Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08341
• Subject: XM_011530225.2
• Aligned Length: 1152
• Identities: 785
• Gaps: 366

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGCTGAGTGGAAGTCGCTGGAGGAATGCTTGGAGAAGCACCTGCCGCTCCCCGACTTGCAGGAAGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGCGCGTTCTCTATGGCAAGGAACTCAGGAAGCTTGATCTGCCCAGGGAAGCTTTCGAAGCTGCCTCCAGAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AAGACTTTGAACTGCAGGGATATGCCTTTGAAGCAGCGGAGGAGCAGCTGAGACGACCCCGCATTGTGCACGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGGCTGGTTCAGAACAGAATCCCCCTCCCCGCAAATGCCCCTGTGGCAGAACAGGTCTCTGCCCTTCATAGACG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CATAAAGGCTATCGTAGAGGTGGCTGCAATGTGTGGAGTCAACATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGGACTATGC  370
                                                                                  ||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------------------ATGC  4

Query  371  CCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCCCACCACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    5  CCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCCCACCACC  78

Query  445  AGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACAGCGAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   79  AGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACAGCGAGCA  152

Query  519  TGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGCAGTCCTGGGAAAGACCAGGAAAAACC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  153  TGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGCAGTCCTGGGAAAGACCAGGAAAAACC  226

Query  593  ACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACGAGTCAACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCGTGTTCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  ACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACGAGTCAACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCGTGTTCCAG  300

Query  667  ACGCAGTTCGGAAGGATCGCGGTGAACATTTGCTACGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTTATGTACAGCAT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  ACGCAGTTCGGAAGGATCGCGGTGAACATTTGCTACGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTTATGTACAGCAT  374

Query  741  CAACGGGGCTGAGATCATCTTCAACCCCTCGGCCACGATAGGAGCACTCAGCGAGTCCCTGTGGCCCATCGAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  CAACGGGGCTGAGATCATCTTCAACCCCTCGGCCACGATAGGAGCACTCAGCGAGTCCCTGTGGCCCATCGAGG  448

Query  815  CCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGGCACCGAGCACTTCCCGAAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  CCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGGCACCGAGCACTTCCCGAAC  522

Query  889  GAGTTTACCTCGGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTATGTGGCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  GAGTTTACCTCGGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTATGTGGCAGC  596

Query  963  CCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCGACCTAAACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCGACCTAAACC  670

Query 1037  TCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGGGAGCTCGCC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  TCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGGGAGCTCGCC  744

Query 1111  GAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCTCACCATCGTGAAAGAG  1152
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  745  GAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCCCACCATCGTGAAAGAG  786