Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08341
• Subject: XM_017028825.1
• Aligned Length: 1233
• Identities: 938
• Gaps: 294

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGCTGAGTGGAAGTCGCTGGAGGAATGCTTGGAGAAGCACCTGCCGCTCCCCGACTTGCAGGAAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGCGCTGAGTGGAAGTCGCTGGAGGAATGCTTGGAGAAGCACCTGCCGCTCCCCGACTTGCAGGAAGT  74

Query   75  GAAGCGCGTTCTCTATGGCAAGGAACTCAGGAAGCTTGATCTGCCCAGGGAAGCTTTCGAAGCTGCCTCCAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCGCGTTCTCTATGGCAAGGAACTCAGGAAGCTTGATCTGCCCAGGGAAGCTTTCGAAGCTGCCTCCAGAG  148

Query  149  AAGACTTTGAACTGCAGGGATATGCCTTTGAAGCAGCGGAGGAGCAGCTGAGACGACCCCGCATTGTGCACGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGACTTTGAACTGCAGGGATATGCCTTTGAAGCAGCGGAGGAGCAGCTGAGACGACCCCGCATTGTGCACGTG  222

Query  223  GGGCTGGTTCAGAACAGAATCCCCCTCCCCGCAAATGCCCCTGTGGCAGAACAGGTCTCTGCCCTTCATAGACG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCTGGTTCAGAACAGAATCCCCCTCCCCGCAAATGCCCCTGTGGCAGAACAGGTCTCTGCCCTTCATAGACG  296

Query  297  CATAAAGGCTATCGTAGAGGTGGCTGCAATGTGTGGAGTCAACATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGGA------  364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  297  CATAAAGGCTATCGTAGAGGTGGCTGCAATGTGTGGAGTCAACATCATCTGTTTCCAGGAAGCATGGACGGCAG  370

Query  365  --------------------------------------------------------------------------  364
                                                                                      
Sbjct  371  GGCTCGGTCACGCTGGACACAGTTTCCAGATCTACACCACACCGAGATGGCTCAAGCCAAGTGGCCAGAGGATC  444

Query  365  -CTATGCCCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCC  437
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TCTATGCCCTTTGCCTTCTGTACGAGAGAGAAGCTTCCTTGGACAGAATTTGCTGAGTCAGCAGAGGATGGGCC  518

Query  438  CACCACCAGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACCACCAGATTCTGTCAGAAGCTGGCGAAGAACCATGACATGGTGGTGGTGTCTCCCATCCTGGAACGAGACA  592

Query  512  GCGAGCATGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGCAGTCCTGGGAAAGACCAGG  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGAGCATGGGGATGTTTTGTGGAATACAGCCGTGGTGATCTCCAATTCCGGAGCAGTCCTGGGAAAGACCAGG  666

Query  586  AAAAACCACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACGAGTCAACTTACTACATGGAGGGAAACCTGGGCCACCCCGT  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  667  AAAAACCACATCCCCAGAGTGGGTGATTTCAACG----------------------------------------  700

Query  660  GTTCCAGACGCAGTTCGGAAGGATCGCGGTGAACATTTGCTACGGGCGGCACCACCCCCTCAACTGGCTTATGT  733
                                                                                      
Sbjct  701  --------------------------------------------------------------------------  700

Query  734  ACAGCATCAACGGGGCTGAGATCATCTTCAACCCCTCGGCCACGATAGGAGCACTCAGCGAGTCCCTGTGGCCC  807
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  701  --------------------------------------------------------AGCGAGTCCCTGTGGCCC  718

Query  808  ATCGAGGCCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGGCACCGAGCACTT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  719  ATCGAGGCCAGAAACGCAGCCATTGCCAATCACTGCTTCACCTGCGCCATCAATCGAGTGGGCACC--------  784

Query  882  CCCGAACGAGTTTACCTCGGGAGATGGAAAGAAAGCTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTATG  955
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  -----------------------------------CTCACCAGGACTTTGGCTACTTTTATGGCTCGAGCTATG  823

Query  956  TGGCAGCCCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCGAC  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  824  TGGCAGCCCCTGACAGCAGCCGGACTCCTGGGCTGTCCCGTAGCCGGGATGGACTGCTAGTTGCTAAGCTCGAC  897

Query 1030  CTAAACCTCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGGGA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  898  CTAAACCTCTGCCAGCAGGTGAATGATGTCTGGAACTTCAAGATGACGGGCAGGTATGAGATGTACGCACGGGA  971

Query 1104  GCTCGCCGAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCTCACCATCGTGAAAGAG  1152
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  972  GCTCGCCGAAGCTGTCAAGTCCAACTACAGCCCCACCATCGTGAAAGAG  1020