Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_08557
- Subject:
- NM_001080754.1
- Aligned Length:
- 3628
- Identities:
- 3323
- Gaps:
- 5
Alignment
Query 1 ATGAAGGTTGTCCCAGAAAAGAATGCTGTCCGGATACTCTGGGGGCGAGAACGGGGTGCTCGGGCCATGGGAGC 74
|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||..||||.||||||||.||
Sbjct 1 ATGAAAGTTGTCCCAGAGAAGAATGCTGTACGAATCCTCTGGGGCCGAGAACGGGGCACTCGTGCCATGGGTGC 74
Query 75 TCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTAGAGGATAAAACCCGGTGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC 148
.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTGGAGGATAAGACTCGATGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC 148
Query 149 CGGATAGTCCACGCTCTACCTTCTTATTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTAGCCTCCACCCATGTGAAC 222
|.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 149 CTGATAGTCCACGCTCGACCTTCTTACTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTGGCATCCACACATGTGAAC 222
Query 223 CATAATATCTATATTACGGAGGTGAAGACTGGCAAGTGTGTTCATTCCCTGATTGGACACCGCCGTACTCCATG 296
|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATAACATCTATATTACAGAGGTTAAGACTGGCAAGTGTGTTCACTCTCTGATCGGACACCGCCGTACTCCATG 296
Query 297 GTGTGTCACTTTTCATCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGCTGCCTAGATGGGGAGGTTAGGATTTGGG 370
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 GTGTGTCACTTTTCACCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGTTGCCTAGATGGGGAAGTTAGGATTTGGG 370
Query 371 ATTTACACGGTGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGATAGCAACAATGCCATTGCCTCCCTGGCTTTCCACCCTACG 444
|||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTTACATGGGGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGACAGCAACAATGCCATAGCCTCCTTGGCTTTCCACCCTACG 444
Query 445 GCTCAGCTCCTGCTGATTGCCACTGCCAATGAGATCCACTTCTGGGACTGGAGTCGACGGGAACCCTTTGCTGT 518
||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 445 GCTCAGCTTCTACTAATTGCCACTGCAAATGAGATCCATTTCTGGGATTGGAGTCGTCGGGAGCCCTTTGCTGT 518
Query 519 GGTGAAGACAGCTAGTGAGATGGAACGGGTCCGTCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTCACAG 592
||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GGTGAAAACAGCCAGTGAGATGGAGCGTGTCCGCCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTTACAG 592
Query 593 CAATTGTTAACCCCTCTAATCAACAGGGTGATGACGAACCAGAGATCCCCATAGATGGAACAGAATTATCCCAC 666
|.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct 593 CTATTGTTAACCCTTCTAATCAGCAGGGTGATGACGAACCAGAAATCCCTATAGATGGAACAGAGTTATCTCAT 666
Query 667 TACCGTCAGCGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACGCCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT 740
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACCGTCAACGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACACCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT 740
Query 741 GTCCTCCCGCTCTTCTGGCATCCAGACCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCCTCGTCAACGCAGCAGGACC 814
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GTCCTCCCGTTCCTCTGGCATCCAGACCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCTTCATCAACGCAGCAGGACC 814
Query 815 AGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCTGCCTTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCCGGCAACACGCTCCGCAACCTC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCTGCCTTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCGGGCAACACGCTCCGCAACCTC 888
