Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08437
- Subject:
- NM_001173542.1
- Aligned Length:
- 1524
- Identities:
- 1405
- Gaps:
- 117
Alignment
Query 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT 74
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Sbjct 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT 74
Query 75 TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGACTAGAAATCAATTGCCAGG 148
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Sbjct 75 TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGACTAGAAATCAATTGCCAGG 148
Query 149 ATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGATAGCATTGAAGCCAAA 222
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Sbjct 149 ATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGATAGCATTGAAGCCAAA 222
Query 223 TTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGAACAAGCAGCACAGCCC 296
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Sbjct 223 TTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGAACAAGCAGCACAGCCC 296
Query 297 CATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATG-------- 362
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Sbjct 297 CATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATGCGTCGTCC 370
Query 363 -------------------------------------------------------------------------- 362
Sbjct 371 CCCAGACTACAGTAATACTCAACAATGATCGGCAGAACGCCATTGTAGCCAAGATGGAAGACCCCTTGAGCAAC 444
Query 363 -----------------------------------CGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAA 401
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Sbjct 445 AGGGCACCGGATTCCCTGGAAAATGTCATTAGCAACGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAA 518
Query 402 GGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCT 475
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Sbjct 519 GGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCT 592
Query 476 GTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCC 549
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Sbjct 593 GTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCC 666
Query 550 AATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCT 623
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Sbjct 667 AATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCT 740
Query 624 GCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGG 697
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Sbjct 741 GCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGG 814
Query 698 TGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGC 771
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Sbjct 815 TGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGC 888
Query 772 ATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTC 845
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Sbjct 889 ATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTC 962
Query 846 CAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGC 919
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Sbjct 963 CAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGC 1036
Query 920 CCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCA 993
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Sbjct 1037 CCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCA 1110
Query 994 CAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGA 1067
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Sbjct 1111 CAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGA 1184
Query 1068 CGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCA 1141
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Sbjct 1185 CGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCA 1258
Query 1142 CGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTG 1215
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Sbjct 1259 CGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTG 1332
Query 1216 ATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGT 1289
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Sbjct 1333 ATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGT 1406
Query 1290 TCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGC 1363
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Sbjct 1407 TCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGC 1480
Query 1364 TACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG 1407
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Sbjct 1481 TACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG 1524