Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08191
- Subject:
- XM_006510206.3
- Aligned Length:
- 1124
- Identities:
- 831
- Gaps:
- 199
Alignment
Query 1 ATGGGGGTCTGTGGGTACC-TGTTCCTGCCCTGG---AAGTGC----------CTCGTGGTCGTGTCTCTCA-- 58
.||...||| | ||.|| ||.||| |||||||.| ..||| |||
Sbjct 1 ----------ATGAAAACCAT--------CCAGGCAAAAATGCACAATTCTATCTCGTGGGC-AATCT-TCACG 54
Query 59 -GGCTG------CTGTTCCTTGTACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTAT 125
||||| ||||.|||..| ||| |||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 55 GGGCTGGCGGCTCTGTGCCTCTT--CCA-AGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTAT 125
Query 126 GGACAACGTGACGGTCCGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGG 199
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 126 GGACAACGTGACGGTCAGGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGG 199
Query 200 CCTGGCTAAACCGCAGCACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTG 273
||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 200 CCTGGCTAAACCGCAGTACCATCCTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTG 273
Query 274 AGCAACACCCAAACGCAGTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTC 347
||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 274 AGTAACACCCAGACCCAGTACAGCATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTC 347
Query 348 GGTGCAGACAGACAACCACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA 421
|||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 348 GGTACAGACAGACAACCACCCTAAGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGA 421
Query 422 TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCT 495
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 422 TTTCTTCAGATATCTCCATTAATGAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCT 495
Query 496 ACGGTTACTTGGAGACACATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGG 569
||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||
Sbjct 496 ACAGTAACCTGGAGACATATTTCTCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGG 569
Query 570 CATCACCCGGGAGCAGTCAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAG 643
||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 570 CATCACTCGGGAACAGTCAGGCGAGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAG 643
Query 644 TAAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGG 717
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 644 TGAAGGTCACCGTGAACTATCCACCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGG 717
Query 718 ACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGA 791
||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 718 ACTCTGCAGTGTGAAGCTTCCGCAGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGA 791
Query 792 AGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATG 865
|||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 792 AGGAAAGAAGGGAGTCAAAGTGGAAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATG 865
Query 866 ACTATGGGAACTACACTTGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG----- 934
||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 866 ACTATGGGAACTACACATGTGTGGCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGAACTA 939
Query 935 -GTGAGACT--GTGCTC--------------------------------------------------------- 948
.||||.|| ..||||
Sbjct 940 AATGAGCCTACAAGCTCAACTTTGTTGCAAGAAGTGAAAACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTCCCGGTGC 1013
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1014 TGTCAGTGAGGTCAACAATGGGACATCAAGGAGGGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCCCTCTTCTGGTCTTACACC 1087
Query 949 -------------- 948
Sbjct 1088 TGCTCCTCAAATTT 1101