Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08550
• Subject: XM_006724765.3
• Aligned Length: 2211
• Identities: 2063
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGGATGACGACAAACCTTTTCAACCAAAAAACATTTCAAAAATGGCAGAACTCTTTATGGAATGTGAAGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGATGACGACAAACCTTTTCAACCAAAAAACATTTCAAAAATGGCAGAACTCTTTATGGAATGTGAAGAAGA  74

Query   75  AGAGCTAGAGCCATGGCAGAAGAAAGTAGAAGAAACTCAGGATGAGGATGACGATGAACTGATCTTTGTTGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGAGCTAGAGCCATGGCAGAAGAAAGTAGAAGAAACTCAGGATGAGGATGACGATGAACTGATCTTTGTTGGAG  148

Query  149  AGATATCAAGTTCAAAACCAGCCATTTCAAATATTTTGAACAGAGGCCACTCCAGCTCATCTTCAAAAGGAATA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGATATCAAGTTCAAAACCAGCCATTTCAAATATTTTGAACAGAGGCCACTCCAGCTCATCTTCAAAAGGAATA  222

Query  223  AAGAGTGAGCCACACAGTCCAGGTATTCCTGAAATATTCAGGACTGCAAGTCAACGCTGCAGAGACCCACCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAGAGTGAGCCACACAGTCCAGGTATTCCTGAAATATTCAGGACTGCAAGTCAACGCTGCAGAGACCCACCATC  296

Query  297  AAATCCAGTGGCTGCCTCGCCTAGATTTCATCTTGTATCTAAATCTTCACAAAGCTCTGTTACTGTTGAGAATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATCCAGTGGCTGCCTCGCCTAGATTTCATCTTGTATCTAAATCTTCACAAAGCTCTGTTACTGTTGAGAATG  370

Query  371  CGTCTAAACCTGATTTTACAAAGAATTCACAAGTTGGATCGGATAATTCTTCAATTTTACTGTTTGACTCGACC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CGTCTAAACCTGATTTTACAAAGAATTCACAAGTTGGATCGGATAATTCTTCAATTTTACTGTTTGACTCGACC  444

Query  445  CAGGAATCACTACCACCATCCCAAGACATACCAGCAATTTTTAGAGAAGGTATGAAAAATACTTCATATGTGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGGAATCACTACCACCATCCCAAGACATACCAGCAATTTTTAGAGAAGGTATGAAAAATACTTCATATGTGTT  518

Query  519  GAAACATCCTTCTACTTCTAAAGTAAACAGTGTTACTCCAAAAAAACCAAAGACCAGTGAAGATGTTCCTCAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAACATCCTTCTACTTCTAAAGTAAACAGTGTTACTCCAAAAAAACCAAAGACCAGTGAAGATGTTCCTCAGA  592

Query  593  TAAATCCCTCCACTTCATTGCCTTTAATTGGCTCTCCTCCAGTGACATCCTCCCAAGTTATGCTGTCAAAAGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAATCCCTCCACTTCATTGCCTTTAATTGGCTCTCCTCCAGTGACATCCTCCCAAGTTATGCTGTCAAAAGGT  666

Query  667  ACAAATACCTCATCTCCATATGATGCTGGAGCAGATTACCTAAGAGCTTGTCCAAAGTGCAATGTTCAGTTCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACAAATACCTCATCTCCATATGATGCTGGAGCAGATTACCTAAGAGCTTGTCCAAAGTGCAATGTTCAGTTCAA  740

Query  741  TCTTTTGGATCCTTTGAAATACCACATGAAGCATTGTTGTCCAGACATGATAACTAAATTTTTGGGAGTAATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCTTTTGGATCCTTTGAAATACCACATGAAGCATTGTTGTCCAGACATGATAACTAAATTTTTGGGAGTAATTG  814

Query  815  TTAAATCAGAACGTCCATGTGATGAAGACAAGACTGATTCAGAGACAGGAAAGTTGATCATGTTAGTCAATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTAAATCAGAACGTCCATGTGATGAAGACAAGACTGATTCAGAGACAGGAAAGTTGATCATGTTAGTCAATGAG  888

Query  889  TTTTATTATGGAAGGCATGAAGGAGTCACTGAGAAAGAGCCAAAGACTTACACAACCTTTAAATGCTTCAGTTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTTATTATGGAAGGCATGAAGGAGTCACTGAGAAAGAGCCAAAGACTTACACAACCTTTAAATGCTTCAGTTG  962

Query  963  CTCGAAAGTTCTTAAAAATAATATTAGGTTTATGAACCACATGAAACATCACTTGGAACTTGAGAAGCAGAACA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTCGAAAGTTCTTAAAAATAATATTAGGTTTATGAACCACATGAAACATCACTTGGAACTTGAGAAGCAGAACA  1036

Query 1037  ATGAAAGCTGGGAAAACCACACCACCTGCCAGCACTGTTACCGGCAATATCCCACACCCTTCCAACTGCAGTGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATGAAAGCTGGGAAAACCACACCACCTGCCAGCACTGTTACCGGCAATATCCCACACCCTTCCAACTGCAGTGC  1110

