Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08424
• Subject: XM_006512003.3
• Aligned Length: 2323
• Identities: 1909
• Gaps: 107

Alignment

Query    1  ATGGCAGGATTTAAGCGAGGGTATGATGGAAAGATTGCTGGGTTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74
            ||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGGGTTCAAGCGAGGATATGATGGGAAAATTGCTGGATTATATGATCTGGATAAAACCTTGGGTCGAGG  74

Query   75  CCATTTTGCCGTGGTTAAACTTGCCAGGCATGTCTTTACGGGTGAAAAGGTGGCAGTAAAAGTTATTGACAAGA  148
            .||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  TCATTTTGCAGTGGTCAAACTTGCCAGGCATGTCTTCACAGGTGAGAAGGTGGCAGTGAAAGTCATTGACAAGA  148

Query  149  CAAAACTGGACACTCTAGCTACTGGTCATCTTTTCCAGGAAGTGAGATGCATGAAACTAGTGCAGCATCCTAAC  222
            |.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct  149  CGAAGCTGGACACTCTAGCCACTGGTCATCTCTTCCAGGAAGTGAGGTGCATGAAACTAGTGCAGCACCCCAAC  222

Query  223  ATCGTCCGCCTTTATGAAGTTATTGACACCCAGACCAAACTATATCTTATTCTAGAACTTGGGGATGGAGGAGA  296
            ||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ATTGTGCGTCTCTATGAAGTCATAGACACCCAGACCAAACTTTATCTCATTCTAGAACTTGGAGATGGAGGAGA  296

Query  297  TATGTTTGATTATATAATGAAACATGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTATTTTGCTCAGATAG  370
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  TATGTTTGATTATATAATGAAGCACGAGGAGGGTCTTAATGAAGACTTGGCCAAGAAGTACTTTGCTCAGATAG  370

Query  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTTCACAGAGACTTAAAACCAGAGAATGTAGTCTTCTTT  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  371  TTCATGCTATATCTTATTGCCATAAACTCCATGTGGTCCACAGAGACTTGAAACCAGAGAATGTAGTCTTTTTT  444

Query  445  GAAAAACAAGGTCTTGTAAAGTTGACAGACTTTGGGTTCAGCAACAAATTTCAACCAGGGAAGAAGCTCACTAC  518
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||
Sbjct  445  GAAAAACAAGGTCTTGTGAAGTTGACAGACTTTGGCTTCAGCAACAAATTTCAGCCTGGAAAGAAACTCACCAC  518

Query  519  AAGCTGTGGATCTCTTGCATATTCCGCTCCAGAAATTCTGCTTGGTGATGAGTATGATGCACCTGCAGTAGATA  592
            .|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  519  GAGCTGCGGGTCTCTTGCATACTCTGCTCCAGAAATCCTGCTTGGCGATGAGTACGATGCCCCTGCAGTAGACA  592

Query  593  TTTGGAGTCTGGGAGTGATCCTTTTCATGTTGGTGTGTGGGCAGCCGCCCTTTCAAGAAGCCAATGACAGTGAA  666
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.
Sbjct  593  TATGGAGCCTGGGCGTGATCCTTTTCATGCTGGTGTGTGGGCAGCCACCCTTCCAAGAAGCCAACGACAGCGAG  666

Query  667  ACACTGACAATGATCATGGATTGCAAATATACAGTACCATCCCATGTGTCTAAAGAGTGTAAAGACCTAATCAC  740
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||..||||||..||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct  667  ACACTGACCATGATCATGGACTGCAAGTACACGGTGCCACCCCGCGTGTCTGCAGGGTGCAGGGACCTGATCAC  740

Query  741  ACGGATGCTACAGAGAGATCCCAAGAGAAGGGCTTATTTAGAAGAGATTGAAAATCATCCTTGGCTTCAGGGAG  814
            |||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|.|.|||||||||||||..||.||||||||.|||||||
Sbjct  741  ACGAATGCTACAGAGAGACCCCAAAAGGAGAGCCTCTCTGGAAGAGATTGAAAGCCACCCTTGGCTCCAGGGAG  814

