Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08580
• Subject: XM_017321903.1
• Aligned Length: 2258
• Identities: 1821
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGAAGAAGAAGGGCTGGAGTGTCCAAACTCTTCCTCTGAAAAACGCTATTT  53
                                 |||||.|||||.|..|||||...|||.|||.|.||..|.||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCTCCCTGCGGGAAGAAATGGATGAAGAGGAACTGGACCATCCGAACGCCTCTCCAGAGAAACGCTATTT  74

Query   54  TCCTGAATCCCTGGATTCCAGCGATGGGGATGAGGAAGAGGTTTTGGCCTGTGAGGATTTGGAACTTAACCCCT  127
            .||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||||.|||..|||||||.||||||.||||.||.|||||||
Sbjct   75  CCCCGAGTCCCTAGATTCCAGTGACGGGGACGAGGAAGGGGTCCTGGCCTGCGAGGATCTGGAGCTGAACCCCT  148

Query  128  TTGATGGATTGCCATATTCATCACGTTATTATAAACTTCTGAAAGAAAGAGAAGATCTTCCTATATGGAAAGAA  201
            ||||.||.||.||.||||||||.||.|||||.||||||.|||||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  TTGACGGCTTACCGTATTCATCGCGATATTACAAACTTTTGAAAGAGAGAGAAGAGCTTCCGATATGGAAAGAA  222

Query  202  AAATACTCCTTTATGGAGAACCTGCTTCAAAATCAAATCGTGATTGTTTCAGGAGATGCTAAATGTGGTAAGAG  275
            ||.||||||||.|||||||..|||||.|||||.||..|.|||.|.||.|||||.||..|.||.|||||.|||||
Sbjct  223  AAGTACTCCTTCATGGAGAGTCTGCTGCAAAACCAGGTTGTGGTGGTGTCAGGGGACTCCAAGTGTGGCAAGAG  296

Query  276  CGCTCAGGTTCCTCAGTGGTGTGCTGAATATTGTCTTTCCATCCACTACCAGCACGGGGGCGTGATATGCACAC  349
            |.||                                             |||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  CTCT---------------------------------------------CAGCACGGGGGCGTGATATGCACCC  325

Query  350  AGGTCCACAAGCAGACTGTGGTCCAGCTCGCCCTGCGGGTGGCGGATGAAATGGATGTTAACATTGGTCATGAG  423
            |||.||||||.|||||.|..||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.||.||.||.
Sbjct  326  AGGCCCACAAACAGACGGCAGTCCAGCTGGCCCTGCGGGTGGCCGACGAGATGGATGTGAATATCGGGCACGAA  399

Query  424  GTTGGCTACGTGATCCCTTTCGAGAACTGCTGTACCAACGAAACAATCCTGAGGTATTGTACTGATGATATGCT  497
            ||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  400  GTCGGCTATGTGATTCCTTTTGAGAACTGCTGCACCACTGAAACAATCCTGAGGTACTGTACTGATGACATGCT  473

Query  498  GCAAAGAGAAATGATGTCCAATCCTTTTTTGGGTAGCTATGGGGTCATCATCTTAGATGATATTCATGAAAGAA  571
            |||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||.||.||||
Sbjct  474  GCAGAGAGAGATGATGTCCAACCCTTTCCTGGGTAGCTATGGCGTCATCATCTTGGACGATGTCCACGAGAGAA  547

Query  572  GCATTGCAACTGATGTGTTACTTGGACTTCTTAAAGATGTTTTACTAGCAAGACCAGAACTGAAGCTCATAATT  645
            ||.|.||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct  548  GCCTGGCGACTGACGTGCTGCTCGGACTCCTTAAAGATGTGCTGCTGGCAAGACCAGAGCTGAAGCTCATAGTT  621

Query  646  AACTCCTCACCTCACCTGATCAGCAAACTCAATTCTTATTATGGAAACGTGCCTGTCATAGAAGTGAAAAATAA  719
            ||||.|||.||||.|||.|.|||.|||||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  622  AACTGCTCGCCTCTCCTCACCAGTAAACTCAGTTCCTACTATGGAGACGTGCCTGTCATAGAAGTGAGAAATAA  695