Query 889 AGTCTGGGTCCTACCCGCCGCTCTTTGGGAGGGCCTCTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACCGAGAAATAGC 962
|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 889 AGTCTGGGTCCTACCCGGCGCTCTTTGGGGGGCCCTTTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACAGAGAACTAGC 962
Query 963 TCCTGGGTTGACAGGATCTGAGTGGACCCGGACAGTACTCAGTCTGAACTCCCGCTCTGAGGCGGAATCCATGC 1036
.||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||..|||||.||||
Sbjct 963 CCCTGGGCTGACAGGTTCTGAGTGGACCCGGACAGTACTCACTCTGAACTCTCGTTCTGAGGTAGAATCTATGC 1036
Query 1037 CCCCGCCCAGAACCAGTGCCTCTTCGGTGAGTTTGCTGTCTGTGCTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCA 1110
||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CCCCACCGAGGACCAGTGCCTCCTCAGTGAGTTTGCTTTCTGTACTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCA 1110
Query 1111 TCTGTGTACACTTCAGCCACAGAAGGGAGGGGTTTTCCGGCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAA 1184
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCTGTGTATACTTCAGCCACAGAAGGGAGGGGTTTTCCATCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAA 1184
Query 1185 TGGCTCCAGCCAAAACAACTCGGGCAGCATTCGCCATGAGCTTCAGTGTGACCTGAGACGCTTCTTTCTGGAGT 1258
|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1185 TGGTTCCAGCCAAAACAACTCAGGCAGCATTCGCCATGAGCTTCAATGTGACCTGAGACGCTTCTTTTTGGAGT 1258
Query 1259 ATGACCGGCTTCAGGAGCTGGATCAGAGCCTGAGTGGGGAAGCTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTC 1332
|||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ATGACAGGCTGCAGGAGCTGGATCAGAGCCTGAGTGGGGAAACTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTC 1332
Query 1333 AACAATAACATTGAATCTGAGAGGCCAGGCCCTTCCCACCAGCCCACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAA 1406
||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACAATAATATTGAATCTGAGAGACCAGGTCCTTCCCACCTGCCTACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAA 1406
Query 1407 CCTGTCCCGTGGCCACCTGAATCGCTGTCGTGCTTGCCACAATCTCCTGACCTTCAACAACGATACCCTGCGCT 1480
||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407 CCTGTCTCGGGGCCACCTTAATCGATGCCGTGCTTGCCATAATCTTCTAACCTTCAACAATGATACCCTTCGTT 1480
Query 1481 GGGAAAGAACCACACCTAACTACTCCTCTGGCGAGGCTAGTTCCTCTTGGCAGGTCCCCAGCT-CCTTTGAGAG 1553
|||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||.||| || ||||||||.|
Sbjct 1481 GGGAAAGAACCACACCTAACTACTCATCTGGTGAGGCTAGCTCTTCCTGGCACGTCTCCA-CTACCTTTGAGGG 1553
Query 1554 TGTGCCATCAAGTGGCAGCCAGTTGCCACCTCTCGAGCGGACTGAGGGCCAAACGCCCAGCTCCAGCAGGCTGG 1627
..|||||.|||||||||.||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||
Sbjct 1554 CATGCCACCAAGTGGCAACCAGCTACCACCTCTTGAGCGGACTGAGGGCCAAATGCCTAGCTCCAGCAGGCTGG 1627
Query 1628 AGTTGAGCAGCTCTGCTAGTCCGCAGGAGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGG 1701
||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AGTTGAGCAGCTCTGCTAGTTCACAAGAGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGG 1701
Query 1702 GAAAGAATTTACACCCAGTCCAGCAGATCTGGAACTGTGTCACAGGAGGCCTTACATCAGGATATGCCTGAGGA 1775
|||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1702 GAACGCATTTATACCCAGTCCAGCAGATCTGGAACTGTATCACAGGAGGCCTTACATCAAGATATGCCTGAAGA 1775
Query 1776 GAGCTCTGAGGAGGATTCACTCAGGAGGAGGCTGCTGGAATCTTCCCTCATTTCATTATCCCGTTATGATGGAG 1849
