Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08306
• Subject: NM_001205067.1
• Aligned Length: 933
• Identities: 802
• Gaps: 18

Alignment

Query   1  ATGGGTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74
           |||                  ||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   1  ATG------------------GCATGCCTTGGACTCTACTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAG  56

Query  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  57  TGAAATCTATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGGACCAATGCACAGAAGTACTGTCAGCCTTGCA  130

Query 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222
           ||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||
Sbjct 131  CAGAGTCCCCAGAACTTTACGACTGGCTCTATCTGGGCTTTATGGCTATGCTTCCTCTTGTTCTGCATTGGTTC  204

Query 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||||.
Sbjct 205  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGCTCCAGTGCTCTTTTCCAGCACATCACCGCGCTCTTTGAATGCAC  278

Query 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370
           ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.||..|||
Sbjct 279  CATGGCAGCTATCATCACCTTACTCGTGAGTGATCCCGTGGGCGTCCTTTACATCCGTTCCTGCCGCGTTCTGA  352

Query 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444
           ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 353  TGCTTTCTGATTGGTACACGATGCTCTACAACCCAAGTCCAGATTACGTCACCACGGTGCACTGCACTCACGAA  426

Query 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518
           ||||||||||||||.||.|||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 427  GCCGTCTACCCACTGTACACCATCGTGTTCGTTTATTACGCGTTCTGCTTGGTGTTAATGATGCTTCTGCGGCC  500

Query 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592
           |||.||||||||||||||.|||||.||..|.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 501  TCTCCTGGTGAAGAAGATCGCATGCGGACTCGGCAAGTCTGACCGCTTCAAAAGTATTTACGCAGCTCTTTACT  574

Query 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  666
           |||||||.||..|.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 575  TCTTCCCCATCCTGACCGTGCTGCAGGCGGTCGGTGGGGGCCTCTTATATTACGCCTTCCCGTACATTATATTA  648

Query 667  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  740
           |||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 649  GTGTTATCTCTGGTTACCCTGGCTGTATACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTCCTGGTCAG  722

Query 741  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  814
           .||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 723  GAAGAAAAGACTTATCGTTCTCTTCAGCCACTGGCTACTGCACGCCTATGGCATAGTCTCCATCTCCAGAGTGG  796

Query 815  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  888
           |.|..||.||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 797  ACAGGCTGGAACACGACCTACCGCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCTCTGTTTTACTTGTTTACTGCAAAA  870

Query 889  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  933
           |||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 871  TTTACCGAACCATCACGGATACTCTCAGAAGGGGCCAATGGACAT  915