Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08364
• Subject: NM_053179.3
• Aligned Length: 1077
• Identities: 954
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCCGCTGGAGCTGGAGCTGTGTCCCGGGCGCTGGGTGGGCGGGCAACACCCGTGCTTCATCATTGCCGAGAT  74
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||..|.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct    1  ATGCCGCTGGAACTGGAGCTGTGTCCCGGGCGCTGGGTGGGTGGAAAGCACCCGTGCTTCATCATCGCGGAGAT  74

Query   75  CGGCCAGAACCACCAGGGCGACCTGGACGTAGCCAAGCGCATGATCCGCATGGCCAAGGAGTGTGGGGCTGATT  148
            |||||||||||||||.||.|||.|.||.||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.||.|
Sbjct   75  CGGCCAGAACCACCAAGGAGACATAGATGTGGCCAAGCGCATGATCCGCACTGCCAAGGAGTGTGGGGCCGACT  148

Query  149  GTGCCAAGTTCCAGAAGAGTGAGCTAGAATTCAAGTTTAATCGGAAAGCCTTGGACAGGCCATACACCTCGAAG  222
            |.||.|||||.||||||||.|||.|.||.|||||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct  149  GCGCTAAGTTTCAGAAGAGCGAGTTGGAGTTCAAGTTTAACCGGAAGGCCCTGGAGAGACCATATACTTCGAAG  222

Query  223  CATTCCTGGGGGAAGACGTACGGGGAGCACAAACGACATCTGGAGTTCAGCCATGACCAGTACAGGGAGCTGCA  296
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||.|||||||||
Sbjct  223  CATTCATGGGGGAAGACGTATGGGGAGCACAAGCGGCATCTGGAATTCAGCCACGACCAGTACAAGGAGCTGCA  296

Query  297  GAGGTACGCCGAGGAGGTTGGGATCTTCTTCACTGCCTCTGGCATGGATGAGATGGCAGTTGAATTCCTGCATG  370
            |||.||.||..|||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct  297  GAGCTATGCGCAGGAGATCGGCATCTTCTTCACTGCCTCTGGCATGGACGAGATGGCAGTTGAGTTTCTGCACG  370

Query  371  AACTGAATGTTCCATTTTTCAAAGTTGGATCTGGAGACACTAATAATTTTCCTTATCTGGAAAAGACAGCCAAA  444
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  371  AACTGAATGTTCCCTTTTTCAAAGTTGGATCTGGGGACACTAACAATTTTCCCTACCTGGAAAAGACAGCCAAG  444

Query  445  AAAGGTCGCCCAATGGTGATCTCCAGTGGGATGCAGTCAATGGACACCATGAAGCAAGTTTATCAGATCGTGAA  518
            ||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  445  AAAGGTCGTCCTATGGTGATCTCCAGCGGGATGCAGTCAATGGACACCATGAAGCAAGTCTATCAGATCGTGAA  518

Query  519  GCCCCTCAACCCCAACTTCTGCTTCTTGCAGTGTACCAGCGCATACCCGCTCCAGCCTGAGGACGTCAACCTGC  592
            |||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|.||||||||
Sbjct  519  GCCGCTGAATCCCAACTTCTGCTTCCTCCAATGCACCAGCGCGTACCCACTACAGCCCGAGGATGCCAACCTGC  592

Query  593  GGGTCATCTCGGAATATCAGAAGCTCTTTCCTGACATTCCCATAGGGTATTCTGGGCATGAAACAGGCATAGCG  666
            |.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.
Sbjct  593  GCGTCATCTCGGAATACCAGAAGCTCTTTCCCGACATTCCCATCGGGTATTCCGGGCACGAGACGGGCATCGCC  666

Query  667  ATATCTGTGGCCGCAGTGGCTCTGGGGGCCAAGGTGTTGGAACGTCACATAACTTTGGACAAGACCTGGAAGGG  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATATCTGTGGCCGCCGTGGCTCTGGGGGCCAAGGTGTTGGAACGTCACATAACGTTGGACAAGACCTGGAAGGG  740

Query  741  GAGTGACCACTCGGCCTCGCTGGAGCCTGGAGAACTGGCCGAGCTGGTGCGGTCAGTGCGTCTTGTGGAGCGTG  814
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  741  GAGTGACCACTCAGCCTCGCTGGAGCCTGGGGAGCTGGCAGAGCTGGTGCGGTCTGTGCGCCTGGTGGAGCGGG  814

Query  815  CCCTGGGCTCCCCAACCAAGCAGCTGCTGCCCTGTGAGATGGCCTGCAATGAGAAGCTGGGCAAGTCTGTGGTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  815  CCCTGGGCTCCCCAACCAAGCAGCTGCTGCCCTGTGAGATGGCCTGCAATGAGAAGCTCGGCAAGTCTGTGGTA  888

Query  889  GCCAAAGTGAAAATTCCGGAAGGCACCATTCTAACAATGGACATGCTCACCGTGAAGGTGGGTGAGCCCAAAGG  962
            ||||||||||||||.||.|.||||||||..||.||..|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GCCAAAGTGAAAATCCCAGCAGGCACCACCCTGACCCTGGACATGCTCACTGTGAAGGTGGGGGAGCCCAAAGG  962

Query  963  CTATCCTCCTGAAGACATCTTTAATCTAGTGGGCAAGAAGGTCCTGGTCACTGTTGAAGAGGATGACACCATCA  1036
            |||||||||||||||||||||.||.||||.||||||.|||||.|||||||||.|.|||||.||||||||..|||
Sbjct  963  CTATCCTCCTGAAGACATCTTCAACCTAGCGGGCAAAAAGGTGCTGGTCACTATCGAAGAAGATGACACGGTCA  1036

Query 1037  TGGAAGAATTGGTAGATAATCATGGCAAAAAAATCAAGTCT  1077
            |||||||||..||.||.|.|||..||||.|||||||||.||
Sbjct 1037  TGGAAGAATCCGTGGAAAGTCACAGCAAGAAAATCAAGGCT  1077