.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1776 AAGCTCTGAGGAAGACTCCCTCAGGAGGAGGCTGCTGGAGTCTTCCCTCATTTCATTATCCCGTTATGATGGAG 1849
Query 1850 CAGGATCCAGAGAGCACCCAATTTACCCAGACCCAGCGAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATG 1923
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1850 CAGGATCCAGAGAGCACCCAATTTACCCAGACCCAGCGAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATG 1923
Query 1924 ATCCAGTATCTCTCACGGAGAGACAGTATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAACCGTCTCCGTTCTTC 1997
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1924 ATCCAGTATCTCTCAAGGAGAGACAGTATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAATCGGCTTCGTTCTTC 1997
Query 1998 CACCTCCTCCTCTTCCTCAGACAACCAGGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGG 2071
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1998 CACCTCCTCTTCTTCCTCAGACAACCAGGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGG 2071
Query 2072 ACAATGGTGACAGATCCAGGCACCGAGCTCCACGCAATGCCCGGATGTCTGCACCTTCGCTTGGACGCTTTGTC 2145
||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2072 ACAATGGTGACAGATCTAGGCACCGAGCTCCCCGAAATGCCCGAATGTCTGCACCTTCACTTGGACGATTTGTT 2145
Query 2146 CCAAGGCGTTTCTTGCTGCCTGAGTACTTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGC 2219
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2146 CCAAGGCGTTTTTTGCTGCCTGAGTACTTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGC 2219
Query 2220 TACTCACTCTTCTGTTAACAGGGTCCTGGCAGGGGCAGTGATCGGTGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACA 2293
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220 TACTCATTCTTCTGTTAACAGGGTCCTGGCAGGGGCAGTAATTGGAGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACA 2293
Query 2294 TTGCCAATACTACCTACCGGCTCCAGTGGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTCCCTGAAATCAGTAATGCTTCC 2367
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.
Sbjct 2294 TTGCCAATACTACCTACAGGCTCCAGTGGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTTCCAGAAATCAGTAATGCCTCT 2367
Query 2368 GTGAATGTGCTGGTGCAGAACTGCAAGATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGCCAGCTCCT 2441
||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2368 GTGAATGTCCTGGTACAGAATTGCAAGATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGTCAGCTCCT 2441
Query 2442 GGCAGCTTTCATCCCCAGCAGCCAGAGGGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTACTCCCTGGCCCCCC 2515
||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2442 GGCAGCCTTCATCCCGAGCAGCCAGAGGGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTATTCCCTGGCCCCCC 2515
Query 2516 ATAACCTGGGCGAAATGCTCTACACCAAGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCGGTGAGCCTGTCCCCAATGGGC 2589
|||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||
Sbjct 2516 ATAACTTGGGGGAAATGCTCTACACCAAGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCTGTAAGCCTGTCCCCGATGGGC 2589
Query 2590 AGATATGTAATGGTGGGCTTGGCCTCACGAAGGATCCTGCTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTGGCCCAGGT 2663
.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2590 CGATACGTTATGGTGGGCTTGGCCTCACGAAGGATCCTACTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTAGCCCAGGT 2663
Query 2664 CTTCAGGCTGCAACAGGCCCATGGTGGAGAGACCTCCATGAGGAGAGTTTTCAACGTCCTTTATCCCATGCCTG 2737
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2664 CTTCAGGCTGCAACAGGCCCATGGTGGTGAGACTTCCATGAGGAGAGTTTTCAATGTCCTTTACCCCATGCCTG 2737
