Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08447
- Subject:
- XM_006508763.1
- Aligned Length:
- 2042
- Identities:
- 1612
- Gaps:
- 112
Alignment
Query 1 ATGAAGGTGTTGGGAAGAAGCTTCT--TCTGGGTGCTGTTTCCCGTCCTTC-CCTG---GGCGGTGCAGGCTGT 68
||||||||..||| |..||..||| |||||.|||||.|||||.||.||| |||| |.|.|| ||||.
Sbjct 1 ATGAAGGTACTGG--ACCAGAGTCTCCTCTGGATGCTGCTTCCCTTCTTTCACCTGATAGCCAGT----GCTGC 68
Query 69 GGAGCACGAGGAGGTGGCGCAGCGTGTGATCAAACTGCACCGCGGGCGAGGGGTG--GCTGCCATGCAGAGCCG 140
.|||||||||||||||||..|||.||..|||||.||||||||||| ||.|||.| .||||||..|||||...
Sbjct 69 CGAGCACGAGGAGGTGGCCAAGCATGCCATCAAGCTGCACCGCGG--GAAGGGCGCCACTGCCACTCAGAGGAA 140
Query 141 GCAGTGGGTCCGGGACAGCTGCAGGAAGCTCTCAGGGCTTCTCCGCCAGAAGAATGCAGTTCTGAACAAACTGA 214
.|||||||.||.||||||||||||||.||||.|.|||||.||..|.||||||||||..||.||.||||||||||
Sbjct 141 ACAGTGGGCCCTGGACAGCTGCAGGAGGCTCACCGGGCTCCTGAGGCAGAAGAATGTGGTCCTCAACAAACTGA 214
Query 215 AAACTGCAATTGGAGCAGTGGAGAAAGACGTGGGCCTGTCGGATGAAGAGAAACTGTTTCAGGTGCACACGTTT 288
|.|.|||.||..||||.||||||||.|||....||||.||||..||.|||||.||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 215 AGAATGCCATCAGAGCCGTGGAGAAGGACACCAGCCTTTCGGGCGAGGAGAAGCTCTTCCAGGTGCACACATTC 288
Query 289 GAAATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCCGTTTTCCAAGCTGTCTACGGACTGCAGAGAGCCCT 362
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||.||..|||||||||||||.||||||||
Sbjct 289 GAGATTTTCCAGAAAGAGCTGAATGAAAGTGAAAATTCGATCTTCCAGGCCATCTACGGACTGCAAAGAGCCCT 362
Query 363 GCAGGGGGATTACAAAGATGTCGTGAACATGAAGGAGAGCAGCCGGCAGCGCCTGGAGGCCCTGAGAGAGGCTG 436
||||||.||.||||.|||.||.||.||||||||.|||||||||..||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 363 GCAGGGCGACTACAGAGACGTGGTCAACATGAAAGAGAGCAGCAAGCAGCGGCTGGAGGCTCTGAGGGAGGCTG 436
Query 437 CAATAAAGGAAGAAACAGAATATATGGAACTTCTGGCAGCAGAAAAACATCAAGTTGAAGCCCTTAAAAATATG 510
|.||.|||||.||.|||||.|||.||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 437 CCATTAAGGAGGAGACAGAGTATGTGGAACTTCTTGCCGCAGAAAAACACCAAGTGGAAGCCCTGAAAAACATG 510
Query 511 CAACATCAAAACCAAAGTTTATCCATGCTTGACGAGATTCTTGAAGATGTAAGAAAGGCAGCGGATCGTCTGGA 584
||||||||||||.|.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.||.||.||||||||
Sbjct 511 CAACATCAAAACAAGAGTCTCTCCATGCTTGACGAGATCCTCGAAGATGTGAGGAAAGCCGCCGACCGTCTGGA 584
Query 585 GGAAGAGATAGAGGAACATGCTTTTGACGACAATAAATCAGTCAAGGGGGTCAATTTTGAGGCAGTTCTGAGGG 658
|||.|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 585 GGAGGAGATCGAGGAGCACGCCTTCGACGACAATAAATCAGTCAAAGGCGTCAACTTTGAGGCAGTTCTGAGAG 658