Query  815  TGGACCCTTCACCAGCTACAAAGTATAACATTCCCCTTGTGTCATACAAAAATCTCTCGGAAGAGGAGCACAAC  888
            |||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||||||
Sbjct  815  TGGACCCATCACCAGCCACCAAGTATAACATTCCCCTCGTGTCCTACAAGAACCTCTCCGAGGAAGAGCACAAC  888

Query  889  AGCATCATTCAGCGCATGGTGCTTGGGGACATAGCGGATCGAGACGCCATTGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG  962
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGCATCATCCAGCGCATGGTGCTCGGGGACATCGCGGACCGAGACGCCATCGTAGAAGCCCTGGAAACCAACAG  962

Query  963  GTATAACCATATCACAGCCACATACTTCCTGCTGGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC  1036
            |||.|||||.||.||.|||||.|||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTACAACCACATTACCGCCACTTACTTTTTACTTGCTGAAAGGATCCTGAGAGAAAAGCAAGAGAAAGAAATAC  1036

Query 1037  AGACCAGATCTGCAAGCCCGAGCAATATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC  1110
            |||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCAGGTCTGCTAGCCCCAGCAACATCAAGGCCCAGTTTAGGCAGTCATGGCCAACCAAAATTGATGTACCC  1110

Query 1111  CAGGACCTTGAGGATGACCTCACGGCCACTCCTTTGTCCCACGCGACTGTCCCTCAGTCTCCTGCTCGGGCTGC  1184
            ||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.||.||.||.|||||.||||||||||||.||||||.
Sbjct 1111  CAAGACCTTGAAGATGATCTCACTGCCACCCCTCTGTCACATGCCACAGTCCCGCAGTCTCCTGCTAGGGCTGG  1184

Query 1185  TGACAGTGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACTCAGCTAAGAAAGATGACCTCCCTGAGTTGG  1258
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||.|||||.|||.|||
Sbjct 1185  TGACAATGTCCTCAATGGCCACAGGAGCAAAGGCCTGTGTGACCCAGCCAAGAAAGATGAGCTCCCGGAGCTGG  1258

Query 1259  CTGGACCAGCACTCTCTACGGTGCCACCCGCAAGCTTAAAACCCACAGCCAGTGGGCGGAAGTGTCTGTTCAGG  1332
            ||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||.|.||.|||.|||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1259  CTGGGCCGGCACTGTCCACTGTTCCACCTGCAAGCATGAAGCCCGCAGCCAGTGGGCGCAAGTGTCTCTTCAGG  1332

Query 1333  GTGGAAGAAGATGAAGAGGAAGATGAGGAGGACAAGAAACCCATGTCCCTCTCAACACAAGTGGTTTTGCGCCG  1406
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||..|||||||.||.||.||.|||||..|||||||
Sbjct 1333  GTGGAAGAAGATGAGGAGGAGGATGAGGAGGACAAGAAGCCTGTGTCCCTGTCCACGCAGGTGGTGCTGCGCCG  1406

Query 1407  GAAGCCATCTGTAACCAACCGCCTGACATCCAGGAAGAGTGCGCCCGTCGTCAACCAGATCTTTGAGGAAGGGG  1480
            |||||||||.||.|||||.||||||||.||..|.||||||||.||.||..|||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 1407  GAAGCCATCGGTCACCAATCGCCTGACGTCTCGCAAGAGTGCCCCAGTGCTCAACCAGATCTTCGAGGAGGGCG  1480

Query 1481  AATCTGACGATGAGTTTGACATGGATGAGAATCTGCCTCCCAAGTTGAGCAGGTTAAAGATGAATATAGCTTCT  1554
            |.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||||.|||||.||.|.||||||||.||.||.||.
Sbjct 1481  AGTCAGACGACGAGTTTGACATGGACGAGAACCTGCCGCCCAAGCTGAGCCGGCTGAAGATGAACATTGCCTCA  1554

Query 1555  CCAGGTACAGTTCACAAACGCTACCACCGGAGGAAAAGTCAGGGCCGGGGCTCCAGCTGCAGTAGTTCGGAGAC  1628
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 1555  CCAGGCACAGTGCACAAGCGCTACCACCGCAGGAAAAGCCAGGGCCGGGGCTCTAGCTGCAGCAGCTCTGAGAC  1628