Query 2738 CCGACCAGCGGAGACATGTCAGTATCAACTCTGCCCGTTGGCTGCCTGAGCCAGGGCTTGGCTTGGCCTATGGT 2811
|.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2738 CAGACCAACGGAGACACGTCAGCATCAACTCTGCCCGTTGGCTACCCGAGCCAGGGCTTGGTTTGGCCTATGGC 2811
Query 2812 ACTAACAAAGGAGACCTGGTGATCTGCCGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGTGTTGAGTACTACTGGGACCAGCT 2885
||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 2812 ACCAACAAAGGAGACTTGGTGATCTGCCGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGCATCGAGTACTACTGGGACCAGCT 2885
Query 2886 GAACGAGACGGTCTTCACTGTCCATTCCAACAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACATGGA 2959
.|..||.||.||||||||||||||.||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2886 AAGTGAAACAGTCTTCACTGTCCACTCAAGTAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACGTGGC 2959
Query 2960 GGACAGACAGAGACATGGGGCTGATGAATGCCATTGGGCTTCAGCCCCGGAACCCTGCCACCTCAGTGACATCT 3033
|||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.|||||||||
Sbjct 2960 GGACAGACAGAGACATGGGTTTGATGAATGCAATTGGGCTGCAGCCTCGGAACCCAACCACCTCTGTGACATCT 3033
Query 3034 CAGGGCACCGAGACTCTGGCCCTTCAGCTGCAGAATGCCGAAACACAGACTGAGAGGGAGGTGCCGGAGCCAGG 3107
|||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||....|||.|||||
Sbjct 3034 CAGGGCACCCAGACTCTGGCCCTCCAGTTGCAGAACGCTGAAACACAGACTGAGAGGGAGGAAGAGGAACCAGG 3107
Query 3108 GACAGCCGCCTCAGGTCCTGGTGAAGGTGAGGGTTCAGAGTATGGTGCCAGTGGAGAAGATGCGCTCAGCAGGA 3181
|.||||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 3108 GGCAGCATCTTCAGGTCCTGGTGAAGGCGAGGGCTCAGAATATGGTGGCAGTGGGGAAGATGCCCTCAGCAGGA 3181
Query 3182 TCCAGAGGCTGATGGCGGAGGGCGGCATGACAGCCGTGGTGCAGCGGGAGCAGAGCACCACCATGGCCTCCATG 3255
||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3182 TCCAGAGGCTGATGGCCGAGGGTGGCATGACAGCTGTGGTACAACGGGAACAGAGCACCACCATGGCCTCCATG 3255
Query 3256 GGCGGCTTCGGCAACAACATCATCGTCAGCCACCGCATTCACCGCAGCTCTCAGACGGGCACTGAACCTGGTGC 3329
||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||..|.||.||
Sbjct 3256 GGTGGCTTTGGCAACAACATCATCGTTAGCCACCGCATTCACCGCAGCTCCCAGACAGGCACAGAGTCAGGGGC 3329
Query 3330 CGCCCACACCTCCTCACCCCAGCCCTCCACCTCTCGGGGACTGCTCCCAGAGGCCGGGCAACTGGCAGAGCGAG 3403
.||.|..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||...||||..|.|||||||||||||||||||
Sbjct 3330 TGCTCGTACCTCCTCACCCCAGCCCTCCACCTCTCGAGGACTGCCATCAGAACCTGGGCAACTGGCAGAGCGAG 3403
Query 3404 GCCTAAGCCCCCGGACAGCTTCCTGGGACCAGCCTGGTACCCCTGGGCGGGAGCCAACCCAGCCAACCCTGCCC 3477
..|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|||||.||||.|.|.||||||||.|||||.||
Sbjct 3404 CGCTAAGCCCCCGGACAGCCTCCTGGGACCAGCCTAGTACCTCTGGGAGGGAACTACCCCAGCCAGCCCTGTCC 3477
Query 3478 TCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCCTGTTTCCCTTCCCAGCGCTGAGGGACCAACCGTCCACTGCGAGTTGACCAA 3551
|||||||||||||||||||||||.||..|||||.|||||..|||||||||||||.|.||||||.|..|||||||
Sbjct 3478 TCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCCAGTCCCCCTTGCCAGCAATGAGGGACCAACCATGCACTGCAATGTGACCAA 3551
Query 3552 TAACAACCACCTTC---TGGATGGTGGCAGCAGCAGGGGGGACGCTGCAGGCCCTAGGGGAGAACCACGGAACA 3622
|||||..||||||| .||.||.|||.||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||.
Sbjct 3552 TAACAGTCACCTTCCTGAGGGTGATGGTAGCAACAGGGGGGAAGCTGCAGGCCCTAGTGGAGAGCCACAGAACC 3625
Query 3623 GG 3624
|.
Sbjct 3626 GA 3627