Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: NM_172669.3
• Aligned Length: 3901
• Identities: 3323
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  ATGAAGGTTGTCCCAGAAAAGAATGCTGTCCGGATACTCTGGGGGCGAGAACGGGGTGCTCGGGCCATGGGAGC  74
            |||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||..||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGAAAGTTGTCCCAGAGAAGAATGCTGTACGAATCCTCTGGGGCCGAGAACGGGGCACTCGTGCCATGGGTGC  74

Query   75  TCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTAGAGGATAAAACCCGGTGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC  148
            .|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTGGAGGATAAGACTCGATGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC  148

Query  149  CGGATAGTCCACGCTCTACCTTCTTATTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTAGCCTCCACCCATGTGAAC  222
            |.||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct  149  CTGATAGTCCACGCTCGACCTTCTTACTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTGGCATCCACACATGTGAAC  222

Query  223  CATAATATCTATATTACGGAGGTGAAGACTGGCAAGTGTGTTCATTCCCTGATTGGACACCGCCGTACTCCATG  296
            |||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATAACATCTATATTACAGAGGTTAAGACTGGCAAGTGTGTTCACTCTCTGATCGGACACCGCCGTACTCCATG  296

Query  297  GTGTGTCACTTTTCATCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGCTGCCTAGATGGGGAGGTTAGGATTTGGG  370
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  297  GTGTGTCACTTTTCACCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGTTGCCTAGATGGGGAAGTTAGGATTTGGG  370

Query  371  ATTTACACGGTGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGATAGCAACAATGCCATTGCCTCCCTGGCTTTCCACCCTACG  444
            |||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTACATGGGGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGACAGCAACAATGCCATAGCCTCCTTGGCTTTCCACCCTACG  444

Query  445  GCTCAGCTCCTGCTGATTGCCACTGCCAATGAGATCCACTTCTGGGACTGGAGTCGACGGGAACCCTTTGCTGT  518
            ||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  445  GCTCAGCTTCTACTAATTGCCACTGCAAATGAGATCCATTTCTGGGATTGGAGTCGTCGGGAGCCCTTTGCTGT  518

Query  519  GGTGAAGACAGCTAGTGAGATGGAACGGGTCCGTCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTCACAG  592
            ||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  GGTGAAAACAGCCAGTGAGATGGAGCGTGTCCGCCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTTACAG  592

Query  593  CAATTGTTAACCCCTCTAATCAACAGGGTGATGACGAACCAGAGATCCCCATAGATGGAACAGAATTATCCCAC  666
            |.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  593  CTATTGTTAACCCTTCTAATCAGCAGGGTGATGACGAACCAGAAATCCCTATAGATGGAACAGAGTTATCTCAT  666

Query  667  TACCGTCAGCGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACGCCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT  740
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCGTCAACGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACACCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT  740

Query  741  GTCCTCCCGCTCTTCTGGCATC----------------------------------------------------  762
            |||||||||.||.|||||||||                                                    
Sbjct  741  GTCCTCCCGTTCCTCTGGCATCCAGGTGGGAGAGCAAAGCACAGTACAAGATTCTGCTACCCCCTCACCCCCAC  814

Query  763  --------------------------------------------------------------------------  762
                                                                                      
Sbjct  815  CGCCTCCCCCTCAGCCCTCCACGGAGCGTCCCAGGACTTCCGCTTACATCAGACTCCGACAGCGGGTCAGTTAC  888

Query  763  --------------------------------------------------------------------------  762
                                                                                      
Sbjct  889  CCCACCACAGTTGAGTGCTGCCAGCACCCTGGGATCCTGTGCCTTTGCAGCCGCTGTGCTGGCACTCGAGTTCC  962

Query  763  -------------------------------------------------------------------------C  763
                                                                                     |
Sbjct  963  TTCCCTCTTGCCACACCAGGACAGTGTCCCCCCTGCTTCTGCCAGAGCTACTACCCCTTCCTTTTCTTTTGTAC  1036

Query  764  AGACCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCCTCGTCAACGCAGCAGGACCAGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCT  837
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGACCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCTTCATCAACGCAGCAGGACCAGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCT  1110

Query  838  GCCTTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCCGGCAACACGCTCCGCAACCTCAGTCTGGGTCCTACCCGCCGCTC  911
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  GCCTTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCGGGCAACACGCTCCGCAACCTCAGTCTGGGTCCTACCCGGCGCTC  1184

Query  912  TTTGGGAGGGCCTCTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACCGAGAAATAGCTCCTGGGTTGACAGGATCTGAGT  985
            ||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct 1185  TTTGGGGGGCCCTTTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACAGAGAACTAGCCCCTGGGCTGACAGGTTCTGAGT  1258

Query  986  GGACCCGGACAGTACTCAGTCTGAACTCCCGCTCTGAGGCGGAATCCATGCCCCCGCCCAGAACCAGTGCCTCT  1059
            ||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||..|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct 1259  GGACCCGGACAGTACTCACTCTGAACTCTCGTTCTGAGGTAGAATCTATGCCCCCACCGAGGACCAGTGCCTCC  1332

Query 1060  TCGGTGAGTTTGCTGTCTGTGCTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCATCTGTGTACACTTCAGCCACAGA  1133
            ||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  TCAGTGAGTTTGCTTTCTGTACTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCATCTGTGTATACTTCAGCCACAGA  1406

Query 1134  AGGGAGGGGTTTTCCGGCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAATGGCTCCAGCCAAAACAACTCGG  1207
            |||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1407  AGGGAGGGGTTTTCCATCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAATGGTTCCAGCCAAAACAACTCAG  1480

Query 1208  GCAGCATTCGCCATGAGCTTCAGTGTGACCTGAGACGCTTCTTTCTGGAGTATGACCGGCTTCAGGAGCTGGAT  1281
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GCAGCATTCGCCATGAGCTTCAATGTGACCTGAGACGCTTCTTTTTGGAGTATGACAGGCTGCAGGAGCTGGAT  1554

Query 1282  CAGAGCCTGAGTGGGGAAGCTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTCAACAATAACATTGAATCTGAGAG  1355
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAGCCTGAGTGGGGAAACTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTCAACAATAATATTGAATCTGAGAG  1628

Query 1356  GCCAGGCCCTTCCCACCAGCCCACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAACCTGTCCCGTGGCCACCTGAATC  1429
            .|||||.||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||
Sbjct 1629  ACCAGGTCCTTCCCACCTGCCTACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAACCTGTCTCGGGGCCACCTTAATC  1702

Query 1430  GCTGTCGTGCTTGCCACAATCTCCTGACCTTCAACAACGATACCCTGCGCTGGGAAAGAACCACACCTAACTAC  1503
            |.||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GATGCCGTGCTTGCCATAATCTTCTAACCTTCAACAATGATACCCTTCGTTGGGAAAGAACCACACCTAACTAC  1776

Query 1504  TCCTCTGGCGAGGCTAGTTCCTCTTGGCAGGTCCCCAGCT-CCTTTGAGAGTGTGCCATCAAGTGGCAGCCAGT  1576
            ||.|||||.||||||||.||.||.|||||.|||.||| || ||||||||.|..|||||.|||||||||.||||.
Sbjct 1777  TCATCTGGTGAGGCTAGCTCTTCCTGGCACGTCTCCA-CTACCTTTGAGGGCATGCCACCAAGTGGCAACCAGC  1849

Query 1577  TGCCACCTCTCGAGCGGACTGAGGGCCAAACGCCCAGCTCCAGCAGGCTGGAGTTGAGCAGCTCTGCTAGTCCG  1650
            |.||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.
Sbjct 1850  TACCACCTCTTGAGCGGACTGAGGGCCAAATGCCTAGCTCCAGCAGGCTGGAGTTGAGCAGCTCTGCTAGTTCA  1923

Query 1651  CAGGAGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGGGAAAGAATTTACACCCAGTCCAG  1724
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||
Sbjct 1924  CAAGAGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGGGAACGCATTTATACCCAGTCCAG  1997

Query 1725  CAGATCTGGAACTGTGTCACAGGAGGCCTTACATCAGGATATGCCTGAGGAGAGCTCTGAGGAGGATTCACTCA  1798
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1998  CAGATCTGGAACTGTATCACAGGAGGCCTTACATCAAGATATGCCTGAAGAAAGCTCTGAGGAAGACTCCCTCA  2071

