Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08470
• Subject: XM_024450520.1
• Aligned Length: 1839
• Identities: 1475
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAACATCAGTGTTGATTT  20
                                                                  ||||||||||||.|||||||
Sbjct    1  ATGGACCTCGCCAGAAAAGAATTTCTGCGTGGAAATGGCTTAGCTGCTGGGAAAATGAACATCAGTATTGATTT  74

Query   21  GGAAACGAATTATGCCGAGTTGGTTCTAGATGTGGGAAGAGTCACTCTTGGAGAGAACAGTAGGAAAAAAATGA  94
            .||.||.||.|||||.|||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||
Sbjct   75  AGACACAAACTATGCTGAGCTGGTTCTAAATGTGGGAAGAGTCACTCTTGGAGAGAACAATAGAAAAAAAATGA  148

Query   95  AGGATTGTAAACTGAGAAAAAAGCAGAATGAAAGGGTCTCACGAGCTATGTGTGCTCTGCTCAATTCTGGAGGG  168
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||..||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  AGGATTGTCAACTGAGAAAACAGCAGAATGAAAATGTCTCACGAGCTGTGTGTGCTCTGCTGAATTCTGGAGGG  222

Query  169  GGAGTGATCAAGGCTGAAATTGAGAATGAAGACTATAGTTATACAAAAGATGGAATAGGACTAGATTTGGAAAA  242
            ||||||||||||||||||.||||||||.|||.|||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GGAGTGATCAAGGCTGAAGTTGAGAATAAAGGCTATAGTTATAAAAAAGATGGAATAGGGCTAGATTTGGAAAA  296

Query  243  TTCTTTTAGTAACATTCTGTTATTTGTTCCTGAGTACTTAGACTTCATGCAGAATGGTAACTACTTTCTGATTT  316
            |||||||||||||||.|||..||||||||||.|.|.|.|.||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  297  TTCTTTTAGTAACATGCTGCCATTTGTTCCTAATTTCCTGGACTTCATGCAGAATGGTAACTACTTTCACATTT  370

Query  317  TTGTGAAGTCATGGAGCTTGAACACCTCTGGTCTGCGGATTACCACCTTGAGCTCCAATTTGTACAAAAGAGAT  390
            |||||||.||||||||||||.|.||||||||||.||.||||.||||.||||||||||.|||||||||.||||||
Sbjct  371  TTGTGAAATCATGGAGCTTGGAAACCTCTGGTCCGCAGATTGCCACGTTGAGCTCCAGTTTGTACAAGAGAGAT  444

Query  391  ATAACATCTGCAAAAGTCATGAATGCCACTGCTGCACTGGAGTTCCTCAAAGACATGAAAAAGACTAGAGGGAG  464
            .||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||||
Sbjct  445  GTAACGTCTGCAAAAGTCATGAATGCTTCTGCTGCACTGGAGTTCCTCAAAGACATGGAAAAAACTGGAGGGAG  518

Query  465  ATTGTATTTAAGACCAGAATTGCTGGCAAAGAGGCCCCGTGTTGATATACAAGAAGAAAATAACATGAAGGCCT  538
            |...|||||||||||||||||.|..|||||.|||.||.||||||||.||||||||||||.|||||||.|.||||
Sbjct  519  AGCATATTTAAGACCAGAATTCCCTGCAAAAAGGGCCTGTGTTGATGTACAAGAAGAAAGTAACATGGAAGCCT  592

Query  539  TGGCCGGGGTTTTTTTTGATAGAACAGAACTTGATCGGAAAGAAAAATTGACCTTTACTGAATCCACACATGTT  612
            ||||.|..|.|||||||.|.|||||||||||||.|...||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  TGGCTGCTGATTTTTTTAACAGAACAGAACTTGGTTATAAAGAAAAATTGACCTTTACTGAATCCACACACGTT  666

Query  613  GAAATTAAAAACTTCTCGACAGAAAAGTTGTTACAACGAATTAAAGAGATTCTCCCTCAATATGTTTCTGCATT  686
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAATAAAAAACTTCTCGACTGAAAAGTTGTTACAACGAATTACAGAGATTCTCCCTCAATATGTTTCTGCATT  740

Query  687  TGCAAATACTGATGGAGGATATTTGTTCATTGGTTTAAATGAAGATAAAGAAATAATTGGCTTTAAAGCAGAGA  760
            ||||||||||||||||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCAAATACTGATGGAGGATATTTATTCGTTGGTCTAAATGAAGATAAAGAAGTAATTGGCTTTAAAGCAGAGA  814

Query  761  TGAGTGACCTCGATGACTTAGAAAGAGAAATCGAAAAGTCCATTAGGAAGATGCCTGTGCATCACTTCTGTATG  834
            .||||.|.||...|.|.||||||..||.||...||||.||||||.||||..||||||||||||||||||||.||
Sbjct  815  AGAGTTATCTTACTAAGTTAGAAGAAGTAACAAAAAATTCCATTGGGAAACTGCCTGTGCATCACTTCTGTGTG  888

