Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08183
• Subject: NM_010941.3
• Aligned Length: 1122
• Identities: 923
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGGAACCAGCAGT---TAGCGAGCCAATGAGAGACCAAGTCGCACGGACTCATTTGACAGAGGACACTCCCAA  71
            |||||||.|||.||   |.|.||..|||.|.|||.|||.|||.||.|.||.|||||||||.|.||||.|.||||
Sbjct    1  ATGGAACAAGCTGTTCATGGTGAATCAAAGCGAGGCCAGGTCACAGGAACACATTTGACAAATGACATTTCCAA  74

Query   72  AGTGAATGCTGACATAGAAAAGGTTAACCAGAATCAGGCCAAGAGATGCACAGTGATCGGGGGCTCTGGATTCC  145
            |                                    ||.||||..|||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct   75  A------------------------------------GCTAAGAAGTGCACAGTGATTGGAGGCTCTGGGTTCC  112

Query  146  TGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTGGCAAGAGGATATGCTGTCAATGTATTTGATATCCAGCAAGGGTTT  219
            ||||||||||||||||||||||||||||||...||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  113  TGGGGCAGCACATGGTGGAGCAGTTGCTGGAGCGAGGCTATACTGTCAATGTATTTGATATCCACCAAGGCTTT  186

Query  220  GATAATCCCCAGGTGCGGTTCTTTCTGGGTGACCTCTGCAGCCGACAGGATCTGTACCCAGCTCTGAAAGGTGT  293
            |||||.||||.|||||.|||||||.|.||.|||||.||||.||.||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  187  GATAACCCCCGGGTGCAGTTCTTTATAGGCGACCTGTGCAACCAACAGGACCTGTACCCAGCTCTCAAAGGTGT  260

Query  294  AAACACAGTTTTCCACTGTGCGTCACCCCCACCATCCAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTACA  367
            ||.|||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  261  AAGCACAGTTTTCCACTGCGCGTCCCCTCCGCCGTACAGTAACAACAAGGAGCTCTTTTATAGAGTGAATTTCA  334

Query  368  TTGGCACCAAGAATGTCATTGAAACTTGCAAAGAGGCTGGGGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGT  441
            ||||||||||||.||||||||||||.||||.||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  TTGGCACCAAGACTGTCATTGAAACCTGCAGAGAGGCCGGAGTTCAGAAACTCATTTTAACCAGCAGTGCCAGT  408

Query  442  GTCATCTTTGAGGGCGTCGATATCAAGAATGGAACTGAAGACCTTCCCTATGCCATGAAACCCATTGACTACTA  515
            ||..||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||
Sbjct  409  GTTGTCTTTGAGGGTGTTGACATAAAAAATGGAACTGAAGACCTCCCTTACGCCATGAAGCCTATTGACTATTA  482

Query  516  CACAGAGACTAAGATCTTACAGGAGAGGGCAGTTCTGGGCGCCAACGATCCTGAGAAGAATTTCTTAACCACAG  589
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||..||||||||.|||.||||||||||.||||||.|||
Sbjct  483  CACAGAGACCAAGATCTTGCAGGAGAGAGCAGTACTGGATGCCAACGACCCTAAGAAGAATTTTTTAACCGCAG  556

Query  590  CCATCCGCCCTCATGGCATTTTCGGCCCAAGGGACCCGCAGTTGGTACCCATCCTCATCGAGGCAGCCAGGAAC  663
            ||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct  557  CCATTCGTCCTCATGGCATTTTCGGCCCAAGGGACCCCCAGTTGGTCCCAATCCTAATTGATGCAGCTAGAAAG  630

Query  664  GGCAAGATGAAGTTCGTGATTGGAAATGGGAAGAACTTGGTGGACTTCACCTTTGTGGAGAACGTGGTCCATGG  737
            |||||.|||||||||.||||||||||||||.|.|||.||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  631  GGCAAAATGAAGTTCATGATTGGAAATGGGGAAAACCTGGTGGACTTCACCTTCGTGGAGAATGTGGTTCATGG  704

Query  738  ACACATCCTGGCGGCAGAGCAGCTCTCCCGAGACTCGACACTGGGTGGGAAGGCATTTCACATCACCAATGATG  811
            |||||||.|.||.||.|||||.|||||||.|||..|..|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  705  ACACATCTTAGCCGCTGAGCACCTCTCCCAAGATGCAGCTCTAGGTGGAAAGGCATTTCACATCACCAACGATG  778

Query  812  AGCCCATCCCTTTCTGGACATTCCTGTCTCGCATCCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCCAAGTACCACATC  885
            |.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  779  AACCAATCCCTTTCTGGACGTTCCTGTCCCGCATTCTGACAGGCCTCAATTATGAGGCCCCTAAGTACCACATC  852

Query  886  CCCTACTGGGTGGCCTACTACCTGGCCCTCCTGCTATCCCTGCTGGTGATGGTGATCAGTCCTGTCATCCAGCT  959
            |||||||||.|||||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||.||||.|||.|||||||..|
Sbjct  853  CCCTACTGGATGGCCTATTACCTTGCTTTCCTGCTATCTCTACTGGTGATGGTGGTCAGCCCTCTCATCCAAAT  926

Query  960  GCAGCCCACCTTCACACCCATGCGGGTCGCACTGGCTGGCACATTCCACTACTACAGCTGCGAGAGAGCCAAAA  1033
            .|||||.|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|.||||||||
Sbjct  927  CCAGCCAACCTTTACACCAATTCGAGTGGCATTGGCTGGAACATTCCACTATTACAGTTGTGAAAAAGCCAAAA  1000

Query 1034  AGGCCATGGGCTACCAGCCACTAGTGACCATGGATGATGCTATGGAGAGGACCGTGCAGAGCTTTCGCCACCTG  1107
            ||..|.|.||.||||.||||||.||.|||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.||.|.|||||||
Sbjct 1001  AGCTCTTTGGGTACCGGCCACTGGTCACCATGGATGAAGCTGTGGAAAGGACTGTGCAGAGTTTCCACCACCTG  1074

Query 1108  CGGAGGGTCAAG  1119
            ||||.||.||||
Sbjct 1075  CGGAAGGACAAG  1086