Query  720  ACACCCTGTGGAGGTTGTGTACCTTAGTGAGGCTCAAAAGGATTCTTTTGAGTCTATTTTACGCCTTATCTTTG  793
            .|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||.||.||||||.|..|||||||||||||||
Sbjct  696  GCACCCGGTGGAGGTGGTGTACCTTAGTGGGGCTCAGAAGGATTCCTTCGAGTCTGTCATACGCCTTATCTTTG  769

Query  794  AAATTCACCACTCGGGTGAGAAAGGTGACATTGTAGTCTTTCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAGAAAGTCTGT  867
            ||||.||||.||||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||.|
Sbjct  770  AAATCCACCGCTCGGGTGAGAAGGGTGACGTTGTGGTCTTCCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAAAAAACCTAT  843

Query  868  GAAACTGTCTATC---AAGGATCTAACCTAAACCCAGATCTTGGAGAACTGGTGGTTGTTCCTTTGTATCCAAA  938
            |||..|||.|.||   |||||||.|||.|||||||||||.|.||.||.||||||||..|.|||||||||||.||
Sbjct  844  GAACTTGTGTGTCAGGAAGGATCCAACTTAAACCCAGATGTGGGCGACCTGGTGGTCATCCCTTTGTATCCCAA  917

Query  939  AGAGAAATGTTCA--TTGTTCAAGCCACTCGATGAAACAGAAAAAAGATGCCAAGTTTATCAAAGAAGAGTGGT  1010
            ||||||  ||.||  .||||||.||||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||
Sbjct  918  AGAGAA--GTGCAGCCTGTTCAGGCCAGTGGACGAAACCGAGAAAAGATGCCAAGTGTATCAGAGACGGGTGGT  989

Query 1011  GTTAACTACTAGCTCTGGAGAGTTTTTGATCTGGAGCAACTCAGTCAGATTTGTTATCGATGTGGGTGTGGAAA  1084
            |.|.||.||.||||..||.||||.|.|||||||||||.||.|.||||.||||||.||.|||||.|||.||||||
Sbjct  990  GCTGACCACCAGCTGCGGGGAGTCTCTGATCTGGAGCCACACGGTCAAATTTGTCATTGATGTTGGTCTGGAAA  1063

Query 1085  GAAGAAAGGTGTACAACCCGAGAATAAGAGCAAACTCGCTCGTCATGCAGCCCATCAGCCAGAGCCAGGCAGAG  1158
            |||||.||||.||.|||||..|.||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1064  GAAGACAGGTATATAACCCCCGGATCAGAGCCAACTCCCTCGTCCTGCAGCCCATCAGCCAAAGCCAAGCAGAG  1137

Query 1159  ATACGCAAGCAGATTCTTGGCTCATCTTCTTCAGGAAAATTTTTCTGCCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA  1232
            ||.||.||||||.|.||.||.||.|||.|.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  ATCCGGAAGCAGCTCCTCGGGTCTTCTCCCTCAGGAAAACTTTTCTGTCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAA  1211

Query 1233  AGACATGACGCCACTGAAGCCAGCAGAAATGCAGGAAGCCAACCTAACAAGCATGGTGCTTTTTATGAAGAGGA  1306
            ||||||||.|||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.
Sbjct 1212  AGACATGAGGCCCCTTAAGCCAGCGGAAATGCAGGAAGCCAACCTGACTAGCATGGTGCTCTTCATGAAGAGGG  1285

Query 1307  TAGACATTGCGGGCCTAGGCCACTGTGACTTCATGAACAGACCAGCACCAGAAAGTTTGATGCAGGCATTGGAA  1380
            |.||||||||.|||||.||||.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||
Sbjct 1286  TGGACATTGCAGGCCTGGGCCGCTGCGACTTCATGAACAGGCCAGCTCCAGAAAGCCTGATGCAGGCACTGGAA  1359

Query 1381  GACTTAGATTATCTGGCAGCACTGGATAATGATGGAAATCTTTCTGAATTTGGAATCATCATGTCAGAGTTTCC  1454
            ||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1360  GATTTAGATTACCTGGCAGCCCTGGACAACGATGGGAATCTCTCTGAGTTTGGAATCATCATGTCTGAGTTTCC  1433