Query 659 TGGAGGAAGAAGAGGCCAATTCTAAGCAAAATATAACAAAACGAGAAGTGGAGGATGACTTGGGTCTTAGCATG 732
|||||||.||.|||||||..||.|||||.|||||.||.||.||.||.||||||||.|.|.|||||||.||||||
Sbjct 659 TGGAGGAGGAGGAGGCCAGCTCCAAGCAGAATATGACGAAGCGGGAGGTGGAGGACGGCCTGGGTCTCAGCATG 732
Query 733 CTGATTGACTCCCAGAACAACCAGTATATTTTGACCAAGCCCAGAGATTCAACCATCCCACGTGCAGATCACCA 806
||.||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 733 CTCATCGACTCCCAGAACAACCAGTACATTCTGACCAAGCCCAGAGATTCTACTATCCCACGCGCAGACCACCA 806
Query 807 CTTTATAAAGGACATTGTTACCATAGGAATGCTGTCCTTGCCTTGTGGCTGGCTATGTACAGCCATAGGATTGC 880
|||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||
Sbjct 807 CTTCATAAAGGACATCGTGACCATAGGGATGCTGTCCTTACCATGTGGCTGGCTGTGTACAGCAATAGGTCTGC 880
Query 881 CTACAATGTTTGGTTATATTATTTGTGGTGTACTTCTGGGACCTTCAGGACTAAATAGTATTAAGTCTATTGTG 954
||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 881 CTACGATGTTTGGGTATATAATTTGTGGCGTGCTTCTGGGGCCTTCAGGACTGAACAGTATT------------ 942
Query 955 CAAGTGGAGACATTAGGAGAATTTGGGGTGTTTTTTACTCTTTTTCTTGTTGGCTTAGAATTTTCTCCAGAAAA 1028
Sbjct 943 -------------------------------------------------------------------------- 942
Query 1029 GCTAAGAAAGGTGTGGAAGATTTCCTTACAAGGGCCGTGTTACATGACACTGTTAATGATTGCATTTGGCTTGC 1102
||||||||||.|||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||.|.||||||||.||||||||..
Sbjct 943 -------AAGGTGTGGAGGATATCCTTACAAGGACCCTGCTATATGACGCTGCTGATGATTGCCTTTGGCTTAT 1009
Query 1103 TGTGGGGGCATCTCTTGCGGATCAAACCCACGCAGAGCGTCTTCATTTCCACGTGTCTGTCCTTGTCAAGCACA 1176
.||||||.||.|||.|||||||||.||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1010 GGTGGGGACACCTCCTGCGGATCAGACCCACTCAGAGTGTCTTCATTTCCACCTGTCTGTCCTTGTCGAGCACA 1083
Query 1177 CCCCTCGTGTCCAGGTTCCTCATGGGCAGTGCTCGGGGTGACAAAGA---AGGCGACATTGACTACAGCACCGT 1247
|||||.||.|||||||||||..||||.|||||.||.|||||.||||| |||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 1084 CCCCTGGTATCCAGGTTCCTAGTGGGAAGTGCCCGAGGTGATAAAGAAGCAGGTGACATCGACTACAGCACAGT 1157
Query 1248 GCTCCTCGGCATGCTGGTGACGCAGGACGTGCAGCTCGGGCTCTTCATGGCCGTCATGCGGACTCTCATACAGG 1321
|||.||.|||||||||||||.|||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1158 GCTGCTTGGCATGCTGGTGATGCAAGACGTGCAGCTGGGGCTGTTCATTGCCGTCATGCCAACTCTCATACAGG 1231
Query 1322 CGGGCGCCAGTGCATCTTCTAGCATTGTCGTGGAAGTTCTCCGAATCCTGGTTTTGATTGGTCAGATTCTTTTT 1395
|.||.||..|.||.|||||.|||.|||||.|||||||..|.||.||.|||.||.|||||||.||.|||||.|||