Query 1629  CAGTGATGATGATTCTGAAAGCCGGCGGCGGCTCGATAAAGATAGCGGGTTCACCTACTCCTGGCACCGACGGG  1702
            |||.|||||.||.||.||.|||||||||.||||.||.||.||.|||||.||..|.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1629  CAGCGATGACGACTCCGAGAGCCGGCGGAGGCTGGACAAGGACAGCGGCTTTGCTTACTCGTGGCACCGGCGTG  1702

Query 1703  ATAGCAGCGAGGGGCCCCCTGGCAGTGAGGGGGATGGCGGGGGCCAGAGCAAGCCAAGCAATGCCAGTGGAGGG  1776
            |.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||   .|.||||.||.
Sbjct 1703  ACAGCAGTGAGGGGCCACCAGGCAGCGAGGGCGATGGTGGCGGCCAGAGCAAGCCTAGCA---GCGGTGGCGGT  1773

Query 1777  GTGGACAAGGCCAGCCCCAGTGAGAA---CAATGCTGGTGGGGGCAGTCCCTCCA--GCGGCTCGGGTGGCAAC  1845
            |||||||||||||||||..|||||.|   ||   |.|||||.|||||     |||  |.|||||.|||||.|.|
Sbjct 1774  GTGGACAAGGCCAGCCCGGGTGAGCAGGGCA---CGGGTGGTGGCAG-----CCAGGGAGGCTCTGGTGGGACC  1839

Query 1846  CCCACCAATACATC-GGGTACCACACGCCGCTGTGCCGGCCCAAGCAACTCCAT--------------------  1898
            ||..|...||||.| |||| ||.||.|.||||||||.|||||   ..||| |||                    
Sbjct 1840  CCGTCGGGTACAGCAGGGT-CCTCAAGGCGCTGTGCAGGCCC---TGACT-CATCCTCACCCTCCCCCGCCTCA  1908

Query 1899  GCAGCTGGCCTCTCGCA-GTGCTGGGGAGCTCGTTGAGAGCCTCAAACTCATGAGCCTCTGCCTCGGCTCCCAG  1971
            ||..|| |||.||| || |||.||..|||||.||..||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1909  GCCTCT-GCCGCTC-CACGTGGTGCAGAGCTTGTGCAGAGCCTCAAACTCGTGAGCCTGTGCCTAGGCTCACAG  1980

Query 1972  CTTCATGGGAGCACCAAGTACATTATTGATCCACAGAATGGCTTGTCATTTTCCAGTGTGAAAGTCCAAGAGAA  2045
            ||.||||   ||.|||||||||||.|.||.||.|||||.|.||||   ||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1981  CTGCATG---GCGCCAAGTACATTCTGGACCCGCAGAAGGCCTTG---TTCTCCAGCGTGAAGGTGCAGGAGAA  2048

Query 2046  ATCTACGTGGAAAATGTGCATTAGCTCCACAGGGAATGCAGGGCAGGTCCCTGCAGTGGGCGGCATAAAGTTTT  2119
            .||.||||||||.||||||||.|||.||.||||               |||  ||    ||..|          
Sbjct 2049  GTCCACGTGGAAGATGTGCATCAGCGCCCCAGG---------------CCC--CA----GCCCC----------  2091

Query 2120  TCT-CTGACCACATGGCAGATACCACCACTGAATTGGAACGGATAAGGAGCAAGAACCTAAAAAATAACGTGCT  2192
            ||| ||||||                        |.||.|.|.|.||||.||||||.||.|..||.||||.|||
Sbjct 2092  TCTGCTGACC------------------------TTGACCCGGTGAGGACCAAGAAGCTGAGGAACAACGCGCT  2141

Query 2193  GCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCTGTGAACATCCAGCGGAACCCTAAGGAGGGGCTGCTGTGCGCAT  2266
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.||..|||||.||||||||.|||||.|
Sbjct 2142  CCAGCTACCTCTGTGCGAAAAGACCATCTCCGTGAACATCCAGCGCAGCCGCAAGGAAGGGCTGCTCTGCGCCT  2215

Query 2267  CCAGCCCAGCCAGCTGTTGCCATGTCATC  2295
            |||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 2216  CCAGCCCCGCCAGCTGCTGCCATGTCATC  2244