Query 1455  TCTTGATCCACAACTCTCGAAGTCTATCTTAGCGTCCTGTGAATTTGACTGTGTAGATGAAGTGCTAACAATCG  1528
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||||
Sbjct 1434  TCTGGATCCACAGCTCTCAAAGTCTATCTTAGCATCCTGTGAATTTGACTGTGTAGACGAAATGCTAACCATCG  1507

Query 1529  CGGCCATGGTAACAGCTCCAAATTGCTTTTCACATGTGCCACATGGAGCTGAAGAGGCTGCCTTGACTTGTTGG  1602
            |.|||||||||||||||||.|.||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||..|||||||.|||
Sbjct 1508  CTGCCATGGTAACAGCTCCCAGTTGCTTTTTGCACGTGCCTCATGGTGCTGAGGAGGCTGCAGTGACTTGCTGG  1581

Query 1603  AAGACATTTTTACATCCCGAAGGAGATCACTTTACCCTCATCAGCATTTACAAGGCTTACCAAGACACAACTCT  1676
            ||.||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||...|.|||||.||.||||||||.|||..|||
Sbjct 1582  AAAACGTTCTTGCACCCTGAAGGTGATCACTTTACGCTCATCAATGTCTACAATGCCTACCAAGATACAGTTCT  1655

Query 1677  GAATTCTAGCAGTGAGTACTGTGTGGAAAAGTGGTGTCGTGATTACTTCCTCAACTGTTCAGCACTCAGAATGG  1750
            |||.|||..||.|||..||||||||||.|.||||||||..||||.||||||||.|||.||.||.|||||.||||
Sbjct 1656  GAACTCTGCCAATGAACACTGTGTGGAGATGTGGTGTCACGATTGCTTCCTCAGCTGCTCTGCTCTCAGGATGG  1729

Query 1751  CAGATGTTATTCGAGCTGAACTCTTAGAAATTATCAAGCGAATCGAGCTTCCCTATGCAGAACCTGCTTTTGGC  1824
            ||||.|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1730  CAGACGTTATCCGAGCAGAACTCTTAGAGATCATCAAGCGGATCGAGCTTCCCTATGCAGAGCCTGCCTTTGGC  1803

Query 1825  TCCAAGGAAAACACTCTAAACATAAAGAAAGCTCTTCTGTCCGGTTACTTTATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA  1898
            ||||||||||||....|.|||||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804  TCCAAGGAAAACGGGTTGAACATCAAGAAAGCGCTGCTCTCTGGGTACTTCATGCAGATTGCTCGGGATGTTGA  1877

Query 1899  TGGATCAGGTAACTACTTAATGCTGACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCCTGTCTGGTTACTCAATCA  1972
            .||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.||||
Sbjct 1878  CGGGTCAGGTAACTACTTGATGCTTACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCTTATCAAGCTATTCCATCA  1951

Query 1973  CCAAGAAGATGCCAGAGTGGGTCCTCTTCCATAAATTCAGCATTTCTGAGAACAACTACATCAGGATTACCTCA  2046
            |||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||.|..||||.
Sbjct 1952  CCAAGAAGATGCCCGAGTGGGTCCTCTTCCACCAGTTCAGCATATCTGAGAACAACTACATCAGGGTCGCCTCC  2025

Query 2047  GAAATCTCTCCTGAACTATTTATGCAGCTGGTACCACAATACTATTTCAGTAATCTGCCTCCTAGTGAAAGTAA  2120
            |.|.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2026  GCAGTCTCCCCTGAGCTATTTATGCAGCTGGTACCACAGTACTATTTCAGTAACCTGCCTCCTAGTGAAAGCAA  2099

Query 2121  GGACATTCTACAGCAAGTAGTGGATCACCTATCCCCTGTGTCAACAATGAATAAGGAACAGCAAATGTGTGAGA  2194
            ||||||.||||||||||..|..|..||||||.||.|.|   .|||..||||.|||||.|||.|..|||||||.|
Sbjct 2100  GGACATCCTACAGCAAGCTGCAGGCCACCTACCCACAG---AAACTGTGAACAAGGACCAGGATGTGTGTGACA  2170

Query 2195  CGTGCCC---TGAAACTGAACAGAGATGCACTCTCCAG  2229
            .||||||   ||..|||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 2171  AGTGCCCAGATGCTACTGAGCAGAGATGCACAATCCAG  2208