Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroadEn_08306
Subject:
NM_024205.2
Aligned Length:
933
Identities:
819
Gaps:
0

Alignment

Query   1  ATGGGTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTTTATTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAC  74
           ||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct   1  ATGGCTGTCGATATTCAACCAGCATGCCTTGGACTCTACTGTGGGAAGACCCTATTATTTAAAAATGGCTCAAG  74

Query  75  TGAAATATATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGAACGAATGCACAGAAATATTGTCAGCCTTGCA  148
           ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  75  TGAAATCTATGGAGAATGTGGGGTATGCCCAAGAGGACAGAGGACCAATGCACAGAAGTACTGTCAGCCTTGCA  148

Query 149  CAGAATCTCCTGAACTTTATGATTGGCTCTATCTTGGATTTATGGCAATGCTTCCTCTGGTTTTACATTGGTTC  222
           ||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||
Sbjct 149  CAGAGTCCCCAGAACTTTACGACTGGCTCTATCTGGGCTTTATGGCTATGCTTCCTCTTGTTCTGCATTGGTTC  222

Query 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGTTCCAGCGCACTTTTCCAACACATCACTGCATTATTTGAATGCAG  296
           |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||..|.||||||||||.
Sbjct 223  TTCATTGAATGGTACTCGGGGAAAAAGAGCTCCAGTGCTCTTTTCCAGCACATCACCGCGCTCTTTGAATGCAC  296

Query 297  CATGGCAGCTATTATCACCTTACTTGTGAGTGATCCAGTTGGTGTTCTTTATATTCGTTCATGTCGAGTATTGA  370
           ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||.||..|||
Sbjct 297  CATGGCAGCTATCATCACCTTACTCGTGAGTGATCCCGTGGGCGTCCTTTACATCCGTTCCTGCCGCGTTCTGA  370

Query 371  TGCTTTCTGACTGGTACACGATGCTTTACAACCCAAGTCCAGATTACGTTACCACAGTACACTGTACTCATGAA  444
           ||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||
Sbjct 371  TGCTTTCTGATTGGTACACGATGCTCTACAACCCAAGTCCAGATTACGTCACCACGGTGCACTGCACTCACGAA  444

Query 445  GCCGTCTACCCACTATATACCATTGTATTTATCTATTACGCATTCTGCTTGGTATTAATGATGCTGCTCCGACC  518
           ||||||||||||||.||.|||||.||.||..|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||
Sbjct 445  GCCGTCTACCCACTGTACACCATCGTGTTCGTTTATTACGCGTTCTGCTTGGTGTTAATGATGCTTCTGCGGCC  518

Query 519  TCTTCTGGTGAAGAAGATTGCATGTGGGTTAGGGAAATCTGATCGATTTAAAAGTATTTATGCTGCACTTTACT  592
           |||.||||||||||||||.|||||.||..|.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 519  TCTCCTGGTGAAGAAGATCGCATGCGGACTCGGCAAGTCTGACCGCTTCAAAAGTATTTACGCAGCTCTTTACT  592

Query 593  TCTTCCCAATTTTAACCGTGCTTCAGGCAGTTGGTGGAGGCCTTTTATATTACGCCTTCCCATACATTATATTA  666
           |||||||.||..|.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 593  TCTTCCCCATCCTGACCGTGCTGCAGGCGGTCGGTGGGGGCCTCTTATATTACGCCTTCCCGTACATTATATTA  666

Query 667  GTGTTATCTTTGGTTACTCTGGCTGTGTACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTTCTGGTCAG  740
           |||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667  GTGTTATCTCTGGTTACCCTGGCTGTATACATGTCTGCTTCTGAAATAGAGAACTGCTATGATCTCCTGGTCAG  740

Query 741  AAAGAAAAGACTTATTGTTCTCTTCAGCCACTGGTTACTTCATGCCTATGGAATAATCTCCATTTCCAGAGTGG  814
           .||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct 741  GAAGAAAAGACTTATCGTTCTCTTCAGCCACTGGCTACTGCACGCCTATGGCATAGTCTCCATCTCCAGAGTGG  814

Query 815  ATAAACTTGAGCAAGATTTGCCCCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCCCTTTTTTACTTGTTCACTGCAAAA  888
           |.|..||.||.||.||..|.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 815  ACAGGCTGGAACACGACCTACCGCTTTTGGCTTTGGTACCTACACCAGCTCTGTTTTACTTGTTTACTGCAAAA  888

Query 889  TTTACCGAACCTTCAAGGATACTCTCAGAAGGAGCCAATGGACAC  933
           |||||||||||.|||.||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 889  TTTACCGAACCATCACGGATACTCTCAGAAGGGGCCAATGGACAT  933