Query  835  GAGAAGAAGAAGATAAATTATTCATGCAAATTCCTTGGAGTATATGATAAAGGAAGTCTTTGTGGATATGTCTG  908
            ||||||..||.|||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|.
Sbjct  889  GAGAAGGGGACGATAAATTACTTATGCAAATTCCTTGGAGTATATGATAAAGGAAGGCTTTGTGGATATGTGTA  962

Query  909  TGCACTCAGAGTGGAGCGCTTCTGCTGTGCAGTGTTTGCTAAAGAGCCTGATTCCTGGCATGTGAAAGATAACC  982
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  963  TGCACTCAGAGTGGAACGCTTCTGCTGTGCAGTGTTTGCTAAAAAGCCTGATTCCTGGCACGTGAAAGATAACA  1036

Query  983  GTGTGATGCAGTTGACCAGGAAGGAATGGATCCAGTTCATGGTGGAGGCTGAACCAAAATTTTCCAGTTCATAT  1056
            |.||.|.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||..|.|||          |||||  ||.|
Sbjct 1037  GAGTTAAGCAGTTGACCGAGAAGGAATGGATCCAGTTCATGGTGGATTCAGAA----------CCAGT--ATGT  1098

Query 1057  GAAGAGGTGATCTCTCAAATAAATACGTCATTACCTGCTC-CCCACAGTTGGCCTCTTTTGGAAT---------  1120
            ||.||..||..|||||.|..||.|||.||||.||||| || ||||.||||..||||||...||||         
Sbjct 1099  GAGGAACTGCCCTCTCCAGCAAGTACATCATCACCTG-TCTCCCAGAGTTATCCTCTTCGTGAATATATTAACT  1171

Query 1121  ----------GGCAACGGCAGAGACATCACTGTCCAGGGCTATCAGGAAGGATAACGTATACTCCAGAAAACCT  1184
                      |.||    |.||||.|||||..||||||||||||||.||.||||||.|.|.||||| |||||||
Sbjct 1172  TCAAAATTCAGCCA----CTGAGATATCACCTTCCAGGGCTATCAGAAAAGATAACTTGTGCTCCA-AAAACCT  1240

Query 1185  T-TGCAGAAAACTGTTCTTACAACATGAAGGACTTAAGCAATTAATATGTGAAGAAATGGACTCTGTCAGAAAG  1257
            | ||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|||
Sbjct 1241  TCTGCAGAAATCTGTTCTCACAACATGAAGGACTTAAGCAATTAATATGTGAAGAAATGGGCTCTGTCAATAAG  1314

Query 1258  GGCTCACTGATCTTCTCTAGGAGCTGGTCTGTGGATCTGGGCTTGCAAGAGAACCACAAAGTCCTCTGTGATGC  1331
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1315  GGCTCACTGATCTTCTCTAGGAGCTGGTCTTTGGATCTGGGCTTGCAAGAGAACCACAAAGTCCTCTGTGATGC  1388

Query 1332  TCTTCTGATTTCCCAGGACAGTCCTCCAGTCCTATACACCTTCCACATGGTACAGGATGAGGAGTTTAAAGGCT  1405
            ||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1389  TCTTCTGATTTCCCAGGACAAGCCTCCAGTCCTATACACCTTCCACATGGTACAGGATGAGGAGTTTAAAGACT  1462

Query 1406  ATTCTACACAAACTGCCCTAACCTTAAAGCAGAAGCTGGCAAAAATTGGTGGTTACACTAAAAAAGTGTGTGTC  1479
            ||||||||||||||||||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1463  ATTCTACACAAACTGCCCAAACTTTAAAACAGAAGCTGGCAAAAATTGGTGGTTACACTAAAAAAGTGTGTGTC  1536

Query 1480  ATGACAAAGATCTTCTACTTGAGCCCTGAAGGCATGACAAGCTGCCAGTATGATTTAAGGTCGCAAGTAATTTA  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1537  ATGACAAAGATCTTCTACTTGAGCCCTGAAGGCAAGACAAGCTGCCAGTATGATTTAAACTCGCAAGTAATTTA  1610

Query 1554  CCCTGAATCCTACTATTTTAC---------AAGAAGGAAATACTTGCTGAAA--GCCCTTT--------TTAAA  1608
            |||||||||||||||||..||         ||.||.||||.|||||  ||||  |||||||        |||  
Sbjct 1611  CCCTGAATCCTACTATTGGACAACAGCTCAAACAATGAAAGACTTG--GAAAAGGCCCTTTCAAATATCTTA--  1680

Query 1609  GCCTTAAAGAGACTCAAGTCTCTGAGAGACCAGTT-TTCCTTTGCAGAAAATCTATACCAGATAATCGGTATAG  1681
              |.|||.||||.||||.|||.|          || ||..||||       |.|.|        .|||.|.|.|
Sbjct 1681  --CCTAAGGAGAATCAAATCTTT----------TTGTTTGTTTG-------TTTGT--------TTCGTTTTTG  1727

Query 1682  ATTGCT----------TTCAGAAGAATGATAAAAAGATGTTTAAATCTTGTCGAAGGCTCACC  1734
            .|||.|          ||        ||.|       ||||| ..||||| .||         
Sbjct 1728  TTTGTTTGTTTGTTGGTT--------TGTT-------TGTTT-TTTCTTG-AGA---------  1764