Query 1799  GGAGGAGGCTGCTGGAATCTTCCCTCATTTCATTATCCCGTTATGATGGAGCAGGATCCAGAGAGCACCCAATT  1872
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  GGAGGAGGCTGCTGGAGTCTTCCCTCATTTCATTATCCCGTTATGATGGAGCAGGATCCAGAGAGCACCCAATT  2145

Query 1873  TACCCAGACCCAGCGAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATGATCCAGTATCTCTCACGGAGAGA  1946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2146  TACCCAGACCCAGCGAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATGATCCAGTATCTCTCAAGGAGAGA  2219

Query 1947  CAGTATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAACCGTCTCCGTTCTTCCACCTCCTCCTCTTCCTCAGACA  2020
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2220  CAGTATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAATCGGCTTCGTTCTTCCACCTCCTCTTCTTCCTCAGACA  2293

Query 2021  ACCAGGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGGACAATGGTGACAGATCCAGGCAC  2094
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 2294  ACCAGGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGGACAATGGTGACAGATCTAGGCAC  2367

Query 2095  CGAGCTCCACGCAATGCCCGGATGTCTGCACCTTCGCTTGGACGCTTTGTCCCAAGGCGTTTCTTGCTGCCTGA  2168
            ||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 2368  CGAGCTCCCCGAAATGCCCGAATGTCTGCACCTTCACTTGGACGATTTGTTCCAAGGCGTTTTTTGCTGCCTGA  2441

Query 2169  GTACTTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGCTACTCACTCTTCTGTTAACAGGG  2242
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2442  GTACTTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGCTACTCATTCTTCTGTTAACAGGG  2515

Query 2243  TCCTGGCAGGGGCAGTGATCGGTGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACATTGCCAATACTACCTACCGGCTC  2316
            ||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2516  TCCTGGCAGGGGCAGTAATTGGAGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACATTGCCAATACTACCTACAGGCTC  2589

Query 2317  CAGTGGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTCCCTGAAATCAGTAATGCTTCCGTGAATGTGCTGGTGCAGAACTG  2390
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2590  CAGTGGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTTCCAGAAATCAGTAATGCCTCTGTGAATGTCCTGGTACAGAATTG  2663

Query 2391  CAAGATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGCCAGCTCCTGGCAGCTTTCATCCCCAGCAGCC  2464
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2664  CAAGATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGTCAGCTCCTGGCAGCCTTCATCCCGAGCAGCC  2737

Query 2465  AGAGGGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTACTCCCTGGCCCCCCATAACCTGGGCGAAATGCTCTAC  2538
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||.||||||||||||
Sbjct 2738  AGAGGGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTATTCCCTGGCCCCCCATAACTTGGGGGAAATGCTCTAC  2811

Query 2539  ACCAAGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCGGTGAGCCTGTCCCCAATGGGCAGATATGTAATGGTGGGCTTGGC  2612
            |||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2812  ACCAAGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCTGTAAGCCTGTCCCCGATGGGCCGATACGTTATGGTGGGCTTGGC  2885

Query 2613  CTCACGAAGGATCCTGCTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTGGCCCAGGTCTTCAGGCTGCAACAGGCCCATG  2686
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2886  CTCACGAAGGATCCTACTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTAGCCCAGGTCTTCAGGCTGCAACAGGCCCATG  2959

Query 2687  GTGGAGAGACCTCCATGAGGAGAGTTTTCAACGTCCTTTATCCCATGCCTGCCGACCAGCGGAGACATGTCAGT  2760
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct 2960  GTGGTGAGACTTCCATGAGGAGAGTTTTCAATGTCCTTTACCCCATGCCTGCAGACCAACGGAGACACGTCAGC  3033

Query 2761  ATCAACTCTGCCCGTTGGCTGCCTGAGCCAGGGCTTGGCTTGGCCTATGGTACTAACAAAGGAGACCTGGTGAT  2834
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|||||||
Sbjct 3034  ATCAACTCTGCCCGTTGGCTACCCGAGCCAGGGCTTGGTTTGGCCTATGGCACCAACAAAGGAGACTTGGTGAT  3107

Query 2835  CTGCCGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGTGTTGAGTACTACTGGGACCAGCTGAACGAGACGGTCTTCACTGTCC  2908
            |||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||.|..||.||.|||||||||||||
Sbjct 3108  CTGCCGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGCATCGAGTACTACTGGGACCAGCTAAGTGAAACAGTCTTCACTGTCC  3181

