Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08557
• Subject: XM_005253011.4
• Aligned Length: 3894
• Identities: 3534
• Gaps: 357

Alignment

Query    1  ATGAAGGTTGTCCCAGAAAAGAATGCTGTCCGGATACTCTGGGGGCGAGAACGGGGTGCTCGGGCCATGGGAGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGTTGTCCCAGAAAAGAATGCTGTCCGGATACTCTGGGGGCGAGAACGGGGTGCTCGGGCCATGGGAGC  74

Query   75  TCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTAGAGGATAAAACCCGGTGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCAGCGGCTTCTGCAGGAGCTGGTAGAAGATAAAACCCGGTGGATGAAATGGGAGGGCAAGAGAGTAGAACTGC  148

Query  149  CGGATAGTCCACGCTCTACCTTCTTATTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTAGCCTCCACCCATGTGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGGATAGTCCACGCTCTACCTTCTTATTGGCCTTCAGCCCAGACAGGACTCTCTTAGCCTCCACCCATGTGAAC  222

Query  223  CATAATATCTATATTACGGAGGTGAAGACTGGCAAGTGTGTTCATTCCCTGATTGGACACCGCCGTACTCCATG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATAATATCTATATTACGGAGGTGAAGACTGGCAAGTGTGTTCATTCCCTGATTGGACACCGCCGTACTCCATG  296

Query  297  GTGTGTCACTTTTCATCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGCTGCCTAGATGGGGAGGTTAGGATTTGGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTGTCACTTTTCATCCCACCATCTCAGGCCTTATTGCTTCTGGCTGCCTAGATGGGGAGGTTAGGATTTGGG  370

Query  371  ATTTACACGGTGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGATAGCAACAATGCCATTGCCTCCCTGGCTTTCCACCCTACG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATTTACACGGTGGCAGTGAAAGCTGGTTCACAGATAGCAACAATGCCATTGCCTCCCTGGCTTTCCACCCTACG  444

Query  445  GCTCAGCTCCTGCTGATTGCCACTGCCAATGAGATCCACTTCTGGGACTGGAGTCGACGGGAACCCTTTGCTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTCAGCTCCTGCTGATTGCCACTGCCAATGAGATCCACTTCTGGGACTGGAGTCGACGGGAACCCTTTGCTGT  518

Query  519  GGTGAAGACAGCTAGTGAGATGGAACGGGTCCGTCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTCACAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGAAGACAGCTAGTGAGATGGAACGGGTCCGTCTGGTGAGATTTGATCCACTTGGACACTACTTACTCACAG  592

Query  593  CAATTGTTAACCCCTCTAATCAACAGGGTGATGACGAACCAGAGATCCCCATAGATGGAACAGAATTATCCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAATTGTTAACCCCTCTAATCAACAGGGTGATGACGAACCAGAGATCCCCATAGATGGAACAGAATTATCCCAC  666

Query  667  TACCGTCAGCGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACGCCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TACCGTCAGCGTGCCCTCCTGCAATCACAGCCAGTTCGCCGGACGCCTCTCCTCCACAATTTCCTGCACATGCT  740

Query  741  GTCCTCCCGCTCTTCTGGCATC----------------------------------------------------  762
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct  741  GTCCTCCCGCTCTTCTGGCATCCAGGTGGGAGAGCAAAGCACAGTGCAAGATTCTGCTACCCCCTCACCCCCAC  814

Query  763  --------------------------------------------------------------------------  762
                                                                                      
Sbjct  815  CGCCTCCCCCTCAGCCCTCCACGGAGCGCCCCAGGACTTCCGCTTACATCAGGCTCCGACAGCGGGTCAGTTAC  888

Query  763  --------------------------------------------------------------------------  762
                                                                                      
Sbjct  889  CCCACAGCTGAGTGCTGCCAGCACCTTGGGATCCTGTGCCTTTGCAGCCGCTGCTCTGGCACTCGAGTTCCTTC  962

Query  763  ----------------------------------------------------------------------CAGA  766
                                                                                  ||||
Sbjct  963  CCTCTTGCCACACCAGGACAGTGTCCCCCCTGCTTCTGCCAGAGCTACTACCCCTTCCTTTTCTTTTGTACAGA  1036