Query 1111  CACATTGAGAGTACACACACTCCCCATGAGTTTTCTACTATTTGCAAAATCTGTGAATTATCATTTGAAACAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CACATTGAGAGTACACACACTCCCCATGAGTTTTCTACTATTTGCAAAATCTGTGAATTATCATTTGAAACAGA  1184

Query 1185  GCATATTCTTTTACAACATATGAAGGACACCCATAAACCTGGTGAAATGCCATATGTTTGCCAGGTTTGCCAGT  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1185  GCATATTCTTTTACAACATATGAAGGACACCCATAAACCTGGTGAAATGCCATATGTTTGC-------------  1245

Query 1259  TTAGATCATCAACATTTTCTGATGTAGAAGCTCATTTTAGAGCAGCCCATGAAAACACTAAGAACTTGCTATGT  1332
                                                                                      
Sbjct 1246  --------------------------------------------------------------------------  1245

Query 1333  CCATTTTGCCTCAAAGTTAGTAAAATGGCAACCCCCTACATGAATCATTACATGAAGCATCAGAAAAAAGGAGT  1406
                                                                        ||||||||||||||
Sbjct 1246  ------------------------------------------------------------CAGAAAAAAGGAGT  1259

Query 1407  TCATCGTTGCCCAAAATGCAGACTACAATTTTTGACCAGCAAGGAGAAAGCTGAACATAAGGCGCAGCATCGTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1260  TCATCGTTGCCCAAAATGCAGACTACAATTTTTGACCAGCAAGGAGAAAGCTGAACATAAGGCGCAGCATCGTA  1333

Query 1481  CATTTATAAAGCCTAAAGAACTAGAAGGATTGCCTCCTGGAGCAAAAGTTACTATTCGAGCTTCACTTGGACCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1334  CATTTATAAAGCCTAAAGAACTAGAAGGATTGCCTCCTGGAGCAAAAGTTACTATTCGAGCTTCACTTGGACCT  1407

Query 1555  CTCCAGTCAAAATTACCAACTGCACCTTTCGGTTGCGCTCCAGGCACTTCTTTTCTTCAGGTCACACCTCCGAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1408  CTCCAGTCAAAATTACCAACTGCACCTTTCGGTTGCGCTCCAGGCACTTCTTTTCTTCAGGTCACACCTCCGAC  1481

Query 1629  ATCTCAAAATACAACTGCTAGAAATCCTAGAAAATCTAATGCCAGTAGATCTAAGACAAGTAAGCTTCATGCAA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1482  ATCTCAAAATACAACTGCTAGAAATCCTAGAAAATCTAATGCCAGTAGATCTAAGACAAGTAAGCTTCATGCAA  1555

Query 1703  CTACATCCACTGCAAGTAAAGTTAATACAAGTAAGCCAAGGGGACGTATAGCTAAGTCCAAAGCAAAACCCTCT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1556  CTACATCCACTGCAAGTAAAGTTAATACAAGTAAGCCAAGGGGACGTATAGCTAAGTCCAAAGCAAAACCCTCT  1629

Query 1777  TACAAGCAAAAGCGACAGCGCAACAGAAAAAATAAAATGAGCCTTGCTTTGAAGAACATAAGGTGTCGTCGGGG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1630  TACAAGCAAAAGCGACAGCGCAACAGAAAAAATAAAATGAGCCTTGCTTTGAAGAACATAAGGTGTCGTCGGGG  1703

Query 1851  CATTCACAAGTGCATTGAATGTCATTCCAAAATAAAAGATTTTGCAAGCCACTTTTCTATATACATCCACTGCA  1924
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1704  AATTCACAAGTGCATTGAATGTCATTCCAAAATAAAAGATTTTGCAAGCCACTTTTCTATATACATCCACTGCA  1777

Query 1925  GTTTTTGCAAGTACAATACTAACTGTAACAAAGCCTTTGTAAATCATATGATGAGCTCTCATAGCAACCATCCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1778  GTTTTTGCAAGTACAATACTAACTGTAACAAAGCCTTTGTAAATCATATGATGAGCTCTCATAGCAACCATCCA  1851

Query 1999  GGTAAACGGTTTTGTATTTTCAAGAAGCATTCAGGAACTCTCAGGGGCATTACTCTAGTGTGCCTTAAATGTGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1852  GGTAAACGGTTTTGTATTTTCAAGAAGCATTCAGGAACTCTCAGGGGCATTACTCTAGTGTGCCTTAAATGTGA  1925

Query 2073  TTTCCTAGCTGATTCTTCCGGCTTAGATCGTATGGCTAAACACTTAAGTCAACGTAAAACTCATACTTGCCAAG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1926  TTTCCTAGCTGATTCTTCCGGCTTAGATCGTATGGCTAAACACTTAAGTCAACGTAAAACTCATACTTGCCAAG  1999

Query 2147  TTATAATAGAGAATGTTTCCAAAAGTACCTCAACTTCTGAACCCACTACTGGCTGCTCATTGAAA  2211
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2000  TTATAATAGAGAATGTTTCCAAAAGTACCTCAACTTCTGAACCCACTACTGGCTGCTCATTGAAA  2064