Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08306
• Subject: NM_001284204.1
• Aligned Length: 933
• Identities: 638
• Gaps: 294

Alignment

Query   1  ATGGGTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74
           ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74

Query  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148

Query 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222

Query 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296

Query 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370

Query 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444

Query 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518

Query 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592

Query 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  666
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTA---------------------------  639

Query 667  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  740
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 741  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  814
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 815  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  888
                                                                                     
Sbjct 640  --------------------------------------------------------------------------  639

Query 889  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  933
                                                        
Sbjct 640  ---------------------------------------------  639