Query  767  CCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCCTCGTCAACGCAGCAGGACCAGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCTGCC  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCGAGCCCTTCCATCCCCCGGAGCAGGCCTCGTCAACGCAGCAGGACCAGGGCCTCCTGAACCGGCCGTCTGCC  1110

Query  841  TTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCCGGCAACACGCTCCGCAACCTCAGTCTGGGTCCTACCCGCCGCTCTTT  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TTCAGTACAGTCCAGAGCAGCACTGCCGGCAACACGCTCCGCAACCTCAGTCTGGGTCCTACCCGCCGCTCTTT  1184

Query  915  GGGAGGGCCTCTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACCGAGAAATAGCTCCTGGGTTGACAGGATCTGAGTGGA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGGAGGGCCTCTGTCTAGCCACCCTTCTAGGTATCACCGAGAAATAGCTCCTGGGTTGACAGGATCTGAGTGGA  1258

Query  989  CCCGGACAGTACTCAGTCTGAACTCCCGCTCTGAGGCGGAATCCATGCCCCCGCCCAGAACCAGTGCCTCTTCG  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCCGGACAGTACTCAGTCTGAACTCCCGCTCTGAGGCGGAATCCATGCCCCCGCCCAGAACCAGTGCCTCTTCG  1332

Query 1063  GTGAGTTTGCTGTCTGTGCTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCATCTGTGTACACTTCAGCCACAGAAGG  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GTGAGTTTGCTGTCTGTGCTGAGACAGCAGGAAGGTGGCTCTCAGGCATCTGTGTACACTTCAGCCACAGAAGG  1406

Query 1137  GAGGGGTTTTCCGGCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAATGGCTCCAGCCAAAACAACTCGGGCA  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GAGGGGTTTTCCGGCATCAGGGTTGGCAACTGAGTCAGATGGAGGGAATGGCTCCAGCCAAAACAACTCGGGCA  1480

Query 1211  GCATTCGCCATGAGCTTCAGTGTGACCTGAGACGCTTCTTTCTGGAGTATGACCGGCTTCAGGAGCTGGATCAG  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GCATTCGCCATGAGCTTCAGTGTGACCTGAGACGCTTCTTTCTGGAGTATGACCGGCTTCAGGAGCTGGATCAG  1554

Query 1285  AGCCTGAGTGGGGAAGCTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTCAACAATAACATTGAATCTGAGAGGCC  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCTGAGTGGGGAAGCTCCCCAGACCCAACAGGCCCAGGAAATGCTCAACAATAACATTGAATCTGAGAGGCC  1628

Query 1359  AGGCCCTTCCCACCAGCCCACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAACCTGTCCCGTGGCCACCTGAATCGCT  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGGCCCTTCCCACCAGCCCACCCCACACAGCAGTGAGAACAACTCCAACCTGTCCCGTGGCCACCTGAATCGCT  1702

Query 1433  GTCGTGCTTGCCACAATCTCCTGACCTTCAACAACGATACCCTGCGCTGGGAAAGAACCACACCTAACTACTCC  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTCGTGCTTGCCACAATCTCCTGACCTTCAACAACGATACCCTGCGCTGGGAAAGAACCACACCTAACTACTCC  1776

Query 1507  TCTGGCGAGGCTAGTTCCTCTTGGCAGGTCCCCAGCTCCTTTGAGAGTGTGCCATCAAGTGGCAGCCAGTTGCC  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTGGCGAGGCTAGTTCCTCTTGGCAGGTCCCCAGCTCCTTTGAGAGTGTGCCATCAAGTGGCAGCCAGTTGCC  1850

Query 1581  ACCTCTCGAGCGGACTGAGGGCCAAACGCCCAGCTCCAGCAGGCTGGAGTTGAGCAGCTCTGCTAGTCCGCAGG  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCTCTCGAGCGGACTGAGGGCCAAACGCCCAGCTCCAGCAGGCTGGAGTTGAGCAGCTCTGCTAGTCCGCAGG  1924

Query 1655  AGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGGGAAAGAATTTACACCCAGTCCAGCAGA  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  AGGAGAGGACTGTGGGGGTGGCCTTTAACCAGGAGACAGGCCACTGGGAAAGAATTTACACCCAGTCCAGCAGA  1998