Sbjct 1232 CCGGAGCGGGCGCCTCTTCCAGCGTTGTCATGGAAGTATTGCGCATACTGTTTCTGATTGGACAAATTCTCTTT 1305
Query 1396 TCACTAGCGGCGGTTTTTCTTTTATGTCTTGTTATAAAGAAGTATCTCATTGGACCCTATTATCGGAAGCTGCA 1469
||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||.||||.|||||||||.|||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1306 TCGCTAGCTGCTGTCTTTCTTTTGTGTCTTGTCATGAAGACGTATCTCATAGGACCGTATTATCGAAAGCTGCA 1379
Query 1470 CATGGAAAGCAAGGGGAACAAAGAAATCCTGATCTTGGGAATATCTGCCTTTATCTTCTTAATGTTAACGGTCA 1543
|.||||.|||||||||||||||||.|||||..||.|||||.|.||.|||||.|.||||.|.|||.|.|||||||
Sbjct 1380 CCTGGAGAGCAAGGGGAACAAAGAGATCCTCGTCCTGGGAGTGTCAGCCTTCACCTTCCTGATGCTGACGGTCA 1453
Query 1544 CGGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTGGGCTGTTTCCTGGCTGGAGCGCTCGTCTCCTCTCAGGGCCCCGTG 1617
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|.|.||
Sbjct 1454 CAGAGCTGCTGGACGTCTCCATGGAGCTTGGATGCTTCCTGGCTGGAGCGCTGGTCTCTTCCCAAGGGCACATG 1527
Query 1618 GTCACCGAGGAGATCGCCACCTCCATCGAACCCATCCGCGACTTCCTGGCCATCGTTTTCTTCGCCTCCATAGG 1691
|||||||||||||||...||.|.||||||.||.|||||.|||||||||||||||.|.||||||||.||||||||
Sbjct 1528 GTCACCGAGGAGATCATGACTTACATCGAGCCTATCCGTGACTTCCTGGCCATCATCTTCTTCGCATCCATAGG 1601
Query 1692 GCTCCACGTGTTCCCCACGTTTGTGGCGTACGAGCTCACGGTGCTGGTGTTCCTCACCTTGTCAGTGGTGGTGA 1765
||||||.|||||||||||.||||||...||.|||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||..|.|
Sbjct 1602 GCTCCATGTGTTCCCCACCTTTGTGATCTATGAGTTGACGGTGCTGGTGTTCCTCACCCTGTCCGTGGTCATCA 1675
Query 1766 TGAAGTTTCTCCTGGCGGCGCTGGTCCTGTCTCTCATTCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTC 1839
||||||||.|..||||.|.|||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1676 TGAAGTTTGTGTTGGCAGTGCTGGTCTTGTCTCTCATCCTGCCGAGGAGCAGCCAGTACATCAAGTGGATCGTA 1749
Query 1840 TCTGCGGGGCTTGCCCAGGTCAGCGAGTTTTCCTTTGTCCTGGGGAGCCGGGCGCGAAGAGCGGGCGTCATCTC 1913
||.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||.|||.||.||||
Sbjct 1750 TCCGCTGGGCTGGCACAGGTCAGCGAGTTCTCCTTTGTCCTGGGGAGTCGAGCACGGAGAGCAGGCATCCTCTC 1823
Query 1914 TCGGGAGGTGTACCTCCTTATACTGAGTGTGACCACGCTCAGCCTCTTGCTCGCCCCGGTGCTGTGGAGAGCTG 1987
..|.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||.|||.|
Sbjct 1824 CAGAGAGGTGTACCTCCTTATCCTAAGTGTGACCACACTCAGCCTCTTACTCGCCCCAGTGCTGTGGAAAGCAG 1897
Query 1988 CAATCACGAGGTGTGTGCCCAGACCGGAGAGACGGTCCAGCCTC 2031
|.||.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 1898 CCATTACCAAGTGTGTGCCGAGACCAGAGAGGCGCTCAAGTCTC 1941