Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_08597
• Subject: XM_017004500.2
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1284
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGCAGAAATCTACAAATTCTGATACTTCCGTGGAAACACTGAATTCTACCCGCCAAGGCACAGGAGCTGTGCA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  AATGAGAATCAAAAATGCCAACAGCCACCATGACAGGCTCAGCCAAAGTAAATCCATGATCCTCACCGATGTCG  148
                                         |||.|||..||      |.|||   || |.||.|..||||     
Sbjct    1  -----------------------------ATGGCAGTTTC------AATAA---CA-GGTCATTGCCGA-----  30

Query  149  GGAAGGTCACTGAACCTATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA  222
                       |||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   31  -----------GAAAAGATATCCAGACACAGAAGGAATCATTCACAGCATATCTTGAAAGATGTCATTCCTCCA  93

Query  223  TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  TTGGAACAACTGATGGTTGAAAAAGAAGGTTATCTGCAAAAAGCTAAAATTGCAGATGGAGGAAAGAAACTAAG  167

Query  297  GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  GAAAAACTGGTCTACTTCCTGGATTGTTCTTTCTAGTCGAAGAATTGAATTTTACAAAGAATCCAAGCAACAGG  241

Query  371  CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CTCTGTCCAATATGAAAACTGGGCACAAACCAGAAAGTGTGGATTTGTGTGGAGCACACATTGAATGGGCCAAG  315

Query  445  GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  GAAAAATCGAGCAGAAAGAATGTCTTTCAGATCACAACAGTATCAGGAAATGAGTTCCTTCTACAGTCAGATAT  389

Query  519  TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  TGACTTCATCATATTGGATTGGTTCCACGCTATCAAAAATGCAATTGACAGATTGCCAAAGGATTCAAGTTGTC  463

Query  593  CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  CATCAAGAAACCTGGAATTATTCAAAATCCAAAGATCCTCTAGCACTGAATTGCTAAGTCACTACGACAGTGAT  537

Query  667  ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  ATAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAATCTTTAATGTTCAGACTGCATCACAGTGCTTCCGATACAAGCGA  611

Query  741  CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  CAAAAATCGAGTTAAAAGCAGATTAAAGAAGTTTATTACCCGAAGACCTTCCCTGAAAACTCTGCAAGAAAAAG  685

Query  815  GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  GACTTATTAAAGATCAAATTTTTGGCTCTCATCTGCACAAAGTGTGTGAACGTGAAAATTCCACAGTTCCGTGG  759

Query  889  TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  TTTGTAAAGCAATGCATTGAAGCTGTTGAGAAAAGAGGTCTAGATGTTGATGGAATATATCGAGTTAGTGGCAA  833

Query  963  TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  TCTGGCAACAATACAGAAGTTAAGATTTATTGTCAACCAAGAAGAGAAGCTGAATTTGGACGACAGCCAGTGGG  907

Query 1037  AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  AGGACATCCACGTTGTCACCGGAGCACTGAAGATGTTTTTCCGGGAGCTGCCTGAGCCGCTCTTCCCTTACAGT  981

Query 1111  TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  TTCTTTGAGCAGTTTGTGGAAGCGATCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAATTGAAGCTGTAAAATCTCTTGT  1055

Query 1185  ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCCCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  ACAAAAACTCCCTCCGCCAAATCGTGACACCATGAAAGTCCTCTTTGGACATCTAACTAAGATAGTGGCCAAAG  1129

Query 1259  CCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  CCTCCAAGAACCTCATGTCCACGCAAAGCTTGGGGATTGTATTTGGACCTACCCTTCTGCGAGCTGAAAATGAA  1203

Query 1333  ACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  ACAGGAAACATGGCGATCCACATGGTCTACCAGAACCAGATAGCTGAGCTCATGCTGAGTGAGTACAGTAAGAT  1277

Query 1407  CTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1425
            |||||||||||||||||||
Sbjct 1278  CTTCGGCTCAGAGGAAGAC  1296