Query 1729  TCTGGAACTGTGTCACAGGAGGCCTTACATCAGGATATGCCTGAGGAGAGCTCTGAGGAGGATTCACTCAGGAG  1802
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1999  TCTGGAACTGTGTCACAGGAGGCCTTACATCAGGATATGCCTGAGGAGAGCTCTGAGGAGGATTCACTCAG---  2069

Query 1803  GAGGCTGCTGGAATCTTCCCTCATTTCATTATCCCGTTATGATGGAGCAGGATCCAGAGAGCACCCAATTTACC  1876
                                                                                      
Sbjct 2070  --------------------------------------------------------------------------  2069

Query 1877  CAGACCCAGCGAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATGATCCAGTATCTCTCACGGAGAGACAGT  1950
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  ----------GAGATTATCTCCTGCTGCATACTACGCCCAGAGGATGATCCAGTATCTCTCACGGAGAGACAGT  2133

Query 1951  ATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAACCGTCTCCGTTCTTCCACCTCCTCCTCTTCCTCAGACAACCA  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2134  ATTCGCCAGCGCTCCATGCGCTACCAACAGAACCGTCTCCGTTCTTCCACCTCCTCCTCTTCCTCAGACAACCA  2207

Query 2025  GGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGGACAATGGTGACAGATCCAGGCACCGAG  2098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2208  GGGTCCATCAGTAGAGGGAACCGACTTGGAATTTGAGGACTTTGAGGACAATGGTGACAGATCCAGGCACCGAG  2281

Query 2099  CTCCACGCAATGCCCGGATGTCTGCACCTTCGCTTGGACGCTTTGTCCCAAGGCGTTTCTTGCTGCCTGAGTAC  2172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2282  CTCCACGCAATGCCCGGATGTCTGCACCTTCGCTTGGACGCTTTGTCCCAAGGCGTTTCTTGCTGCCTGAGTAC  2355

Query 2173  TTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGCTACTCACTCTTCTGTTAACAGGGTCCT  2246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2356  TTGCCTTATGCTGGGATTTTTCATGAACGTGGACAGCCTGGCTTGGCTACTCACTCTTCTGTTAACAGGGTCCT  2429

Query 2247  GGCAGGGGCAGTGATCGGTGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACATTGCCAATACTACCTACCGGCTCCAGT  2320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2430  GGCAGGGGCAGTGATCGGTGATGGACAGTCTGCTGTGGCCAGTAACATTGCCAATACTACCTACCGGCTCCAGT  2503

Query 2321  GGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTCCCTGAAATCAGTAATGCTTCCGTGAATGTGCTGGTGCAGAACTGCAAG  2394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2504  GGTGGGACTTCACTAAGTTTGACCTCCCTGAAATCAGTAATGCTTCCGTGAATGTGCTGGTGCAGAACTGCAAG  2577

Query 2395  ATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGCCAGCTCCTGGCAGCTTTCATCCCCAGCAGCCAGAG  2468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2578  ATCTACAATGATGCCAGCTGTGACATTTCTGCAGATGGCCAGCTCCTGGCAGCTTTCATCCCCAGCAGCCAGAG  2651

Query 2469  GGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTACTCCCTGGCCCCCCATAACCTGGGCGAAATGCTCTACACCA  2542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2652  GGGCTTTCCTGATGAAGGCATCCTGGCAGTGTACTCCCTGGCCCCCCATAACCTGGGCGAAATGCTCTACACCA  2725

Query 2543  AGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCGGTGAGCCTGTCCCCAATGGGCAGATATGTAATGGTGGGCTTGGCCTCA  2616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2726  AGCGATTTGGTCCCAATGCCATTTCGGTGAGCCTGTCCCCAATGGGCAGATATGTAATGGTGGGCTTGGCCTCA  2799

Query 2617  CGAAGGATCCTGCTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTGGCCCAGGTCTTCAGGCTGCAACAGGCCCATGGTGG  2690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2800  CGAAGGATCCTGCTGCACCCCTCCACAGAGCACATGGTGGCCCAGGTCTTCAGGCTGCAACAGGCCCATGGTGG  2873

Query 2691  AGAGACCTCCATGAGGAGAGTTTTCAACGTCCTTTATCCCATGCCTGCCGACCAGCGGAGACATGTCAGTATCA  2764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2874  AGAGACCTCCATGAGGAGAGTTTTCAACGTCCTTTATCCCATGCCTGCCGACCAGCGGAGACATGTCAGTATCA  2947

