Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08386
- Subject:
- XM_006499291.1
- Aligned Length:
- 1596
- Identities:
- 1140
- Gaps:
- 339
Alignment
Query 1 ATGCAAAGTTGTGAATCCAGTGGTGACAGTGCGGATGACCCTCTCAGTCGCGGCCTACGGAGAAGGGGACAGCC 74
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCAAAGTTGTGAATCCAGTGGCGACAGTGCGGATGACCCTCTCAGTCGTGGCCTACGGAGAAGGGGACAGCC 74
Query 75 TCGTGTGGTGGTGATCGGCGCCGGCTTGGCTGGCCTGGCTGCAGCCAAAGCACTTCTTGAGCAGGGTTTCACGG 148
||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 75 TCGTGTGGTGGTGATCGGTGCTGGCTTGGCTGGCCTGGCTGCAGCTAGAGCCCTTCTGGAGCAGGGCTTCACGG 148
Query 149 ATGTCACTGTGCTTGAGGCTTCCAGCCACATCGGAGGCCGTGTGCAGAGTGTGAAACTTGGACACGCCACCTTT 222
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||..||||||.||.||||||||
Sbjct 149 ATGTCACTGTGCTTGAGGCTTCCAGCCACATTGGGGGCCGTGTGCAGAGTGTGAGGCTTGGAGACACCACCTTT 222
Query 223 GAGCTGGGAGCCACCTGGATCCATGGCTCCCATGGGAACCCTATCTATCATCTAGCAGAAGCCAACGGCCTCCT 296
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||..|
Sbjct 223 GAGCTGGGAGCCACCTGGATCCATGGATCCCACGGGAATCCTATCTATCAACTAGCAGAAGCCAATGGCCTTTT 296
Query 297 GGAAGAGACAACCGATGGGGAACGCAGCGTGGGCCGCATCAGCCTCTATTCCAAGAATGGCGTGGCCTGCTACC 370
||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAAGAGACAACAGATGGGGAGCGCAGTGTGGGCCGCATCAGCCTTTACTCCAAGAATGGCGTGGCCTGCTACC 370
Query 371 TTACCAACCACGGCCGCAGGATCCCCAAGGACGTGGTTGAGGAATTCAGCGATTTATACAACGAGGTCTATAAC 444
|||||||||..|||.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTACCAACCGTGGCTGCCGCATCCCCAAGGACGTGGTTGAGGAATTCAGCGATTTATACAACGAGGTCTATAAC 444
Query 445 TTGACCCAGGAGTTCTTCCGGCACGATAAACCAGTCAATGCTGAAAGTCAAAATAGCGTGGGGGTGTTCACCCG 518
.||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 ATGACCCAGGAGTTCTTCCGGCATGGTAAACCAGTCAATGCCGAGAGTCAGAACAGCGTCGGGGTGTTCACCCG 518
Query 519 AGAGGAGGTGCGTAACCGCATCAGGAATGACCCTGACGACCCAGAGGCTACCAAGCGCCTGAAGCTCGCCATGA 592
.|||.|||||||.||.|||||||||.||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAGAAGGTGCGGAATCGCATCAGGGATGACCCTGACGACACAGAGGCCACCAAGCGCCTGAAGCTCGCCATGA 592
Query 593 TCCAGCAGTACCTGAAGGTGGAGAGCTGTGAGAGCAGCTCACACAGCATGGACGAGGTGTCCCTGAGCGCCTTC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 593 TCCAGCAGTACCTGAAGGTGGAGAGCTGTGAGAGCAGCTCCCACAGCATAGATGAGGTGTCCCTGAGCGCCTTT 666
Query 667 GGGGAGTGGACCGAGATCCCCGGCGCTCACCACATCATCCCCTCGGGCTTCATGCGGGTTGTGGAGCTGCTGGC 740
||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 667 GGAGAATGGACGGAGATCCCAGGCGCCCATCACATCATCCCCTCGGGCTTCATGCGAGTTGTGGAGCTGCTGGC 740
Query 741 GGAGGGCATCCCTGCCCACGTCATCCAGCTAGGGAAACCTGTCCGCTGCATTCACTGGGACCAGGCCTCAGCCC 814
