Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08191
- Subject:
- XM_017313306.1
- Aligned Length:
- 1040
- Identities:
- 786
- Gaps:
- 172
Alignment
Query 1 ATGGGGGTCTGTGGGTACCTGTTCCTGCCCTGGAAGTGCCTCGTGGTCGTGTCTCTCAGGCTGCTGTTCCTTGT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACCCA------CAGGAGTGCCCGTGCGCAGCGGAGATGCCACCTTCCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCC 142
| ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ----ATGAAATCAGGAGTGCCGGTGCGTAGCGGAGATGCCACCTTTCCCAAAGCTATGGACAACGTGACGGTCA 70
Query 143 GGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACTATTGACAACCGGGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGC 216
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 71 GGCAGGGGGAGAGCGCCACCCTCAGGTGCACAATTGACAACCGAGTCACCCGGGTGGCCTGGCTAAACCGCAGT 144
Query 217 ACCATCCTCTATGCTGGGAATGACAAGTGGTGCCTGGATCCTCGCGTGGTCCTTCTGAGCAACACCCAAACGCA 290
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||
Sbjct 145 ACCATCCTCTATGCTGGAAATGACAAGTGGTGCCTAGATCCTCGTGTGGTCCTCCTGAGTAACACCCAGACCCA 218
Query 291 GTACAGCATCGAGATCCAGAACGTGGATGTGTATGACGAGGGCCCTTACACCTGCTCGGTGCAGACAGACAACC 364
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 219 GTACAGCATTGAGATCCAGAATGTGGATGTGTACGATGAGGGCCCTTATACCTGCTCGGTACAGACAGACAACC 292
Query 365 ACCCAAAGACCTCTAGGGTCCACCTCATTGTGCAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCC 438
||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 ACCCTAAGACCTCCAGGGTCCACCTCATTGTACAAGTATCTCCCAAAATTGTAGAGATTTCTTCAGATATCTCC 366
Query 439 ATTAATGAAGGGAACAATATTAGCCTCACCTGCATAGCAACTGGTAGACCAGAGCCTACGGTTACTTGGAGACA 512
|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 367 ATTAATGAAGGGAACAACATCAGCCTCACTTGCATAGCCACAGGTAGACCGGAGCCTACAGTAACCTGGAGACA 440
Query 513 CATCTCTCCCAAAGCGGTTGGCTTTGTGAGTGAAGACGAATACTTGGAAATTCAGGGCATCACCCGGGAGCAGT 586
.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||.||||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 441 TATTTCTCCCAAGGCCGTTGGCTTTGTGAGTGAGGATGAGTACCTGGAGATCCAGGGCATCACTCGGGAACAGT 514
Query 587 CAGGGGACTACGAGTGCAGTGCCTCCAATGACGTGGCCGCGCCCGTGGTACGGAGAGTAAAGGTCACCGTGAAC 660
||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 515 CAGGCGAGTACGAGTGCAGCGCCTCCAACGACGTGGCGGCACCAGTGGTACGAAGAGTGAAGGTCACCGTGAAC 588
Query 661 TATCCACCATACATTTCAGAAGCCAAGGGTACAGGTGTCCCCGTGGGACAAAAGGGGACACTGCAGTGTGAAGC 734
||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 589 TATCCACCATACATCTCAGAAGCTAAGGGCACAGGTGTCCCCGTGGGGCAGAAGGGGACTCTGCAGTGTGAAGC 662
Query 735 CTCAGCAGTCCCCTCAGCAGAATTCCAGTGGTACAAGGATGACAAAAGACTGATTGAAGGAAAGAAAGGGGTGA 808
.||.||||||||.|||||||||||.||.||||.|||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|
Sbjct 663 TTCCGCAGTCCCTTCAGCAGAATTTCAATGGTTCAAGGATGACAAAAGACTGGTCGAAGGAAAGAAGGGAGTCA 736
Query 809 AAGTGGAAAACAGACCTTTCCTCTCAAAACTCATCTTCTTCAATGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACT 882
||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 737 AAGTGGAAAACAGACCTTTCCTTTCAAAACTCACCTTTTTCAACGTCTCTGAACATGACTATGGGAACTACACA 810
Query 883 TGCGTGGCCTCCAACAAGCTGGGCCACACCAATGCCAGCATCATGCTATTTGGTGAGACTGTGCTC-------- 948
||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||| ..|.|||||.
Sbjct 811 TGTGTGGCCTCCAACAAGCTGGGTCACACCAACGCCAGCATCATGCTATTTGGT--CCCGGTGCTGTCAGTGAG 882
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 883 GTCAACAATGGGACATCAAGGAGGGCAGGCTGCATTTGGCTCCTCCCTCTTCTGGTCTTACACCTGCTCCTCAA 956
Query 949 ---- 948
Sbjct 957 ATTT 960