Query 2765  ACTCTGCCCGTTGGCTGCCTGAGCCAGGGCTTGGCTTGGCCTATGGTACTAACAAAGGAGACCTGGTGATCTGC  2838
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2948  ACTCTGCCCGTTGGCTGCCTGAGCCAGGGCTTGGCTTGGCCTATGGTACTAACAAAGGAGACCTGGTGATCTGC  3021

Query 2839  CGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGTGTTGAGTACTACTGGGACCAGCTGAACGAGACGGTCTTCACTGTCCATTC  2912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3022  CGACCAGAGGCCTTAAACTCTGGTGTTGAGTACTACTGGGACCAGCTGAACGAGACGGTCTTCACTGTCCATTC  3095

Query 2913  CAACAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACATGGAGGACAGACAGAGACATGGGGCTGATGA  2986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3096  CAACAGCAGGAGCAGCGAGCGGCCTGGAACCAGCAGAGCCACATGGAGGACAGACAGAGACATGGGGCTGATGA  3169

Query 2987  ATGCCATTGGGCTTCAGCCCCGGAACCCTGCCACCTCAGTGACATCTCAGGGCACCGAGACTCTGGCCCTTCAG  3060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 3170  ATGCCATTGGGCTTCAGCCCCGGAACCCTGCCACCTCAGTGACATCTCAGGGCACCCAGACTCTGGCCCTTCAG  3243

Query 3061  CTGCAGAATGCCGAAACACAGACTGAGAGGGAGGTGCCGGAGCCAGGGACAGCCGCCTCAGGTCCTGGTGAAGG  3134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3244  CTGCAGAATGCCGAAACACAGACTGAGAGGGAGGTGCCGGAGCCAGGGACAGCCGCCTCAGGTCCTGGTGAAGG  3317

Query 3135  TGAGGGTTCAGAGTATGGTGCCAGTGGAGAAGATGCGCTCAGCAGGATCCAGAGGCTGATGGCGGAGGGCGGCA  3208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3318  TGAGGGTTCAGAGTATGGTGCCAGTGGAGAAGATGCGCTCAGCAGGATCCAGAGGCTGATGGCGGAGGGCGGCA  3391

Query 3209  TGACAGCCGTGGTGCAGCGGGAGCAGAGCACCACCATGGCCTCCATGGGCGGCTTCGGCAACAACATCATCGTC  3282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3392  TGACAGCCGTGGTGCAGCGGGAGCAGAGCACCACCATGGCCTCCATGGGCGGCTTCGGCAACAACATCATCGTC  3465

Query 3283  AGCCACCGCATTCACCGCAGCTCTCAGACGGGCACTGAACCTGGTGCCGCCCACACCTCCTCACCCCAGCCCTC  3356
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3466  AGCCACCGCATTCACCGCAGCTCTCAGACGGGCACTGAACCTGGTGCCGCCCACACCTCCTCACCCCAGCCCTC  3539

Query 3357  CACCTCTCGGGGACTGCTCCCAGAGGCCGGGCAACTGGCAGAGCGAGGCCTAAGCCCCCGGACAGCTTCCTGGG  3430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3540  CACCTCTCGGGGACTGCTCCCAGAGGCCGGGCAACTGGCAGAGCGAGGCCTAAGCCCCCGGACAGCTTCCTGGG  3613

Query 3431  ACCAGCCTGGTACCCCTGGGCGGGAGCCAACCCAGCCAACCCTGCCCTCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCCTGTT  3504
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3614  ACCAGCCTGGTACCCCTGGGCGGGAGCCAACCCAGCCAACCCTGCCCTCTTCCTCCCCTGTCCCCATTCCTGTT  3687

Query 3505  TCCCTTCCCAGCGCTGAGGGACCAACCGTCCACTGCGAGTTGACCAATAACAACCACCTTCTGGATGGTGGCAG  3578
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3688  TCCCTTCCCAGCGCTGAGGGACCAACCCTCCACTGCGAGTTGACCAATAACAACCACCTTCTGGATGGTGGCAG  3761

Query 3579  CAGCAGGGGGGACGCTGCAGGCCCTAGGGGAGAACCACGGAACAGG  3624
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3762  CAGCAGGGGGGACGCTGCAGGCCCTAGGGGAGAACCACGGAACAGG  3807