Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08437
• Subject: NM_001285981.1
• Aligned Length: 1535
• Identities: 1227
• Gaps: 136

Alignment

Query    1  ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGTTGT  74
            ||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGATGTCAGAGCAGGACCTGGCGGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGATCACCCAGTTGT  74

Query   75  TTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGACTAGAAATCAATTGCCAGG  148
            |||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  TTTGGAGAATCATGTCGTGACAGATGATGATGAACCTGCCTTGAAGCGCCAGCGACTAGAGATCAATTGCCAGG  148

Query  149  ATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTGGATAGCATTGAAGCCAAA  222
            |.||.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  149  ACCCCTCTATAAAGTCTTTCCTGTACTCTATTAACCAGACGATATGTTTGCGGTTGGATAGCATTGAGGCCAAG  222

Query  223  TTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCACGAACAAGCAGCACAGCCC  296
            .|||||||.||.|||||.|||||.|||||..|.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.||
Sbjct  223  CTGCAAGCTCTCGAGGCCACTTGCAAATCTCTGGAAGAGAAGCTAGACCTGGTCACCAATAAACAGCACAGTCC  296

Query  297  CATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACAAAGTGCGATGCGCTGTGC  370
            |||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CATCCAGGTCCCCATGGTGGCAGGTTCCCCACTTGGCGCCACCCAGACCTGCAACAAAGTGCGATGCGCTGTTC  370

Query  371  CTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCACCACGAGGACGGGGAGAGC  444
            ||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||.||||.||.|||||||||
Sbjct  371  CTGGGCGTCGGCAGAACACCATCGTGGTGAAAGTGCCTGGTCAGGACGACAGCCACAACGAAGATGGGGAGAGC  444

Query  445  GGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCATCGGGAGCAACGTCACGCT  518
            ||.||.||||||||.|||||.|||||.|.||||||.|||.|.||.||.||||.|||.||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GGGTCAGAGGCCAGTGACTCCGTGTCTAACTGTGGCCAGCCAGGAAGCCAGAACATTGGAAGCAACGTCACACT  518

Query  519  CATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGAACAACCCCGAGATGCGGG  592
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  519  CATCACCCTGAACTCCGAAGAGGACTATCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGATGAGAATAACCCTGAGATGCGGG  592

Query  593  TACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACGGCTGAGAAGATGGCGCTA  666
            |||||||.|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  TACGCTGTGCCATCATCCCTTCCGACATGTTGCACATCAGCACCAACTGTCGCACGGCCGAGAAGATGGCGCTG  666

Query  667  ACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGGGCAGGGCAAGCACGGGAA  740
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  ACACTGCTGGACTACCTGTTCCACCGTGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACTTGTCCGGCCAGGGCAAGCACGGGAA  740

Query  741  GAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAATTTGGCATCACAGAATCCG  814
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  741  GAAGCAGCTGGACCCCCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTCTTCTATAAATTTGGAATCACGGAATCTG  814

Query  815  ACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGCAAGCAGCGGGGCCAGAGC  888
            |||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  815  ACTGGTATCGGATCAAGCAGAGCATTGACTCCAAGTGCCGGACAGCCTGGCGGCGGAAGCAGCGAGGCCAGAGC  888

Query  889  CTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTAC--TGCCCTTCAGAGCCGATGATGAGC  960
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||...|||.|||||.|||  ||||  ||||||.|.||||||.|.
Sbjct  889  CTGGCGGTCAAGAGCTTCTCTCGGAGGACGCCATCCTCATCCTCTTACAGTGCC--TCAGAGACCATGATGGGA  960

Query  961  ACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACTACGCGCTGGCCAACGC  1034
            |||||.|||||..||||.|||||.|.||||.||      |||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  961  ACCCCTCCTCCCACCAGTGAGCTACAGCAGTCA------CAGCCACAGGCCCTACACTACGCCCTGGCCAACGC  1028

Query 1035  ACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGACACCTCCACATCG  1108
            .||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1029  CCAGCAGGTCCAGATCCACCAGATTGGGGAGGATGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAGGGCCACCTCCACATTG  1102

Query 1109  CCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCAGATCCATCACGTGGGG  1182
            ||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 1103  CCCAGGTGCCTCAAGGGGAGCAGGTGCAGATCACACAGGACAGCGAGGGCAATCTGCAGATCCATCATGTGGGT  1176

Query 1183  CAGGA------------------------------------------CGGT-----------------------  1191
            |||||                                          ||||                       
Sbjct 1177  CAGGATGGCCAGTCGTGGGGCCTGTGCCAGAATCCCATTCCTGTCAGCGGTGACTCAGTGGCCCAGGCTAATCC  1250

Query 1192  -------------------------------------------------------------CAGGTGCTGCAGG  1204
                                                                         |||||.|||||||
Sbjct 1251  CTCCCAGCTTTGGCCTCTGGGAGGAGACACACTTGATCTGCCTGCTGGAAATGAAATGATCCAGGTACTGCAGG  1324

Query 1205  GTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCGCGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGC  1278
            ||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||..|.||.||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1325  GTGCTCAGCTCATAGCCGTGGCCTCTTCAGACCCTGCTGCTACAGGAGTAGATGGGTCGCCTCTCCAGGGCAGT  1398

Query 1279  GACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTGAGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCT  1352
            |||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||..||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1399  GACATTCAGGTTCAGTATGTCCAGCTGGCGCCTGTGAGTGACCACACAGCCGCAGCGCAGACCGCAGAGGCCCT  1472

Query 1353  GCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCACGGGGCCATCCAGATTCAG  1407
            |||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1473  GCAGCCCACTCTGCAGCCCGACATGCAGCTTGAACATGGGGCCATCCAGATCCAG  1527