Query 2909  ATTCCAACAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACATGGAGGACAGACAGAGACATGGGGCTG  2982
            |.||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..||
Sbjct 3182  ACTCAAGTAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACGTGGCGGACAGACAGAGACATGGGTTTG  3255

Query 2983  ATGAATGCCATTGGGCTTCAGCCCCGGAACCCTGCCACCTCAGTGACATCTCAGGGCACCGAGACTCTGGCCCT  3056
            ||||||||.||||||||.|||||.||||||||..|||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 3256  ATGAATGCAATTGGGCTGCAGCCTCGGAACCCAACCACCTCTGTGACATCTCAGGGCACCCAGACTCTGGCCCT  3329

Query 3057  TCAGCTGCAGAATGCCGAAACACAGACTGAGAGGGAGGTGCCGGAGCCAGGGACAGCCGCCTCAGGTCCTGGTG  3130
            .|||.|||||||.||.||||||||||||||||||||||....|||.||||||.||||..|.|||||||||||||
Sbjct 3330  CCAGTTGCAGAACGCTGAAACACAGACTGAGAGGGAGGAAGAGGAACCAGGGGCAGCATCTTCAGGTCCTGGTG  3403

Query 3131  AAGGTGAGGGTTCAGAGTATGGTGCCAGTGGAGAAGATGCGCTCAGCAGGATCCAGAGGCTGATGGCGGAGGGC  3204
            ||||.|||||.|||||.|||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 3404  AAGGCGAGGGCTCAGAATATGGTGGCAGTGGGGAAGATGCCCTCAGCAGGATCCAGAGGCTGATGGCCGAGGGT  3477

Query 3205  GGCATGACAGCCGTGGTGCAGCGGGAGCAGAGCACCACCATGGCCTCCATGGGCGGCTTCGGCAACAACATCAT  3278
            |||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 3478  GGCATGACAGCTGTGGTACAACGGGAACAGAGCACCACCATGGCCTCCATGGGTGGCTTTGGCAACAACATCAT  3551

Query 3279  CGTCAGCCACCGCATTCACCGCAGCTCTCAGACGGGCACTGAACCTGGTGCCGCCCACACCTCCTCACCCCAGC  3352
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||..|.||.||.||.|..||||||||||||||||
Sbjct 3552  CGTTAGCCACCGCATTCACCGCAGCTCCCAGACAGGCACAGAGTCAGGGGCTGCTCGTACCTCCTCACCCCAGC  3625

Query 3353  CCTCCACCTCTCGGGGACTGCTCCCAGAGGCCGGGCAACTGGCAGAGCGAGGCCTAAGCCCCCGGACAGCTTCC  3426
            |||||||||||||.|||||||...||||..|.|||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||
Sbjct 3626  CCTCCACCTCTCGAGGACTGCCATCAGAACCTGGGCAACTGGCAGAGCGAGCGCTAAGCCCCCGGACAGCCTCC  3699

Query 3427  TGGGACCAGCCTGGTACCCCTGGGCGGGAGCCAACCCAGCCAACCCTGCCCTCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCC  3500
            ||||||||||||.|||||.|||||.||||.|.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3700  TGGGACCAGCCTAGTACCTCTGGGAGGGAACTACCCCAGCCAGCCCTGTCCTCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCC  3773

Query 3501  TGTTTCCCTTCCCAGCGCTGAGGGACCAACCGTCCACTGCGAGTTGACCAATAACAACCACCTTC---TGGATG  3571
            .||..|||||.|||||..|||||||||||||.|.||||||.|..||||||||||||..|||||||   .||.||
Sbjct 3774  AGTCCCCCTTGCCAGCAATGAGGGACCAACCATGCACTGCAATGTGACCAATAACAGTCACCTTCCTGAGGGTG  3847

Query 3572  GTGGCAGCAGCAGGGGGGACGCTGCAGGCCCTAGGGGAGAACCACGGAACAGG  3624
            .|||.||||.|||||||||.||||||||||||||.|||||.||||.||||.|.
Sbjct 3848  ATGGTAGCAACAGGGGGGAAGCTGCAGGCCCTAGTGGAGAGCCACAGAACCGA  3900