.||||||||.|||.|.||.|||||||||.|.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 741 TGAGGGCATTCCTCCACATGTCATCCAGTTGGGGAAGCCGGTCCGTTGCATCCACTGGGACCAGGCCTCGGCTC 814
Query 815 GCCCCAGAGGCCCTGAGATTGAGCCCCGGGGTGTGCTAAAGAGGCAGTACACCAGTTTCTTCCGGCCAGGCCTG 888
.||||.|.||.||||||||.||||||||
Sbjct 815 ACCCCCGGGGTCCTGAGATCGAGCCCCG---------------------------------------------- 842
Query 889 CCCACAGAGAAGGTGGCTGCCATCCACCGCCTGGGCATTGGCACCACCGACAAGATCTTTCTGGAATTCGAGGA 962
Sbjct 843 -------------------------------------------------------------------------- 842
Query 963 GCCCTTCTGGGGCCCTGAGTGCAACAGCCTACAGTTTGTGTGGGAGGACGAAGCGGAGAGCCACACCCTCACCT 1036
Sbjct 843 -------------------------------------------------------------------------- 842
Query 1037 ACCCACCTGAGCTCTGGTACCGCAAGATCTGCGGCTTTGATGTCCTCTACCCGCCTGAGCGCTACGGCCATGTG 1110
|||||||||.|||||||||
Sbjct 843 -------------------------------------------------------TGAGCGCTATGGCCATGTG 861
Query 1111 CTGAGCGGCTGGATCTGCGGGGAGGAGGCCCTCGTCATGGAGAAGTGTGATGACGAGGCAGTGGCCGAGATCTG 1184
|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||.|||.|||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 862 CTGAGTGGCTGGATCTGTGGGGAGGAGGCTCTTGTCATGGAGAGGTGCGATGACGAGGCTGTAGCTGAGATCTG 935
Query 1185 CACGGAGATGCTGCGTCAGTTCACAGGGAACCCCAACATTCCAAAACCTCGGCGAATCTTGCGCTCGGCCTGGG 1258
|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 936 CACAGAGATGCTTCGACAGTTCACAGGGAACCCCAATATACCAAAACCTAGGCGAATCCTGCGCTCAGCCTGGG 1009
Query 1259 GCAGCAACCCTTACTTCCGCGGCTCCTATTCATACACGCAGGTGGGCTCCAGCGGGGCGGATGTGGAGAAGCTG 1332
||||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 1010 GCAGCAACCCATACTTCCGGGGTTCCTATTCCTACACACAGGTGGGCTCAAGTGGGGCGGATGTGGAGAAGCTA 1083
Query 1333 GCCAAGCCCCTGCCGTACACGGAGAGCTCAAAGACAGC------------------------------------ 1370
||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1084 GCCAAGCCCCTGCCCTACACAGAGAGCTCCAAGACAGCGCATAGAAGCTCCACAGAGCAGCAGCCTGGTCACCT 1157
Query 1371 ------------------------------------------------------GCCCATGCAGGTGCTGTTTT 1390
|||||||||||||||.||.|
Sbjct 1158 TTTACCATCCAAGTGCCCAGAACAATCCCTGGACCCTAGTAGGGGCTCCATAAAGCCCATGCAGGTGCTCTTCT 1231
Query 1391 CCGGTGAGGCCACCCACCGCAAGTACTATTCCACCACCCACGGTGCTCTGCTGTCCGGCCAGCGTGAGGCTGCC 1464
||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1232 CCGGGGAGGCCACACACCGCAAGTACTACTCCACCACCCACGGTGCTCTGCTCTCTGGCCAGCGCGAGGCCGCC 1305
Query 1465 CGCCTCATTGAGATGTACCGAGACCTCTTCCAGCAGGGGACC 1506
||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1306 CGGCTCATCGAGATGTACCGAGACCTCTTCCAGCAGGGGCCC 1347