Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08464
• Subject: NR_135470.1
• Aligned Length: 2072
• Identities: 1337
• Gaps: 734

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGGCGGGGCAGGACCGGCGACCCGGCCCGTGGAGCCGGCGCGGGCGGGCTGCTGAGGTGGCTGTCGCCGGCTCC  74

Query    1  -----------------------------ATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG  45
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGCTGCGGCTTCCCGGGCCGAGCCCCCGATGGAGGCCGAGGCCGCGGACGCTCCCCCGGGCGGGGTTGAGTCG  148

Query   46  GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAATTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT  119
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGCTCAGCTGCTTCTCTTTCAACCAGGACTGCACATCCCTAGCAACTGGAACTAAAGCCGGGTATAAGCTGTT  222

Query  120  TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC  193
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTCTCTGAGTTCTGTGGAGCAGCTGGATCAAGTCCACGGAAGCAATGAAATCCCGGACGTCTACATCGTGGAGC  296

Query  194  GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG  267
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCTTCTCCAGCAGCCTGGTGGTGGTAGTCAGTCACACAAAACCACGGCAGATGAACGTGTATCACTTCAAG  370

Query  268  AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT  341
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAAGGCACAGAGATCTGTAATTACAGCTACTCCAGCAACATCTTGTCCATAAGGCTGAACCGGCAAAGGCTGCT  444

Query  342  GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC  415
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGTTTGCCTAGAAGAGTCCATTTATATTCACAACATTAAAGACATGAAGCTGTTGAAGACCCTCCTGGATATTC  518

Query  416  CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG  489
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTGCAAACCCAACAGGTCTATGTGCTCTCTCTATCAACCATTCCAATTCTTACCTGGCCTATCCTGGAAGCCTG  592

Query  490  ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC  563
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTCAGGGGAGATTGTGCTTTATGATGGAAACTCCCTGAAAACAGTCTGCACTATTGCTGCCCATGAGGGAAC  666

Query  564  ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGG  637
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTAGCTGCCATCACCTTCAATGCCTCAGGCTCCAAACTAGCAAGTGCGTCTGAAAAAGGCACAGTCATCCGGG  740

Query  638  TGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAA---------------------  690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  741  TGTTCTCTGTCCCTGATGGGCAAAAGCTCTATGAGTTCCGGAGAGGGATGAAAAGGTCTGTGTTCAATGTCAAA  814

Query  691  --------------------------------------------------------------------------  690
                                                                                      
Sbjct  815  CCCATTTTAAAGTCCCCGCAGAAGTCCCGCAGGGACCGCTGGCAGCTGTCTAGGGAGAGGACAGAGAGTGGCTC  888

Query  691  -----------------------------------------AGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGT  723
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGTGCCCTCCACTCACCTGGAGGAAGTGTAACTACTCTCCCAGGTATGTGACAATCAGCTCTCTAGTGTTCAGT  962

Query  724  ATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAA  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATGGATTCACAATTCCTCTGCGCCTCCAGTAACACCGAGACGGTACACATCTTCAAGCTGGAACAGGTCACCAA  1036

Query  798  CAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCC  871
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTCGACCAGAAGAGCCTTCGACCTGGAGTGGCTACATGGGAAAGATGTTTATGGCTGCTACCAACTACCTCC  1110

Query  872  CTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGG  945
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTACCCAGGTGTCAGACATGATGCATCAGGACAGGGCTTTTGCCACTGCACGCTTGAACTTCTCCGGACAGAGG  1184

Query  946  AACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT  1019
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AACATCTGTACCCTCTCAACGATCCAGAAGTTGCCACGGCTGCTAGTTGCGTCATCCAGTGGACACCTTTATAT  1258

Query 1020  GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAA  1093
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GTACAATTTGGATCCTCAGGATGGAGGAGAGTGTGTCTTAATCAAAACCCACAGCTTGCTTGGCTCAGGAACAA  1332

Query 1094  CAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGT  1167
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGAAGAGAATAAAGAAAATGACCTCAGACCTTCCTTACCTCAGTCTTATGCAGCGACCGTAGCCAGACCAAGT  1406

Query 1168  GCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACA  1241
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCATCTTCAGCCTCCACGGTGCCAGGTTATTCTGAGGACGGCGGGGCGCTGCGAGGAGAAGTTATTCCTGAACA  1480

Query 1242  TGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATC  1315
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGAGTTTGCGACGGGACCAGTGTGTCTTGATGATGAGAATGAGTTTCCTCCTATAATCTTGTGCCGTGGAAATC  1554

Query 1316  AGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCA---------------------------------------------------  1338
            |||||||||||||||||||||||                                                   
Sbjct 1555  AGAAGGGCAAAACGAAGCAGTCATGATGAGAAGCACACCTCAGAAATCAGGACATCCCCCCTATCAGGTGGTTT  1628

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1629  TGGAGAAAACAAGGAAGGCGGAAGAATGGAGTGCAATTGTGTGAGCAGAAAGGGGGGCAGGAATCCCGGGTGCT  1702

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1703  CCACTGCTTAAACCACAGGACCTGGTTAACTCCTCACCAAGCTTCCCACGACCCTGGTTGCCAATGGGCGCGGG  1776

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1777  AGACATTGTATACACATCATGCTATTTAAAATACGTTCAAACTATAGTGTAAATGCTAATTAACCATATTGGTA  1850

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1851  TATAACCGGAATTTTATATTAAAAGGGGCCTCCTTTTTAAATATATGCCGTGTAAAAAATGTACTTATAGGAAC  1924

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1925  ATCTCTTTGAATTGTATTTCTTGTATATTACATACTTAGAGAGAGACTCTTTTAGCCAGGCAAAGTCTTTTTTG  1998

Query 1339  --------------------------------------------------------------------------  1338
                                                                                      
Sbjct 1999  GCTGTGGCTGGAATAAATCATTTATTACTTGGGAGTCCCATTTTGGACACTAATAATAAAATCATGGCAATGCA  2072