Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08553
- Subject:
- NM_017720.3
- Aligned Length:
- 1347
- Identities:
- 1208
- Gaps:
- 138
Alignment
Query 1 ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCTGCCTTCACACTACTATGAGAGCTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCTCTGCCCTGAGGCCACCCCGTGTCCCCAAGCCTAAGGGTGTCCTGCCTTCACACTACTATGAGAGCTT 74
Query 75 TCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACCGGGATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACCATTTATT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCTAGAGAAGAAGGGGCCCTGTGACCGGGATTACAAGAAGTTCTGGGCAGGCCTGCAGGGTCTCACCATTTATT 148
Query 149 TCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAGCACGTGGAGAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCTACAATAGCAATCGGGACTTCCAGCACGTGGAGAAGCTCAACTTGGGAGCATTTGAGAAACTCACAGATGAG 222
Query 223 ATTCCCTGGGGAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGAATCAGGAGATCAAGTTCAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTCCCTGGGGAAGCTCACGTGACCCTGGCACCCACTTCAGCCTGATTCTCCGGGATCAGGAGATCAAGTTCAA 296
Query 297 GGTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAATGTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAGCTCCGTGTCCCGACCG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTAGAGACCTTGGAGTGTCGGGAAATGTGGAAAGGCTTCATCTTAACGGTGGTGGAGCTCCGTGTCCCGACCG 370
Query 371 ACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTCTTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTTGACCCTGCTTCCTGGGCACCTATACATGATGTCTGAAGTCTTGGCCAAAGAGGAGGCGCGCCGTGCACTG 444
Query 445 GAGACACCCTCGTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCTACCCCGAGTGCGG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GAGACACCCTCGTGCTTCCTGAAGGTGAGCCGGCTGGAGGCACAACTGCTCCTGGAGCGCTACCCCGAGTGCGG 518
Query 519 GAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGACGGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GAACCTGCTGCTGCGGCCCAGCGGGGACGGCGCCGACGGCGTGTCGGTCACCACGCGGCAGATGCACAACGGGA 592
Query 593 CGCACGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCGATGTGGAACAGCCGTTCTCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CGCACGTGGTCCGGCATTACAAGGTGAAGCGGGAGGGCCCCAAGTACGTGATCGATGTGGAACAGCCGTTCTCT 666
Query 667 TGCACCTCCCTGGACGCCGTGGTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTTAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TGCACCTCCCTGGACGCCGTGGTCAACTATTTCGTGTCGCATACCAAAAAGGCGCTGGTGCCATTCCTGTTAGA 740
Query 741 CGAGGACTACGAGAAGGTGCTAGGCTACGTGGAAGCCGATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CGAGGACTACGAGAAGGTGCTAGGCTACGTGGAAGCCGATAAGGAGAATGGCGAGAATGTGTGGGTGGCGCCCT 814
Query 815 CCGCTCCGGGCCCAGGTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACCTGCGTCTAGCCAGGACAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CCGCTCCGGGCCCAGGTCCTGCACCCTGCACAGGTGGCCCCAAGCCGCTGTCACCTGCGTCTAGCCAGGACAAG 888
Query 889 CTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGGAAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGCCCCCACTGCCCCCACTACCGAACCAGGAAGAGAACTACGTGACCCCCATTGGAGATGGCCCAGCTGTTGA 962
Query 963 CTATGAGAACCAAGATGTGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAAGCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTATGAGAACCAAGATGTGGCTTCCTCTAGTTGGCCAGTCATCCTGAAGCCAAAGAAGTTGCCAAAGCCTCCTG 1036
Query 1037 CCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTGGACCCAAG------------------------------------------ 1068
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCAAGCTTCCAAAGCCACCCGTTGGACCCAAGCCAGTAGAGAAGGGGTTTCACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTC 1110
Query 1069 -------------------------------------------------------------------------- 1068
Sbjct 1111 GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACCGGCGTGAGCCACCACAC 1184
Query 1069 ----------------------CCAGAGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGCAGGAAGCTGCCAGTCAGTT 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTGGCCTCATCTGTCTTCTCTTCCAGAGCCCAAAGTCTTTAATGGTGGCTTGGGCAGGAAGCTGCCAGTCAGTT 1258
Query 1121 CAGCCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCGGGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGAGG 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGCCCAGCCTCTCTTCCCCACAGCCGGGCTGGCAGACATGACGGCAGAGCTACAGAAGAAGCTGGAGAAGAGG 1332
Query 1195 CGGGCACTGGAGCAC 1209
|||||||||||||||
Sbjct 1333 CGGGCACTGGAGCAC 1347