Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08306
• Subject: NM_001284203.1
• Aligned Length: 933
• Identities: 744
• Gaps: 189

Alignment

Query   1  ATGGGTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222
                                                    |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -----------------------------------------ATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  33

Query 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  34  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  107

Query 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 108  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  181

Query 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 182  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  255

Query 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 256  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  329

Query 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 330  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  403

Query 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 404  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  477

Query 667  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 478  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  551

Query 741  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 552  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  625

Query 815  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 626  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  699

Query 889  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  933
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 700  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  744