Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08437
- Subject:
- XM_017023381.1
- Aligned Length:
- 1425
- Identities:
- 1396
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAG---- 70
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Sbjct 1 ATGATGTCGGAACACGACCTGGCCGATGTGGTTCAGATTGCAGTGGAAGACCTGAGCCCTGACCACCCAGGTAC 74
Query 71 --------------TTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC 130
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Sbjct 75 AGAGCTGTGGGACATTGTTTTGGAGAATCATGTAGTGACAGATGAAGACGAACCTGCTTTGAAACGCCAGCGAC 148
Query 131 TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG 204
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Sbjct 149 TAGAAATCAATTGCCAGGATCCATCTATAAAGTCATTCCTGTATTCCATCAACCAGACAATCTGCTTGCGGTTG 222
Query 205 GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC 278
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Sbjct 223 GATAGCATTGAAGCCAAATTGCAAGCCCTGGAGGCTACTTGTAAATCCTTAGAAGAAAAGCTGGATCTGGTCAC 296
Query 279 GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA 352
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Sbjct 297 GAACAAGCAGCACAGCCCCATCCAGGTCCCCATGGTGGCCGGCTCCCCTCTCGGGGCAACCCAGACGTGCAACA 370
Query 353 AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC 426
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Sbjct 371 AAGTGCGATGCGCTGTGCCTGGGCGTCGGCAGAACACCATTGTGGTGAAGGTGCCGGGCCAAGAAGACAGCCAC 444
Query 427 CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT 500
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Sbjct 445 CACGAGGACGGGGAGAGCGGCTCGGAGGCCAGCGACTCTGTGTCCAGCTGTGGGCAGGCGGGCAGTCAGAGCAT 518
Query 501 CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA 574
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Sbjct 519 CGGGAGCAACGTCACGCTCATCACCCTGAACTCGGAAGAGGACTACCCCAATGGCACCTGGCTGGGCGACGAGA 592
Query 575 ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG 648
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Sbjct 593 ACAACCCCGAGATGCGGGTACGCTGCGCCATCATCCCCTCCGACATGCTGCACATCAGCACCAACTGCCGCACG 666
Query 649 GCTGAGAAGATGGCGCTAACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG 722
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Sbjct 667 GCCGAGAAGATGGCGCTCACGCTGCTGGACTACCTCTTCCACCGCGAGGTGCAGGCTGTGTCCAACCTCTCGGG 740
Query 723 GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT 796
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Sbjct 741 GCAGGGCAAGCACGGGAAGAAGCAGCTGGACCCGCTCACCATCTACGGCATCCGGTGTCACCTTTTCTATAAAT 814
Query 797 TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC 870
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Sbjct 815 TTGGCATCACAGAATCCGACTGGTACCGAATCAAGCAGAGCATCGACTCCAAGTGCCGCACGGCGTGGCGGCGC 888
Query 871 AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC 944
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Sbjct 889 AAGCAGCGGGGCCAGAGCCTGGCGGTCAAGAGCTTCTCGCGGAGAACGCCCAACTCGTCCTCCTACTGCCCTTC 962
Query 945 AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT 1018
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Sbjct 963 AGAGCCGATGATGAGCACCCCACCTCCTGCCAGCGAGCTCCCGCAGCCACAGCCGCAGCCGCAGGCCCTGCACT 1036
Query 1019 ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTAATCCCACAG 1092
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Sbjct 1037 ACGCGCTGGCCAACGCACAGCAGGTGCAGATCCACCAGATCGGAGAAGACGGACAGGTGCAAGTA--------- 1101
Query 1093 GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA 1166
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Sbjct 1102 GGACACCTCCACATCGCCCAGGTGCCGCAGGGGGAGCAAGTCCAGATCACGCAGGACAGCGAGGGCAACCTCCA 1175
Query 1167 GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCG 1240
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Sbjct 1176 GATCCATCACGTGGGGCAGGACGGTCAGGTGCTGCAGGGTGCACAGCTGATCGCCGTGGCCTCCTCGGACCCCG 1249
Query 1241 CGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTG 1314
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Sbjct 1250 CGGCGGCGGGCGTGGATGGGTCGCCACTCCAGGGCAGCGACATCCAGGTTCAGTACGTGCAGCTGGCGCCAGTG 1323
Query 1315 AGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCA 1388
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Sbjct 1324 AGTGACCACACGGCCGGGGCACAGACGGCCGAAGCCCTGCAGCCCACGCTACAGCCGGAGATGCAGCTCGAGCA 1397
Query 1389 CGGGGCCATCCAGATTCAG 1407
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Sbjct 1398 CGGGGCCATCCAGATTCAG 1416