTCCAAGTCGAAT------ 825
|||||||||||||||||||.|||||||||||| ||| ||||||....||.||||.|.|
Sbjct 815 AGCCCAGCAAGAAAGCCTCCAAGGGCAAGGGG----GAG--------AAGATTAATCCCCAGTCCACTGTAAAG 876
Query 826 ------------ 825
Sbjct 877 CCAAGTGCCAAG 888