Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08497
• Subject: NM_139119.2
• Aligned Length: 2250
• Identities: 2216
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAAGATCTGTTTGAAACTTTCCAAGATGAGATGGGATTCTCCAACATGGAAGATGATGGCCCAGAAGAGGA  74

Query   42  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGCGTGTGGCTGAGCCTCAAGCTAACTTTAACACCCCTCAAGCTCTACGGTTTGAGGAACTACTGGCCAACC  148

Query  116  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TACTAAATGAACAACATCAGATAGCGAAGGAACTATTTGAACAGCTGAAGATGAAGAAACCTTCAGCCAAACAG  222

Query  190  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGAAGGAGGTAGAGAAGGTTAAACCCCAGTGTAAGGAAGTTCATCAGACCCTGATTCTGGACCCAGCACAAAG  296

Query  264  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGAGACTCCAGCAGCAGATGCAGCAGCATGTTCAGCTCTTGACACAAATCCACCTTCTTGCCACCTGCAACC  370

Query  338  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATCTCAATCCGGAGGCCAGTAGCACCAGGATATGTCTTAAAGAGCTGGGAACCTTTGCTCAAAGCTCCATC  444

Query  412  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCCCTTCACCATCAGTACAACCCCAAGTTTCAGACCCTGTTCCAACCCTGTAACTTGATGGGAGCTATGCAGCT  518

Query  486  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GATTGAAGACTTCAGCACACATGTCAGCATTGACTGCAGCCCTCATAAAACTGTCAAGAAGACTGCCAATGAAT  592

Query  560  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTCCCTGTTTGCCAAAGCAAGTGGCTTGGATCCTGGCCACAAGCAAGGTTTTCATGTATCCAGAGTTACTTCCA  666

Query  634  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGTGTTCCCTGAAGGCAAAGAATCCCCAGGATAAGATCCTCTTCACCAAGGCTGAGGACAATTTGTTAGCTTT  740

Query  708  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGGACTGAAGCATTTTGAAGGGACTGAGTTTCTTAACCCTCTAATCAGCAAGTACCTTCTAACCTGCAAGACTG  814

Query  782  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCCGCCAACTGACAGTGAGAATCAAGAACCTCAACATGAACAGAGCTCCTGACAACATCATTAAATTTTATAAG  888

Query  856  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGACCAAACAGCTGCCAGTCCTAGGAAAATGCTGTGAAGAGATCCAGCCACATCAGTGGAAGCCACCTATAGA  962

Query  930  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAGAGAAGAACACCGGCTCCCATTCTGGTTAAAGGCCAGTCTGCCATCCATCCAGGAAGAACTGCGGCACATGG  1036

Query 1004  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGATGGTGCTAGAGAGGTAGGAAATATGACTGGAACCACTGAGATCAACTCAGATCAAGGCCTAGAAAAAGAC  1110

Query 1078  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AACTCAGAGTTGGGGAGTGAAACTCGGTACCCACTGCTATTGCCTAAGGGTGTAGTCCTGAAACTGAAGCCAGT  1184

Query 1152  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCGACCGTTTCCCCAAGAAGGCTTGGAGACAGAAGCGTTCATCAGTCCTGAAACCCCTCCTTATCCAACCCA  1258

Query 1226  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCCCTCTCTCCAGCCCAGCTTCAACCCTGGGAAAACACCAGCCCAATCAACTCATTCAGAAGCCCCTCCGAGC  1332

Query 1300  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAATGGTGCTCCGGATTCCTCACCCAATACAGCCAGCCACTGTTTTACAGACAGTTCCAGGTGTCCCTCCACT  1406

Query 1374  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGGTCAGTGGAGGTGAGAGTTTTGAGTCTCCTGCAGCACTGCCTGCTATGCCCCCTGAGGCCAGGACAAGCT  1480

Query 1448  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCTTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1521
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCCCTCTGTCTGAGTCCCAGACTTTGCTCTCTTCTGCCCCTGTGCCCAAGGTAATGATGCCCTCCCCTGCCTCT  1554

Query 1522  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCCATGTTTCGAAAGCCATATGTGAGACGGAGACCCTCAAAAAGAAGGGGAGCCAGGGCCTTTCGCTGTATCAA  1628

Query 1596  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ACCTGCCCCTGTTATCCACCCTGCATCTGTTATCTTCACTGTTCCTGCTACCACTGTGAAGATTGTGAGCCTTG  1702

Query 1670  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCGGTGGCTGTAACATGATCCAGCCTGTCAATGCGGCTGTGGCCCAGAGTCCCCAGACTATTCCCATCGCCACC  1776

Query 1744  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CTCTTGGTTAACCCTACTTCCTTCCCCTGTCCATTGAACCAGCCCCTTGTGGCCTCCTCTGTCTCACCCTTAAT  1850

Query 1818  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGTTTCTGGCAATTCTGTGAATCTTCCTATACCATCCACCCCTGAAGATAAGGCCCACATGAATGTGGACATTG  1924

Query 1892  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTGTGCTGTGGCTGATGGGGAAAATGCCTTTCAGGGCCTAGAACCCAAATTAGAGCCCCAGGAACTATCTCCT  1998

Query 1966  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CTCTCTGCTACTGTTTTCCCCAAAGTGGAACATAGCCCAGGGCCTCCACCAGTCGATAAACAGTGCCAAGAAGG  2072

Query 2040  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ATTGTCAGAGAACAGTGCCTATCGCTGGACCGTTGTGAAAACAGAGGAGGGAAGGCAAGCTCTGGAGCCGCTCC  2146

Query 2114  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CTCAGGGCATCCAGGAGTCTCTAAACAACTCTTCCCCTGGGGATTTAGAGGAAGTTGTCAAGATGGAACCTGAA  2220

Query 2188  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2217
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  GATGCTACAGAGGAAATCAGTGGATTTCTT  2250