Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08191
Subject:
XM_017017860.2
Aligned Length:
1155
Identities:
821
Gaps:
330

Alignment

Query    1  ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACCCACAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCCGGCAGG  148
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------ATGGACAACGTGACGGTCCGGCAGG  25

Query  149  GGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGCACCATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  GGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGCACCATC  99

Query  223  CTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCCAAACGCAGTACAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  CTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCCAAACGCAGTACAG  173

Query  297  CATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACAGACAACCACCCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  CATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACAGACAACCACCCAA  247

Query  371  AGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCCATTAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  AGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCCATTAAT  321

Query  445  GAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTTGGAGACACATCTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  GAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTTGGAGACACATCTC  395

Query  519  TCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGGGAGCAGTCAGGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  396  TCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGGG  469

Query  593  ACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCACCGTGAACTATCCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  ACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCACCGTGAACTATCCA  543

Query  667  CCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  CCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGTGTGAAGCCTCAGC  617

Query  741  AGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  AGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAAGGGGTGAAAGTGG  691

Query  815  AAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACTTGCGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  AAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACTTGCGTG  765

Query  889  GCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTG------GTGAGACT--GTGCTC------  948
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      .||||.||  |.||||      
Sbjct  766  GCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGAACTAAATGAGCCTACGAGCTCAACTTT  839

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct  840  GTTGCAAGAAGTGAAAACTACAGCCCTGACCCCTTGGAAAGGTTTGTATATTTTTCAGACAGCTGCTGCCTTGG  913

Query  949  --------------------------------------------------------------------------  948
                                                                                      
Sbjct  914  TGGGTGTGGGGTATGTAAAACTCTTCACCTTCCTCCCAGATGCCTTCTTTCCTGAGCTAACTCCAGGAAGCAGC  987

Query  949  ---------------------------------------------  948
                                                         
Sbjct  988  GCAGAGGGAACCCTCCCCCAACCTTCAACCATCTCCGTGTCAATT  1032