Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08215
Subject:
NM_001112808.2
Aligned Length:
960
Identities:
812
Gaps:
128

Alignment

Query   1  -------------MAAARDPPEVSLREATQRKLRRFSELRGKLVARGEFWDIVAITAADEKQELAYNQQLSEKL  61
                        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MRAVRRGLREGGAMAAARDPPEVSLREATQRKLRRFSELRGKLVARGEFWDIVAITAADEKQELAYNQQLSEKL  74

Query  62  KRKELPLGVQYHVFVDPAGAKIGNGGSTLCALQCLEKLYGDKWNSFTILLIHSDEWKKKVSESYVITIERLEDD  135
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  KRKELPLGVQYHVFVDPAGAKIGNGGSTLCALQCLEKLYGDKWNSFTILLIHSDEWKKKVSESYVITIERLEDD  148

Query 136  LQIKEKELTELRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTALHLA  209
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  LQIKEKELTELRNIFGSDEAFSKVNLNYRTENGLSLLHLCCICGGKKSHIRTLMLKGLRPSRLTRNGFTALHLA  222

Query 210  VYKDNAELITSLLHSGADVQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGHEQV  283
           ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  VYKDNAELITSLLHSGADIQQVGYGGLTALHIATIAGHLEAADVLLQHGANVNIQDAVFFTPLHIAAYYGHEQV  296

Query 284  TRLLLKFGADVNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKYLLQ  357
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  TRLLLKFGADVNVSGEVGDRPLHLASAKGFLNIAKLLMEEGSKADVNAQDNEDHVPLHFCSRFGHHDIVKYLLQ  370

Query 358  SDLEVQPHVVNIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLDQNV  431
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  SDLEVQPHVVNIYGDTPLHLACYNGKFEVAKEIIQISGTESLTKENIFSETAFHSACTYGKSIDLVKFLLDQNV  444

Query 432  ININHQGRDGHTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLLKHY  505
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  ININHQGRDGHTGLHSACYHGHIRLVQFLLDNGADMNLVACDPSRSSGEKDEQTCLMWAYEKGHDAIVTLLKHY  518

Query 506  KRPQGELPCNEYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFGKVY  579
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  KRPQDELPCNEYSQPGGDGSYVSVPSPLGKIKSMTKEKADILLLRAGLPSHFHLQLSEIEFHEIIGSGSFGKVY  592

Query 580  KGRCRNKIVAIKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFSLLH  653
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  KGRCRNKIVAIKRYRANTYCSKSDVDMFCREVSILCQLNHPCVIQFVGACLNDPSQFAIVTQYISGGSLFSLLH  666

Query 654  EQKRILDLQSKLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTKQPG  727
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  EQKRILDLQSKLIIAVDVAKGMEYLHNLTQPIIHRDLNSHNILLYEDGHAVVADFGESRFLQSLDEDNMTKQPG  740

Query 728  NLLWMAPEVFTQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSLLIR  801
           ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  NLRWMAPEVFTQCTRYTIKADVFSYALCLWEILTGEIPFAHLKPAAAAADMAYHHIRPPIGYSIPKPISSLLIR  814

Query 802  GWNACPEAKSRPSHYPVSSVYTETLKKKNEDRFGMWIEYLRR--------------------------------  843
           |||||||  .||.       ..|...|..|....  ||....                                
Sbjct 815  GWNACPE--GRPE-------FSEVVMKLEECLCN--IELMSPASSNSSGSLSPSSSSDCLVNRGGPGRSHVAAL  877

Query 844  ------------------------------------------------------------------------  843
                                                                                   
Sbjct 878  RSRFELEYALNARSYAALSQSAGQYSSQGLSLEEMKRSLQYTPIDKYGYVSDPMSSMHFHSCRNSSSFEDSS  949